More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0002 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0002  DNA polymerase III, beta subunit  100 
 
 		 367 aa  740    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.226085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0002  DNA polymerase III, beta subunit  47.41 
 
 		 365 aa  341  1e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.610199  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0002  DNA polymerase III, beta subunit  43.97 
 
 		 367 aa  288  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0002  DNA polymerase III, beta subunit  36.32 
 
 		 389 aa  248  1e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.105928  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0002  DNA polymerase III subunit beta  35.62 
 
 		 379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0872061  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.62 
 
 		 379 aa  243  3e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0002  DNA polymerase III subunit beta  35.62 
 
 		 379 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.62 
 
 		 379 aa  242  7e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00656712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.62 
 
 		 379 aa  242  7e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.478099 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0002  DNA polymerase III subunit beta  35.62 
 
 		 379 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.62 
 
 		 379 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0132884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.43 
 
 		 381 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000678483  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5318  DNA polymerase III subunit beta  34.91 
 
 		 381 aa  240  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.00172021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0002  DNA polymerase III subunit beta  34.91 
 
 		 381 aa  240  4e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000341772  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.91 
 
 		 381 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0002  DNA polymerase III subunit beta  40.28 
 
 		 366 aa  239  8e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.039801  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.85 
 
 		 370 aa  238  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.71 
 
 		 378 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167002  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2552  DNA polymerase III subunit beta  35.81 
 
 		 377 aa  236  4e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0587336  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2372  DNA polymerase III subunit beta  36.76 
 
 		 366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0003  DNA polymerase III, beta subunit  34.13 
 
 		 374 aa  234  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00459981  hitchhiker  0.00000116577 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00020  DNA polymerase III, beta subunit  35.33 
 
 		 367 aa  231  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.75 
 
 		 377 aa  230  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00213885  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.75 
 
 		 377 aa  230  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0177596  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.24 
 
 		 366 aa  220  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.279408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.24 
 
 		 366 aa  220  3e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.316057  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1551  DNA polymerase III, beta subunit  34.59 
 
 		 367 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.422589  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0953  DNA polymerase III, beta subunit  30.05 
 
 		 374 aa  213  3.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.06 
 
 		 378 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.27 
 
 		 369 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2706  DNA polymerase III subunit beta  35.62 
 
 		 376 aa  205  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2604  DNA polymerase III subunit beta  34.56 
 
 		 376 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.756021  hitchhiker  0.0000491978 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0002  DNA polymerase sliding clamp subunit  32.71 
 
 		 376 aa  202  9e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000188302  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2456  DNA polymerase III subunit beta  33.77 
 
 		 376 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0115889  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.69 
 
 		 370 aa  199  6e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  33.42 
 
 		 372 aa  199  9e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2720  DNA polymerase III subunit beta  32.19 
 
 		 376 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.001463  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0993  DNA polymerase III, beta subunit  29.68 
 
 		 376 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2430  DNA polymerase III subunit beta  33.16 
 
 		 376 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000841235  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2699  DNA polymerase III subunit beta  33.16 
 
 		 376 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000020623 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2499  DNA polymerase III subunit beta  33.16 
 
 		 376 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000103767  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  32.36 
 
 		 372 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000259068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2684  DNA polymerase III subunit beta  33.16 
 
 		 376 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1227  DNA polymerase III, beta subunit  27.66 
 
 		 378 aa  196  6e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000128167  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  31.61 
 
 		 366 aa  196  6e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1009  DNA polymerase III, beta subunit  27.66 
 
 		 378 aa  196  7e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000512645  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.72 
 
 		 370 aa  195  9e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000729086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1036  DNA polymerase III, beta subunit  27.13 
 
 		 378 aa  194  1e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000328779  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0002  DNA-directed DNA polymerase  35.09 
 
 		 409 aa  195  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2750  DNA polymerase III subunit beta  33.16 
 
 		 376 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1278  DNA polymerase III subunit beta  30.65 
 
 		 373 aa  194  2e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  unclonable  2.76035e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.98 
 
 		 375 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3235  DNA polymerase III, beta subunit  31.89 
 
 		 374 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0867918 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.98 
 
 		 375 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.98 
 
 		 375 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2460  DNA polymerase III subunit beta  33.16 
 
 		 376 aa  192  6e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000810658  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.3 
 
 		 379 aa  192  7e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.84 
 
 		 372 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.03 
 
 		 372 aa  192  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.474691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4329  DNA polymerase III subunit beta  30.29 
 
 		 372 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0749  DNA polymerase III, beta subunit  29.41 
 
 		 377 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00160623  normal  0.0661529 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.57 
 
 		 372 aa  190  4e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.205747 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.57 
 
 		 372 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.120269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.48 
 
 		 374 aa  189  5e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.017071  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.3 
 
 		 372 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0351  DNA polymerase III subunit beta  29.57 
 
 		 412 aa  189  8e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.69 
 
 		 373 aa  188  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0861969  hitchhiker  0.000000929484 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  29.07 
 
 		 372 aa  188  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0003  DNA polymerase III subunit beta  28.95 
 
 		 373 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.920378 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2834  DNA polymerase III subunit beta  28.69 
 
 		 372 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3543  DNA polymerase III subunit beta  29.57 
 
 		 372 aa  187  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2082  DNA polymerase IF1 subunit beta  30.11 
 
 		 382 aa  187  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0161872  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0003  DNA polymerase III, beta subunit  29.62 
 
 		 366 aa  186  4e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000553224  hitchhiker  0.000000389013 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  30.21 
 
 		 372 aa  186  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  27.15 
 
 		 375 aa  186  6e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000418991  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0001  DNA polymerase III subunit beta  28.01 
 
 		 385 aa  186  8e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.392011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0001  DNA polymerase III subunit beta  30.73 
 
 		 390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.174171  normal  0.105878 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0003  DNA polymerase III subunit beta  28.69 
 
 		 373 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  0.512948 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.35 
 
 		 376 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.69 
 
 		 373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4406  DNA polymerase III, beta subunit  29.71 
 
 		 377 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4592  DNA polymerase III subunit beta  29.41 
 
 		 372 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0352599 
 
 
-
 
NC_004310  BR0002  DNA polymerase III subunit beta  29.84 
 
 		 397 aa  183  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41342  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.68 
 
 		 372 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0002  DNA polymerase III subunit beta  30.38 
 
 		 372 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0001  DNA polymerase III subunit beta  31.25 
 
 		 385 aa  183  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2239  DNA polymerase III subunit beta  28.69 
 
 		 373 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0102545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0002  DNA polymerase III, beta subunit  29.21 
 
 		 380 aa  182  6e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.23 
 
 		 372 aa  182  9.000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0730917  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  31.56 
 
 		 373 aa  182  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00126039  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.57 
 
 		 397 aa  181  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00789927  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0004  DNA polymerase III subunit beta  29.84 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.638398  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.07 
 
 		 373 aa  181  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0966551  normal  0.572668 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3374  DNA polymerase III subunit beta  27.69 
 
 		 372 aa  181  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.69 
 
 		 373 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0002  DNA polymerase III subunit beta  29.3 
 
 		 372 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0012  DNA polymerase III subunit beta  29.68 
 
 		 372 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1343  DNA polymerase III subunit beta  29.68 
 
 		 372 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0002  DNA polymerase III subunit beta  28.34 
 
 		 372 aa  179  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.142435  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00001  DNA polymerase III subunit beta  30.55 
 
 		 385 aa  179  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.280893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>