88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1512 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1512  hypothetical protein  100 
 
 		 362 aa  739    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1543  outer membrane protein  76.43 
 
 		 452 aa  398  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.316973  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1563  hypothetical protein  41.03 
 
 		 305 aa  224  2e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000159898  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  47.62 
 
 		 1516 aa  107  4e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1400  putative adhesin  52.33 
 
 		 1916 aa  102  7e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  44 
 
 		 492 aa  79.3  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  32.18 
 
 		 536 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  35.66 
 
 		 1190 aa  75.9  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  35.66 
 
 		 1440 aa  75.9  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  32.39 
 
 		 1390 aa  71.2  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  32.39 
 
 		 2504 aa  70.9  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  28.96 
 
 		 575 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146936 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  42.65 
 
 		 1616 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  37.93 
 
 		 597 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  42.65 
 
 		 1616 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  42.65 
 
 		 1674 aa  62  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  42.65 
 
 		 1616 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  33.88 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  37.93 
 
 		 597 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  42.65 
 
 		 1588 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  37.93 
 
 		 597 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  42.65 
 
 		 1549 aa  62  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0377  YadA-like protein  34.36 
 
 		 423 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.337345  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4028  putative adhesin  42.65 
 
 		 279 aa  62  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  33.85 
 
 		 1072 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  35.42 
 
 		 589 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0790  large adhesin  33.33 
 
 		 3920 aa  59.7  0.00000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  33.33 
 
 		 810 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  34.69 
 
 		 2095 aa  59.3  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  33.33 
 
 		 877 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  43.08 
 
 		 1472 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  43.08 
 
 		 1447 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  43.08 
 
 		 1447 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  46.77 
 
 		 2851 aa  58.2  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  43.08 
 
 		 1342 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0589  hypothetical protein  31.16 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.664865 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  41.54 
 
 		 1446 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  37.38 
 
 		 831 aa  57  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  37.38 
 
 		 831 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  37.38 
 
 		 831 aa  57  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  37.38 
 
 		 816 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  37.38 
 
 		 816 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  37.38 
 
 		 816 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  37.38 
 
 		 820 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  37.38 
 
 		 816 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6865  YadA domain-containing protein  47.06 
 
 		 967 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557127  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  46.77 
 
 		 2396 aa  53.5  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  43.06 
 
 		 716 aa  53.5  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  42.11 
 
 		 1713 aa  53.1  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  36.05 
 
 		 473 aa  52.8  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1408  YadA domain protein  27.14 
 
 		 2078 aa  51.6  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  36.47 
 
 		 655 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0174  YadA domain protein  27.14 
 
 		 2091 aa  51.2  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6824  YadA domain-containing protein  43.55 
 
 		 1417 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335586  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  36.71 
 
 		 1204 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  33.06 
 
 		 1197 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  33.06 
 
 		 1197 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  35.51 
 
 		 898 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  33.06 
 
 		 1197 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  41.67 
 
 		 716 aa  50.4  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0173  YadA domain protein  27.33 
 
 		 2078 aa  50.8  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  36.71 
 
 		 1451 aa  50.4  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0362  YadA domain protein  27.33 
 
 		 2073 aa  50.1  0.00006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0227  YadA domain protein  27.14 
 
 		 2092 aa  49.7  0.00008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1334  YadA domain protein  39.73 
 
 		 565 aa  49.3  0.00009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0301  YadA domain protein  27.14 
 
 		 2075 aa  49.3  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  35.44 
 
 		 1125 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  35.35 
 
 		 472 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0177  YadA domain protein  31.13 
 
 		 1014 aa  48.1  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1485  YadA domain protein  33.04 
 
 		 572 aa  48.5  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0171  YadA domain protein  32 
 
 		 1212 aa  47.8  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1483  YadA domain protein  32.61 
 
 		 1333 aa  47.8  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1234  large adhesin  40.32 
 
 		 4526 aa  47.8  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1487  YadA domain protein  30.67 
 
 		 1813 aa  46.6  0.0007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0533  hypothetical protein  28.97 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  46.94 
 
 		 876 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3524  hemagglutination repeat-containing protein  46.94 
 
 		 878 aa  46.2  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  46.94 
 
 		 880 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6312  surface protein  33.58 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2583  YadA domain-containing protein  31.5 
 
 		 990 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138692  hitchhiker  0.000000000000200862 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1058  large adhesin  45.16 
 
 		 2906 aa  45.1  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1616  large adhesin  30.86 
 
 		 3078 aa  44.7  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1486  YadA domain protein  27.63 
 
 		 1065 aa  44.3  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1154  large adhesin  48.78 
 
 		 3554 aa  43.9  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0209  large adhesin  38.74 
 
 		 5143 aa  43.9  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1846  hypothetical protein  31.25 
 
 		 278 aa  43.9  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  27.78 
 
 		 3192 aa  43.5  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  40.82 
 
 		 1117 aa  43.1  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>