More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2439 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 379 aa  758    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000851177  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1651  secretion protein HlyD  54.64 
 
 		 407 aa  391  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.986785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1610  RND family efflux transporter MFP subunit  55.59 
 
 		 394 aa  352  8e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.665479  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2372  RND family efflux transporter MFP subunit  49.18 
 
 		 395 aa  334  1e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.7 
 
 		 440 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0064  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.29 
 
 		 377 aa  292  8e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0450  RND family efflux transporter MFP subunit  41.91 
 
 		 407 aa  291  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.825026 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0900  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.08 
 
 		 384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000108273  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2499  RND family efflux transporter MFP subunit  44.14 
 
 		 416 aa  271  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2957  secretion protein HlyD  43.81 
 
 		 389 aa  260  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0178504  normal  0.933874 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1596  RND family efflux transporter MFP subunit  40.3 
 
 		 398 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.566633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1169  RND family efflux transporter MFP subunit  38.39 
 
 		 389 aa  243  5e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.567946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2202  RND family efflux transporter MFP subunit  39.94 
 
 		 407 aa  239  5.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1530  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.85 
 
 		 391 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1788  RND family efflux transporter MFP subunit  44.19 
 
 		 383 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1266  secretion protein HlyD  39.63 
 
 		 411 aa  232  6e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.279661  normal  0.224738 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28820  secretion protein, HlyD family  42.98 
 
 		 441 aa  231  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20411  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1510  secretion protein HlyD  35.6 
 
 		 395 aa  228  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0736  RND family efflux transporter MFP subunit  37.82 
 
 		 387 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2753  HlyD family secretion protein  36.93 
 
 		 444 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03141  putative resistance transmembrane protein  38.39 
 
 		 449 aa  222  7e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3395  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.96 
 
 		 389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2065  secretion protein HlyD  38.63 
 
 		 454 aa  219  5e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.309375  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1857  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.44 
 
 		 372 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.55 
 
 		 462 aa  219  7e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03982  membrane fusion protein  39.17 
 
 		 414 aa  219  7e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.55 
 
 		 462 aa  219  7e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2521  secretion protein HlyD  38.58 
 
 		 435 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3537  putative component of multidrug efflux pump, mdtA-like protein  37.36 
 
 		 389 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31870  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  37.43 
 
 		 426 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2708  RND efflux membrane fusion protein precursor  37.43 
 
 		 426 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0286088  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2482  secretion protein HlyD  37.54 
 
 		 434 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179732  normal  0.227362 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1942  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.15 
 
 		 372 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.547654  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2702  multidrug efflux system subunit MdtA  35.88 
 
 		 411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.04 
 
 		 455 aa  215  9e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416467  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2902  secretion protein HlyD  39.52 
 
 		 464 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.56576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2803  secretion protein HlyD  37.97 
 
 		 376 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.602838  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0346  RND family efflux transporter MFP subunit  39.63 
 
 		 360 aa  214  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.499232  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2684  multidrug efflux system subunit MdtA  33.95 
 
 		 411 aa  213  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1523  secretion protein HlyD  37.37 
 
 		 457 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.116484 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1206  multidrug efflux system subunit MdtA  35.95 
 
 		 419 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0570202  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2966  multidrug efflux system subunit MdtA  36.23 
 
 		 413 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.874422  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0732  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.1 
 
 		 440 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4556  RND family efflux transporter MFP subunit  36.78 
 
 		 383 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589535  normal  0.76991 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0601  secretion protein HlyD  38.87 
 
 		 459 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251315  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2802  RND family efflux transporter MFP subunit  38.79 
 
 		 430 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.662741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.95 
 
 		 455 aa  213  4.9999999999999996e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.568711  normal  0.749765 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1369  membrane fusion protein MdtA  37.23 
 
 		 445 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1501  HlyD family secretion protein  37.43 
 
 		 445 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310778  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1364  membrane fusion protein MdtA  37.23 
 
 		 442 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.284522  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2757  secretion protein HlyD  38.29 
 
