More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1258 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1258  Patatin  100 
 
 		 283 aa  537  9.999999999999999e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0393654  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0999  patatin  54.48 
 
 		 276 aa  241  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1218  patatin  47.58 
 
 		 288 aa  203  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0148109 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32620  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  50.87 
 
 		 284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.391001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4237  patatin  44.86 
 
 		 301 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.228516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4171  patatin  44.86 
 
 		 301 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.520167  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4393  patatin  44.52 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4686  Patatin  45.96 
 
 		 283 aa  182  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4688  patatin  43 
 
 		 288 aa  178  9e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0469  hypothetical protein  48.87 
 
 		 276 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11080  hypothetical protein  43.38 
 
 		 294 aa  168  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000671536  normal  0.268784 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1869  Patatin  43.43 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2029  patatin  43.15 
 
 		 288 aa  163  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1891  patatin  44.27 
 
 		 296 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0447  patatin  40.26 
 
 		 331 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3330  Patatin  38.81 
 
 		 330 aa  136  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2443  Patatin  40.75 
 
 		 299 aa  129  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1643  Patatin  39.84 
 
 		 271 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0775  patatin  35.9 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2060  patatin  31.13 
 
 		 368 aa  90.9  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7582  Patatin  34.74 
 
 		 331 aa  89.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1045  Patatin  33.46 
 
 		 322 aa  86.3  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0588831  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2164  patatin  35.56 
 
 		 398 aa  85.5  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5830  patatin  31.52 
 
 		 411 aa  82.4  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1198  patatin  34 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0901523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0488  alpha/beta fold family hydrolase  32.93 
 
 		 397 aa  76.3  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.30127  normal  0.0348857 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3528  patatin  31.45 
 
 		 420 aa  74.3  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.372261  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  35.89 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  35.41 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  34.36 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  34.36 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  25 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  31.78 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0785  alpha-beta hydrolase family esterase  34.29 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0921581  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  31.42 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1385  Patatin  31.56 
 
 		 424 aa  66.6  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.858901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  32.86 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  32.86 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  32.86 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  38.12 
 
 		 320 aa  65.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  33.81 
 
 		 302 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  35.07 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  35.07 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  35.07 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  35.07 
 
 		 474 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  35.07 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  32.66 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  34.43 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  31.92 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  30.53 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  34.6 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  33.33 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  32.86 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  33.33 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  30.6 
 
 		 728 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  31.65 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0816  patatin  32.43 
 
 		 413 aa  63.2  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1144  patatin  30.31 
 
 		 411 aa  62.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  34.27 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  33.49 
 
 		 358 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  33.94 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  33.65 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  33.16 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2085  patatin  35.96 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  34.12 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  28.51 
 
 		 741 aa  60.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  34.13 
 
 		 707 aa  60.5  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  32.14 
 
 		 798 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  34.12 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  32.14 
 
 		 796 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  30.45 
 
 		 728 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  30.62 
 
 		 804 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  34.36 
 
 		 347 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  34.36 
 
 		 347 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000473323  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  31.09 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2059  hypothetical protein  27.01 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4598  cyclic nucleotide-binding protein  34.58 
 
 		 581 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649502  normal  0.461096 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0621  patatin  26.94 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3110  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.19 
 
 		 748 aa  57.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185086  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  30.45 
 
 		 728 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1691  patatin  29.41 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  30.56 
 
 		 751 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  30.56 
 
 		 728 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4153  Patatin  31.31 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279461  normal  0.153113 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  30.5 
 
 		 790 aa  56.6  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  34.69 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  29.8 
 
 		 320 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  30.77 
 
 		 728 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  29.08 
 
 		 263 aa  57  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  29.8 
 
 		 320 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  31.4 
 
 		 813 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  30.35 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2490  Patatin  33.5 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  31.07 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  28.72 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2182  patatin  29.67 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000772751  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  32.57 
 
 		 803 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  28.04 
 
 		 343 aa  55.8  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  31.25 
 
 		 803 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  32.57 
 
 		 803 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>