More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0337 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0337  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 204 aa  420  1e-117  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1939  transcriptional regulator, TetR family  42.5 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.640559  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4031  transcriptional regulator, TetR family  38.34 
 
 		 203 aa  141  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4628  transcriptional regulator, TetR family  41 
 
 		 206 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000955982  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0339  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 205 aa  139  3.9999999999999997e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  36 
 
 		 203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0312  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 203 aa  124  8.000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.041978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2311  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1489  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27950  transcriptional regulator  35.78 
 
 		 207 aa  118  4.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00827834  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1606  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.912424  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2627  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 202 aa  112  5e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108473  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2316  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.166278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25680  transcriptional regulator  29.95 
 
 		 203 aa  106  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03670  transcriptional regulator  30.62 
 
 		 230 aa  98.2  7e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00912022  hitchhiker  0.0085588 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  32.66 
 
 		 197 aa  92.8  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2005  hypothetical protein  29.55 
 
 		 184 aa  91.7  7e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0591138  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28270  transcriptional regulator  28.85 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.188874 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  28.28 
 
 		 209 aa  84.7  8e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0820  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0110693  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1953  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.957288  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0312  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000380117  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3241  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1181  TetR family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0030  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 238 aa  52.4  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  47.37 
 
 		 219 aa  52  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 198 aa  52  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 223 aa  52  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 234 aa  52  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  39.08 
 
 		 197 aa  51.6  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 226 aa  51.2  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4331  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 244 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3439  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 239 aa  50.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 242 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 257 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3493  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729173  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 385 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1569  putative transcriptional regulator  45.61 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  47.27 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  47.17 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3008  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 215 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  47.27 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  47.27 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  47.27 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  47.27 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  47.27 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  40 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>