More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1489 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1489  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
212 aa  435  1e-121  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1606  TetR family transcriptional regulator  46.92 
 
 
225 aa  213  2e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.912424  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0337  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 
204 aa  119  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1939  transcriptional regulator, TetR family  37.02 
 
 
206 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.640559  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
215 aa  99  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4031  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 
203 aa  96.7  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4628  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 
206 aa  94.7  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  9.55982e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  30.69 
 
 
203 aa  93.6  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2627  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 
202 aa  92  5e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  1.08473e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25680  transcriptional regulator  29.69 
 
 
203 aa  92.4  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28270  transcriptional regulator  31.58 
 
 
205 aa  87.8  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.188874 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0339  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 
205 aa  83.6  2e-15  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  39.57 
 
 
197 aa  83.2  2e-15  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2311  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 
235 aa  82  6e-15  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2316  transcriptional regulator, TetR family  30.35 
 
 
220 aa  81.6  7e-15  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.166278  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0312  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 
203 aa  79.7  3e-14  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.041978  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27950  transcriptional regulator  27.36 
 
 
207 aa  77  2e-13  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00827834  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1953  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
213 aa  70.9  1e-11  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.957288  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  30.35 
 
 
209 aa  69.3  4e-11  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0820  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
219 aa  67  2e-10  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0110693  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03670  transcriptional regulator  31.21 
 
 
230 aa  62  6e-09  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00912022  hitchhiker  0.0085588 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0312  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 
206 aa  57.8  1e-07  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  3.80117e-09  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  52.73 
 
 
215 aa  55.8  4e-07  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  52.73 
 
 
215 aa  56.2  4e-07  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  52.73 
 
 
215 aa  55.8  4e-07  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  52.73 
 
 
215 aa  55.8  4e-07  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  52.73 
 
 
215 aa  55.8  4e-07  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  52.73 
 
 
215 aa  55.8  4e-07  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  52.73 
 
 
215 aa  55.8  4e-07  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  52.73 
 
 
215 aa  55.8  4e-07  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  52.73 
 
 
215 aa  55.8  4e-07  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 
197 aa  55.8  5e-07  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
215 aa  55.1  7e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5130  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 
203 aa  54.3  1e-06  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943479  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2005  hypothetical protein  26.11 
 
 
184 aa  54.7  1e-06  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0591138  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 
209 aa  53.5  2e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3008  transcriptional regulator, TetR family  26.61 
 
 
215 aa  53.9  2e-06  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
222 aa  53.5  2e-06  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 
192 aa  53.9  2e-06  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
206 aa  53.1  3e-06  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 
216 aa  53.1  3e-06  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
218 aa  52.8  4e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 
324 aa  52.4  5e-06  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
205 aa  52.4  5e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 
212 aa  52.4  5e-06  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  48.15 
 
 
217 aa  52.4  6e-06  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
196 aa  52  6e-06  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
200 aa  51.6  8e-06  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 
216 aa  51.6  8e-06  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  47.17 
 
 
213 aa  51.2  1e-05  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2910  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
215 aa  50.8  1e-05  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
191 aa  51.2  1e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 
200 aa  51.2  1e-05  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1938  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 
226 aa  50.8  1e-05  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165177  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2880  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
187 aa  51.2  1e-05  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.924779 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  34.78 
 
 
186 aa  51.2  1e-05  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
200 aa  51.2  1e-05  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 
183 aa  50.4  2e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  48.15 
 
 
217 aa  50.4  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 
200 aa  50.4  2e-05  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  48.15 
 
 
217 aa  50.4  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  48.15 
 
 
217 aa  50.4  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  48.15 
 
 
217 aa  50.1  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
257 aa  50.4  2e-05  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  48.15 
 
 
217 aa  50.4  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 
255 aa  50.8  2e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
335 aa  50.4  2e-05  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  5.05732e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2902  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
187 aa  50.8  2e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.465511  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4341  putative transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 
210 aa  50.1  2e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.13823  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2626  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 
188 aa  50.1  2e-05  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2810  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 
187 aa  50.4  2e-05  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3518  regulatory protein, TetR  37.31 
 
 
215 aa  50.1  2e-05  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640434  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  38.89 
 
 
196 aa  49.7  3e-05  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
238 aa  49.7  3e-05  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
196 aa  49.7  3e-05  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  38.89 
 
 
196 aa  50.1  3e-05  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  38.89 
 
 
192 aa  49.7  3e-05  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  38.89 
 
 
195 aa  50.1  3e-05  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 
204 aa  49.7  3e-05  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
234 aa  49.7  3e-05  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  38.89 
 
 
196 aa  50.1  3e-05  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2057  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 
212 aa  49.7  3e-05  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106608  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 
212 aa  49.7  3e-05  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  38.89 
 
 
196 aa  49.7  3e-05  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 
192 aa  49.7  3e-05  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 
205 aa  49.7  3e-05  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0320964 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  38.89 
 
 
196 aa  49.7  3e-05  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 
192 aa  49.7  3e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  31.2 
 
 
208 aa  49.3  4e-05  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3723  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 
187 aa  49.3  4e-05  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  1.34359e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5551  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 
203 aa  49.3  4e-05  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.1306  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 
207 aa  48.9  5e-05  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0298  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
198 aa  49.3  5e-05  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  38.46 
 
 
198 aa  48.9  5e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6328  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 
199 aa  48.9  5e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00138827  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 
196 aa  48.9  5e-05  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 
200 aa  48.9  6e-05  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1426  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 
190 aa  48.9  6e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.620095 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 
213 aa  48.5  6e-05  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  47.83 
 
 
190 aa  48.9  6e-05  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>