More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0100 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  100 
 
 
233 aa  471  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  54.07 
 
 
221 aa  211  5.999999999999999e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  49.33 
 
 
207 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  43.67 
 
 
212 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  49.2 
 
 
213 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  46.88 
 
 
213 aa  179  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  46.64 
 
 
216 aa  179  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  51.37 
 
 
217 aa  179  4e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  53.23 
 
 
207 aa  178  8e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  44.93 
 
 
207 aa  177  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  54.3 
 
 
210 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  49.46 
 
 
206 aa  175  5e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  41.15 
 
 
217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  51.34 
 
 
219 aa  171  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  45.79 
 
 
210 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  43.56 
 
 
203 aa  170  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  42.01 
 
 
204 aa  169  4e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  47.59 
 
 
214 aa  169  5e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  42.86 
 
 
205 aa  168  8e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5281  thymidylate kinase  43.56 
 
 
208 aa  167  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0025  thymidylate kinase  43.56 
 
 
208 aa  167  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0035  thymidylate kinase  43.56 
 
 
208 aa  167  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0029  thymidylate kinase  43.56 
 
 
208 aa  166  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0026  thymidylate kinase  43.56 
 
 
208 aa  166  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0026  thymidylate kinase  43.56 
 
 
208 aa  166  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  41.63 
 
 
211 aa  166  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0027  thymidylate kinase  43.56 
 
 
208 aa  166  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0035  thymidylate kinase  43.56 
 
 
208 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  48.11 
 
 
213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  44.5 
 
 
225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  45.79 
 
 
213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0039  thymidylate kinase  43.56 
 
 
208 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  47.4 
 
 
215 aa  166  4e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0028  thymidylate kinase  43.11 
 
 
208 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  47.06 
 
 
212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  40.89 
 
 
215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  46.32 
 
 
211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  40.35 
 
 
219 aa  162  3e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  42.67 
 
 
208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  43.11 
 
 
671 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  41.67 
 
 
215 aa  161  6e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  40.27 
 
 
217 aa  161  7e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  43.23 
 
 
214 aa  161  9e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  41.7 
 
 
234 aa  161  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  39.91 
 
 
225 aa  160  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  44.89 
 
 
686 aa  160  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  43.75 
 
 
686 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  41.96 
 
 
223 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  41.52 
 
 
223 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  43.24 
 
 
213 aa  160  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  44.93 
 
 
211 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  45.33 
 
 
688 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  42.22 
 
 
224 aa  159  4e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  41.63 
 
 
210 aa  158  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  41.07 
 
 
216 aa  158  8e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  40.44 
 
 
234 aa  157  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  43.66 
 
 
214 aa  158  9e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  41.74 
 
 
234 aa  157  1e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  43.52 
 
 
703 aa  156  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  45.33 
 
 
209 aa  157  2e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  41.96 
 
 
705 aa  156  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  43.52 
 
 
212 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  40.85 
 
 
211 aa  156  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09210  thymidylate kinase  45.03 
 
 
295 aa  156  3e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0808366 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  41.47 
 
 
212 aa  155  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  44.24 
 
 
901 aa  155  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  41.94 
 
 
210 aa  155  6e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  41.23 
 
 
209 aa  155  7e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  48.13 
 
 
225 aa  154  9e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  43.16 
 
 
209 aa  154  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  47.59 
 
 
225 aa  154  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  40.28 
 
 
236 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  41.18 
 
 
210 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  41.63 
 
 
210 aa  154  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  44.62 
 
 
213 aa  154  1e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  44.44 
 
 
707 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  46.6 
 
 
223 aa  154  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0120  thymidylate kinase  43.46 
 
 
203 aa  154  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  41.04 
 
 
211 aa  154  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  42.67 
 
 
210 aa  152  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0503  thymidylate kinase  42.73 
 
 
205 aa  152  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0516  thymidylate kinase  42.73 
 
 
205 aa  152  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136123  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  43.01 
 
 
226 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  41.07 
 
 
243 aa  152  5.9999999999999996e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  44.02 
 
 
222 aa  151  5.9999999999999996e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  42.25 
 
 
203 aa  151  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  44.39 
 
 
225 aa  151  7e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  41.26 
 
 
232 aa  151  8.999999999999999e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  43.19 
 
 
210 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  42.72 
 
 
210 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  46.03 
 
 
202 aa  150  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  43.55 
 
 
217 aa  150  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  37.95 
 
 
219 aa  150  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0033  dTMP kinase  41.15 
 
 
206 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02021  thymidylate kinase  50.9 
 
 
211 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.409154  normal  0.831835 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1496  thymidylate kinase  50.3 
 
 
211 aa  149  3e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0919131  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  40.62 
 
 
225 aa  149  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  40.81 
 
 
208 aa  149  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  42.25 
 
 
218 aa  149  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  40.62 
 
 
688 aa  149  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>