238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2570 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2570  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 984 aa  2011    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  23.14 
 
 		 935 aa  140  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1725  nuclease SbcCD, C subunit, putative  27.37 
 
 		 813 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.536729  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  31.94 
 
 		 987 aa  105  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  27.65 
 
 		 987 aa  104  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1375  DNA repair ATPase  29.38 
 
 		 814 aa  102  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000366162  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2343  SMC domain protein  31.25 
 
 		 912 aa  88.6  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  20.13 
 
 		 994 aa  85.5  0.000000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  25.13 
 
 		 924 aa  84.3  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  26.69 
 
 		 895 aa  80.5  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  25 
 
 		 902 aa  79  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  33.1 
 
 		 1021 aa  74.7  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  24.25 
 
 		 891 aa  73.2  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  25.77 
 
 		 864 aa  70.5  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  19.46 
 
 		 1019 aa  69.3  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  24.4 
 
 		 993 aa  67.8  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  23.49 
 
 		 993 aa  67.4  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  27.43 
 
 		 891 aa  65.9  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  26.38 
 
 		 702 aa  65.9  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2009  hypothetical protein  26.13 
 
 		 922 aa  65.9  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  22.99 
 
 		 993 aa  65.9  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  21.21 
 
 		 1074 aa  65.1  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0018  SMC domain protein  37.36 
 
 		 862 aa  60.8  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0623828 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0005  recombination protein F  38.2 
 
 		 377 aa  60.1  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000288317  hitchhiker  0.00404548 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  23.93 
 
 		 890 aa  58.9  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0004  recombination protein F  37.08 
 
 		 376 aa  57.4  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366352  unclonable  0.0000000175389 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  25.23 
 
 		 700 aa  57.8  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  26.94 
 
 		 702 aa  57.8  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00345  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  26.82 
 
 		 1048 aa  57  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3212  exonuclease SbcC  26.82 
 
 		 1048 aa  57  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223053  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0472  exonuclease subunit SbcC  26.82 
 
 		 1047 aa  57  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00349  hypothetical protein  26.82 
 
 		 1048 aa  57  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0424  exonuclease subunit SbcC  26.82 
 
 		 1047 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0464  exonuclease subunit SbcC  26.82 
 
 		 1047 aa  57  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  23.34 
 
 		 1185 aa  57  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  26.82 
 
 		 1047 aa  57  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0316  exonuclease subunit SbcC  26.82 
 
 		 1047 aa  57  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.53041  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  24.93 
 
 		 1019 aa  55.5  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0426  exonuclease subunit SbcC  26.36 
 
 		 1047 aa  55.5  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.442969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.21 
 
 		 380 aa  54.7  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  22.77 
 
 		 789 aa  53.5  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  25.53 
 
 		 1003 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  23.76 
 
 		 888 aa  53.5  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.68 
 
 		 485 aa  52.8  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0432  exonuclease subunit SbcC  25.91 
 
 		 1046 aa  52.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0451  exonuclease subunit SbcC  26.36 
 
 		 1046 aa  52  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1074  ABC transporter related  40 
 
 		 252 aa  52  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.281919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0433  exonuclease subunit SbcC  26.36 
 
 		 1046 aa  52  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  36.79 
 
 		 1016 aa  51.6  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0493  exonuclease subunit SbcC  26.36 
 
 		 1046 aa  52  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0438  exonuclease subunit SbcC  26.36 
 
 		 1046 aa  52  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1145  chromosome segregation protein SMC  38.46 
 
 		 1263 aa  51.6  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00888217 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  32.77 
 
 		 1211 aa  52  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  34.44 
 
 		 634 aa  51.6  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  26.44 
 
 		 858 aa  51.2  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.77 
 
 		 401 aa  50.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0234523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3597  chromosome segregation protein SMC  36.92 
 
 		 1222 aa  50.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  24.47 
 
 		 702 aa  50.8  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0855  SMC domain protein  31.07 
 
 		 802 aa  51.2  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128097  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.69 
 
 		 379 aa  51.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0005  DNA replication and repair protein RecF  33.33 
 
 		 401 aa  50.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  27.27 
 
 		 1134 aa  50.8  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0854  ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 		 534 aa  50.1  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.77 
 
 		 398 aa  50.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4561  exonuclease SbcC  26.15 
 
 		 1007 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0003  DNA replication and repair protein RecF  35.06 
 
 		 415 aa  50.1  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000951254  normal  0.107465 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1300  SMC domain-containing protein  34.07 
 
 		 852 aa  49.7  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.975813  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1637  SMC domain-containing protein  30.26 
 
 		 795 aa  50.1  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0004  recombination protein F  29.87 
 
 		 371 aa  50.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00656338  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  26.87 
 
 		 339 aa  49.7  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.47 
 
 		 377 aa  49.3  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.780515  decreased coverage  0.00205006 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.21 
 
 		 457 aa  49.7  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470302 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00040  DNA replication and repair protein RecF  29.7 
 
 		 414 aa  49.7  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1155  SMC domain-containing protein  34.07 
 
 		 852 aa  49.7  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1155  ABC transporter related  27.04 
 
 		 266 aa  48.9  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01100  telomere maintenance protein, putative  35.62 
 
 		 1289 aa  49.3  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.28116  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  30.1 
 
 		 1174 aa  49.3  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1773  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  27.04 
 
 		 264 aa  49.3  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53629  DNA repair protein  37.5 
 
 		 1306 aa  49.3  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.440366 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4289  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  27.04 
 
 		 266 aa  48.9  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.960923 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0698  ABC transporter related  27.04 
 
 		 274 aa  48.9  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26151  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1177  ABC transporter related  27.04 
 
 		 274 aa  48.9  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.68 
 
 		 378 aa  48.9  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  27.07 
 
 		 693 aa  48.9  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  22.22 
 
 		 1187 aa  48.9  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0004  DNA replication and repair protein RecF  34.62 
 
 		 397 aa  48.9  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2127  ABC transporter related  27.04 
 
 		 264 aa  48.5  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  24.03 
 
 		 906 aa  48.5  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1039  exonuclease SbcC  24.22 
 
 		 1083 aa  48.1  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.772605  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2796  ABC transporter related  35.71 
 
 		 580 aa  48.1  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00139459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1701  ABC transporter related  44.59 
 
 		 292 aa  48.1  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1789  ABC transporter related  26.53 
 
 		 263 aa  47.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  29.53 
 
 		 1008 aa  47.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  32.99 
 
 		 1007 aa  47.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10940  condensin subunit Smc  37.5 
 
 		 1217 aa  47.4  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.638543  normal  0.192819 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0976  ABC transporter ATPase  31.16 
 
 		 516 aa  47.8  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0004  recombination protein F  32.47 
 
 		 401 aa  47.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.582462  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3554  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, ATP binding protein  27.84 
 
 		 292 aa  47.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  23.62 
 
 		 804 aa  47.8  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  35.94 
 
 		 1188 aa  47.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>