More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3204 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  100 
 
 		 225 aa  448  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  95.56 
 
 		 225 aa  404  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  66.67 
 
 		 217 aa  295  5e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  64.29 
 
 		 213 aa  278  4e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  62.86 
 
 		 213 aa  273  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  60.58 
 
 		 212 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  59.91 
 
 		 219 aa  264  8e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  59.59 
 
 		 216 aa  236  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  50.96 
 
 		 215 aa  201  8e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  54.4 
 
 		 214 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  44.02 
 
 		 204 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  51.32 
 
 		 211 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  53.93 
 
 		 224 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  52.36 
 
 		 215 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  48.17 
 
 		 203 aa  186  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  51.05 
 
 		 212 aa  185  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  45.97 
 
 		 210 aa  185  6e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3110  dTMP kinase  48.77 
 
 		 209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.2545  normal  0.244995 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  48.33 
 
 		 230 aa  181  7e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  43.37 
 
 		 206 aa  181  8.000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  43.12 
 
 		 209 aa  181  9.000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  51.85 
 
 		 210 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0498  dTMP kinase  44.98 
 
 		 236 aa  180  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  47.64 
 
 		 207 aa  180  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  48.31 
 
 		 688 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  50.26 
 
 		 208 aa  179  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  46.15 
 
 		 207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  46.07 
 
 		 211 aa  179  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  46.35 
 
 		 216 aa  178  7e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  47.09 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  43.6 
 
 		 217 aa  176  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  46.6 
 
 		 223 aa  175  4e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  49.48 
 
 		 202 aa  175  6e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  50.26 
 
 		 205 aa  175  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  49.74 
 
 		 210 aa  174  7e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  50.26 
 
 		 210 aa  174  8e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  50.79 
 
 		 210 aa  174  8e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  47.64 
 
 		 207 aa  174  8e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  47.42 
 
 		 221 aa  174  9e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  48.97 
 
 		 240 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  45.6 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  49.21 
 
 		 686 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  49.74 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  41.96 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  41.31 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  46.67 
 
 		 211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  44.34 
 
 		 901 aa  172  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  47.34 
 
 		 233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  49.21 
 
 		 210 aa  170  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  44.76 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  49.74 
 
 		 210 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1464  thymidylate kinase  50 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  41.94 
 
 		 215 aa  169  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  48.15 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  47.62 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  47.62 
 
 		 688 aa  169  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  45.41 
 
 		 671 aa  169  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  48.17 
 
 		 210 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  48.17 
 
 		 210 aa  168  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  44.24 
 
 		 230 aa  167  8e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  50.82 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  44.88 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  44.86 
 
 		 705 aa  167  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  44.86 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  42.79 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  45.27 
 
 		 205 aa  166  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  45.88 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  47.4 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4102  thymidylate kinase  43.06 
 
 		 226 aa  165  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808086  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  49.21 
 
 		 225 aa  165  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  44.62 
 
 		 222 aa  166  4e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  44.9 
 
 		 217 aa  165  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  50.26 
 
 		 211 aa  166  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  47.89 
 
 		 207 aa  165  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  43.75 
 
 		 208 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  46.28 
 
 		 232 aa  165  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  46.43 
 
 		 226 aa  165  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  44.81 
 
 		 225 aa  165  5.9999999999999996e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  46.03 
 
 		 226 aa  165  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0128  dTMP kinase  52.36 
 
 		 217 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630862  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  42.56 
 
 		 213 aa  164  8e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  40.48 
 
 		 210 aa  164  9e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  46.95 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  39.51 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  41.67 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1145  thymidylate kinase  47.29 
 
 		 244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.446337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  43.98 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  46.81 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  41.23 
 
 		 214 aa  162  3e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  42.41 
 
 		 213 aa  163  3e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  45.79 
 
 		 703 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3591  thymidylate kinase  44.33 
 
 		 214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.389295 
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  41.4 
 
 		 207 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  41.23 
 
 		 211 aa  162  5.0000000000000005e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  44.79 
 
 		 217 aa  162  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  44.79 
 
 		 217 aa  162  6e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  45.79 
 
 		 244 aa  162  6e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  42.93 
 
 		 208 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  45.5 
 
 		 686 aa  161  9e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  43.94 
 
 		 225 aa  161  9e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>