 		 376 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220243  normal  0.336362 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1312  multidrug efflux system subunit MdtA  35.93 
 
 		 410 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164615  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1577  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.94 
 
 		 434 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2569  secretion protein HlyD  37.23 
 
 		 462 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.103631 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3604  secretion protein HlyD  35.16 
 
 		 422 aa  211  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105186  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1971  secretion protein HlyD  36.69 
 
 		 362 aa  210  3e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2021  secretion protein HlyD  44.61 
 
 		 373 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.508004  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.67 
 
 		 388 aa  210  4e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.479598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2558  secretion protein HlyD  36.26 
 
 		 451 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2907  RND efflux system membrane fusion protein  38.21 
 
 		 433 aa  209  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484522  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2186  RND family efflux transporter MFP subunit  38.82 
 
 		 435 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3689  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.71 
 
 		 414 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3585  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.75 
 
 		 435 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3424  secretion protein HlyD  38.12 
 
 		 412 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3932  multidrug resistance protein mdtA precursor  36.44 
 
 		 473 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.416339 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3252  RND family efflux transporter MFP subunit  39.43 
 
 		 431 aa  206  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4319  RND family efflux transporter MFP subunit  35.23 
 
 		 460 aa  206  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0569861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2329  RND family efflux transporter MFP subunit  38.12 
 
 		 436 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.4455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1771  RND family efflux transporter MFP subunit  37.65 
 
 		 469 aa  206  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.75905 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3552  multidrug efflux system subunit MdtA  34.87 
 
 		 413 aa  205  8e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0533  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.14 
 
 		 381 aa  205  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5556  HlyD family secretion protein  35.41 
 
 		 460 aa  205  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357056  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01979  multidrug efflux system, subunit A  33.89 
 
 		 415 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01971  hypothetical protein  33.89 
 
 		 415 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1549  membrane fusion protein precursor  36.99 
 
 		 411 aa  204  2e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2866  HlyD family secretion protein  36.93 
 
 		 576 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1215  multidrug efflux system subunit MdtA  34.6 
 
 		 444 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2497  secretion protein HlyD  38.05 
 
 		 376 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0156219  normal  0.535826 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3103  multidrug efflux system subunit MdtA  34.6 
 
 		 427 aa  204  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1332  multidrug efflux system subunit MdtA  34.6 
 
 		 444 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.713792  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1231  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.81 
 
 		 426 aa  204  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2366  multidrug efflux system subunit MdtA  33.61 
 
 		 415 aa  203  5e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2670  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  35.28 
 
 		 426 aa  203  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.768547  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1080  RND family efflux transporter MFP subunit  36.45 
 
 		 457 aa  203  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2530  RND family efflux transporter MFP subunit  35.28 
 
 		 412 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1080  RND family efflux transporter MFP subunit  36.45 
 
 		 463 aa  203  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.61 
 
 		 415 aa  202  6e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0117238  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0986  multidrug efflux system subunit MdtA  33.89 
 
 		 415 aa  202  6e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3014  multidrug efflux system subunit MdtA  33.61 
 
 		 415 aa  202  6e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.105913 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1159  multidrug efflux system subunit MdtA  33.61 
 
 		 415 aa  202  6e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2216  multidrug efflux system subunit MdtA  33.61 
 
 		 415 aa  202  6e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4166  RND family efflux transporter MFP subunit  37.46 
 
 		 427 aa  202  7e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1567  multidrug efflux system subunit MdtA  33.61 
 
 		 455 aa  202  8e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.331208 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2104  RND family efflux transporter MFP subunit  36.28 
 
 		 450 aa  202  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1418  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  34.97 
 
 		 425 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1643  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  34.97 
 
 		 414 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0226554  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2144  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  34.97 
 
 		 412 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.254489  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2094  RND family efflux transporter MFP subunit  39.16 
 
 		 377 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0888739  normal  0.0111779 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1198  RND family efflux transporter MFP subunit  36.14 
 
 		 457 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495254  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3170  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  34.97 
 
 		 412 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>