33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1846 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1846  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  531  1e-150  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  51.14 
 
 
2157 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0314  Brp family immunodominant surface antigen  46.15 
 
 
1235 aa  70.9  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3187  putative immunoglobuling-binding protein  34.48 
 
 
369 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.725317  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0311  Brp family immunodominant surface antigen  43.01 
 
 
551 aa  64.3  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0912  adhesin/hemagglutinin  41.94 
 
 
1259 aa  62.4  0.000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.358303  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0086  YadA domain-containing protein  45.83 
 
 
599 aa  62.4  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0072  outer membrane protein  43.02 
 
 
740 aa  60.8  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1563  hypothetical protein  26.79 
 
 
305 aa  59.7  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000159898  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  31.3 
 
 
962 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1858  hypothetical protein  31.06 
 
 
479 aa  59.7  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00264849  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  31.3 
 
 
1012 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  31.3 
 
 
1068 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0071  outer membrane protein  33.58 
 
 
766 aa  58.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1543  outer membrane protein  30.11 
 
 
452 aa  56.6  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.316973  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1512  hypothetical protein  31.25 
 
 
362 aa  56.2  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  31.3 
 
 
1186 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  31.88 
 
 
1072 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  28.51 
 
 
589 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  28.46 
 
 
330 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0790  large adhesin  31.21 
 
 
3920 aa  50.1  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  28.09 
 
 
575 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2809  chromosome segregation ATPase-like protein  27.52 
 
 
2228 aa  48.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2658  conserved hypothetical protein  19.08 
 
 
328 aa  48.1  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0299306  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  27.41 
 
 
536 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2654  hypothetical protein  37.93 
 
 
527 aa  45.4  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.481724  normal  0.288172 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  30.99 
 
 
4191 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1400  putative adhesin  41.54 
 
 
1916 aa  44.7  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1867  YadA domain-containing protein  25.85 
 
 
420 aa  43.9  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.704815 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2301  hypothetical protein  37.5 
 
 
80 aa  43.5  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0909578  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  35.23 
 
 
2141 aa  43.1  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  29.68 
 
 
1613 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0018  Rho termination factor-like  22.14 
 
 
731 aa  42.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>