More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3554 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3689  ABC transporter related  100 
 
 		 292 aa  600  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3554  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, ATP binding protein  100 
 
 		 292 aa  600  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4037  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATP binding protein  100 
 
 		 292 aa  600  1e-170  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1102  ABC transporter related  61.38 
 
 		 278 aa  359  3e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2913  ABC transporter-related protein  55.12 
 
 		 278 aa  305  7e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2059  ABC transporter related  51.96 
 
 		 283 aa  281  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.113348  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3382  ABC transporter related  48.41 
 
 		 274 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3885  ABC transporter  43.4 
 
 		 277 aa  233  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2043  ABC transporter related  45.33 
 
 		 276 aa  232  6e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.336265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2717  ABC transporter related  44.1 
 
 		 279 aa  229  5e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1797  ABC transporter related  45.94 
 
 		 282 aa  228  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.169202  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2323  ABC transporter related  43.21 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.936398 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3849  ABC transporter related  43.06 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.997638 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2462  ABC transporter related  42.01 
 
 		 274 aa  225  7e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.612548  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4177  ABC transporter related  42.36 
 
 		 277 aa  224  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1903  ABC transporter related  44.68 
 
 		 277 aa  223  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264494  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0804  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppD  42.01 
 
 		 274 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.69273  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1251  ABC transporter related  43.16 
 
 		 284 aa  223  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3832  ABC transporter related  43.69 
 
 		 280 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0375  ABC transporter related  43.16 
 
 		 274 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.157561  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1761  ABC transporter related  47.86 
 
 		 274 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3251  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.96 
 
 		 279 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0275021  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1882  ABC transporter related  42.36 
 
 		 279 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.573524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0111  dipeptide transporter ATP-binding subunit  44.24 
 
 		 322 aa  213  3.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0035  ABC transporter related  40.99 
 
 		 285 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00363386  normal  0.320006 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4041  ABC transporter related protein  39.79 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3990  ABC transporter related  41.84 
 
 		 276 aa  206  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3368  ABC transporter related  41.4 
 
 		 297 aa  206  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3864  ABC transporter related  39.79 
 
 		 295 aa  206  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5170  ABC transporter related  40 
 
 		 285 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219608  normal  0.319827 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3091  ABC transporter related  40.69 
 
 		 287 aa  206  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1920  ABC transporter component  42.75 
 
 		 276 aa  205  6e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3201  ABC transporter related  44.17 
 
 		 291 aa  205  7e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.776015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0212  hypothetical protein  42.75 
 
 		 334 aa  204  1e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0203  hypothetical protein  42.75 
 
 		 334 aa  204  1e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5439  ABC transporter related  39.3 
 
 		 285 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.476246  hitchhiker  0.0038839 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0185  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, ATPase subunit  42.91 
 
 		 334 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  40.35 
 
 		 609 aa  203  3e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3738  ABC transporter related  41.49 
 
 		 276 aa  202  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0710924  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0052  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.54 
 
 		 326 aa  202  6e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.617772  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3860  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.91 
 
 		 327 aa  202  8e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03392  dipeptide transporter  41.91 
 
 		 327 aa  201  9e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0171  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.91 
 
 		 327 aa  201  9e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4909  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.91 
 
 		 327 aa  201  9e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0174  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.91 
 
 		 327 aa  201  9e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4033  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.91 
 
 		 327 aa  201  9e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03343  hypothetical protein  41.91 
 
 		 327 aa  201  9e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.837106  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3740  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.91 
 
 		 327 aa  201  9e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0614  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.66 
 
 		 345 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0047  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.54 
 
 		 326 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1027  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.98 
 
 		 291 aa  201  9.999999999999999e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.26315  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4072  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.54 
 
 		 326 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4059  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.54 
 
 		 326 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3990  dipeptide transporter ATP-binding subunit  42.07 
 
 		 327 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0091  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.54 
 
 		 326 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.887805  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2703  ABC transporter related  41 
 
 		 287 aa  201  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0487  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.07 
 
 		 340 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2428  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  41.94 
 
 		 332 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0138  ABC transporter related  41.13 
 
 		 276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3061  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.94 
 
 		 332 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538334  normal  0.120917 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3042  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.94 
 
 		 332 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0141  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.91 
 
 		 326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0187  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.91 
 
 		 327 aa  199  3.9999999999999996e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0235094  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4053  ABC transporter related  41.13 
 
 		 301 aa  199  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.149041  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1881  ABC transporter related  42.7 
 
 		 281 aa  198  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176759  normal  0.192809 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3839  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.18 
 
 		 327 aa  198  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3825  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.18 
 
 		 327 aa  198  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3784  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.65 
 
 		 326 aa  198  7.999999999999999e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00880915  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3947  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.18 
 
 		 327 aa  198  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2359  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  41.24 
 
 		 342 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4007  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.18 
 
 		 327 aa  198  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3903  dipeptide transporter ATP-binding subunit  41.18 
 
 		 327 aa  198  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7647  ABC transporter related  41.32 
 
 		 291 aa  198  9e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4564  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.5 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6389  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.73 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0848  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  41.58 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3751  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.67 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.603755 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0922  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.17 
 
 		 322 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0810  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  42.14 
 
 		 322 aa  196  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  41.13 
 
 		 583 aa  196  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0456  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.37 
 
 		 332 aa  196  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0879  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.17 
 
 		 322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4241  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  42.14 
 
 		 322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.28364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3037  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.58 
 
 		 332 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.290188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0918  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.17 
 
 		 322 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal  0.491709 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2052  peptide ABC transporter ATP-binding protein  40.94 
 
 		 343 aa  196  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.618151 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2953  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.22 
 
 		 332 aa  195  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2814  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  40.81 
 
 		 340 aa  195  6e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.241348  normal  0.0563642 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3087  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.22 
 
 		 332 aa  195  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1951  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  41.97 
 
 		 322 aa  195  7e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176704  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1695  ABC transporter related  42.35 
 
 		 286 aa  195  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.930247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4299  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.09 
 
 		 322 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.566558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  40.86 
 
 		 619 aa  195  8.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0501  ABC transporter ATP-binding protein  41.03 
 
 		 326 aa  195  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6304  ABC transporter related  38.67 
 
 		 292 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1981  ABC transporter, ATP-binding protein  42.23 
 
 		 544 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000154276  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4095  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.44 
 
 		 326 aa  194  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2226  ABC transporter related protein  39.27 
 
 		 620 aa  194  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.993746  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12490  Oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding component  44.06 
 
 		 322 aa  194  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0971633  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4482  ABC transporter related  40.78 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.959295 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>