More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0375 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0375  ABC transporter related  100 
 
 
274 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.157561  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2462  ABC transporter related  94.53 
 
 
274 aa  517  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.612548  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0804  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppD  94.16 
 
 
274 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.69273  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2323  ABC transporter related  72.26 
 
 
277 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.936398 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3849  ABC transporter related  71.9 
 
 
277 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.997638 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4177  ABC transporter related  71.53 
 
 
277 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1903  ABC transporter related  70.44 
 
 
277 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264494  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3885  ABC transporter  70.7 
 
 
277 aa  393  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3832  ABC transporter related  69.82 
 
 
280 aa  368  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1251  ABC transporter related  69.49 
 
 
284 aa  363  2e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2717  ABC transporter related  64.73 
 
 
279 aa  349  2e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1920  ABC transporter component  64.81 
 
 
276 aa  340  1e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0035  ABC transporter related  63 
 
 
285 aa  338  5e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00363386  normal  0.320006 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3368  ABC transporter related  60.81 
 
 
297 aa  335  5e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3864  ABC transporter related  60.29 
 
 
295 aa  330  2e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0138  ABC transporter related  60.29 
 
 
276 aa  329  3e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4041  ABC transporter related protein  59.93 
 
 
295 aa  329  3e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3990  ABC transporter related  59.93 
 
 
276 aa  328  5.0000000000000004e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3738  ABC transporter related  59.93 
 
 
276 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0710924  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2703  ABC transporter related  58.09 
 
 
287 aa  321  7e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3091  ABC transporter related  59.93 
 
 
287 aa  320  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3534  ABC transporter related  61.99 
 
 
295 aa  317  1e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.463988 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3251  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  58.3 
 
 
279 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0275021  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5170  ABC transporter related  58.24 
 
 
285 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219608  normal  0.319827 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1027  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  57.97 
 
 
291 aa  310  2e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.26315  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1882  ABC transporter related  56.46 
 
 
279 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.573524  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5439  ABC transporter related  57.51 
 
 
285 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.476246  hitchhiker  0.0038839 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2043  ABC transporter related  58.91 
 
 
276 aa  298  9e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.336265  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4007  ABC transporter related  55.64 
 
 
297 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6304  ABC transporter related  54.91 
 
 
292 aa  276  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0194  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  54.91 
 
 
296 aa  275  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0233708 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4053  ABC transporter related  56.36 
 
 
301 aa  274  9e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.149041  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4020  ABC transporter related  55.27 
 
 
304 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732506  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4482  ABC transporter related  55.27 
 
 
304 aa  268  5e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.959295 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1250  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  56 
 
 
304 aa  268  7e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.544036  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7647  ABC transporter related  54.55 
 
 
291 aa  266  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5711  ABC transporter related  55.64 
 
 
304 aa  265  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0661262 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3774  ABC transporter related  55.64 
 
 
304 aa  265  5e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4594  ABC transporter related  55.64 
 
 
304 aa  265  5e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254879  normal  0.570129 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2913  ABC transporter-related protein  51.67 
 
 
278 aa  264  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2059  ABC transporter related  46.49 
 
 
283 aa  260  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.113348  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3201  ABC transporter related  52.38 
 
 
291 aa  258  6e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.776015  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3382  ABC transporter related  52.42 
 
 
274 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0802  ABC transporter component  55.47 
 
 
276 aa  257  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.051347  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1881  ABC transporter related  53.33 
 
 
281 aa  254  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176759  normal  0.192809 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1445  ABC transporter, ATP-binding protein  55.64 
 
 
293 aa  254  8e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1277  ABC transporter, ATP-binding protein  56.36 
 
 
293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.846067  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0250  ABC transporter, ATP-binding protein  56.36 
 
 
293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0521  ABC transporter, ATP-binding protein  56.36 
 
 
293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.939776  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  56.36 
 
 
293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1695  ABC transporter related  53.33 
 
 
286 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.930247  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1308  ABC transporter, ATP-binding protein  56 
 
 
293 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0652042  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1389  ABC transporter, ATP-binding protein  55.64 
 
 
293 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0826888  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2558  ABC transporter, ATP-binding protein  55.64 
 
 
293 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1243  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  52.87 
 
 
320 aa  248  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143149  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4731  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.36 
 
 
329 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3821  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.05 
 
 
332 aa  243  3e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.282595  normal  0.751344 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2723  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.53 
 
 
324 aa  241  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  0.451475 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1870  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  50 
 
 
333 aa  240  2e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0687438  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0487  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  52.45 
 
 
340 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2965  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.63 
 
 
338 aa  238  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0065  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.56 
 
 
371 aa  237  1e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1695  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.41 
 
 
322 aa  235  5.0000000000000005e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000898255 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0452  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.31 
 
 
332 aa  235  5.0000000000000005e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.04 
 
 
357 aa  235  5.0000000000000005e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3115  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  49.62 
 
 
671 aa  235  6e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.426861  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2573  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  49.62 
 
 
333 aa  234  8e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.194756  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3854  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.31 
 
 
346 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.403514  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2116  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  50.36 
 
 
553 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1998  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.79 
 
 
333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.120304  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0467  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.87 
 
 
332 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0177179  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2146  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.84 
 
 
327 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1795  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.33 
 
 
324 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.193556  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1303  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.07 
 
 
347 aa  233  3e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.92932  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1237  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.07 
 
 
347 aa  233  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.180341  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2264  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  49.62 
 
 
333 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319063  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1883  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.88 
 
 
323 aa  233  3e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0272  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.35 
 
 
319 aa  233  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1341  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.07 
 
 
347 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000765858  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4502  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.57 
 
 
329 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.301743 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1104  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  46.07 
 
 
347 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1264  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.07 
 
 
347 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1086  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.07 
 
 
347 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1102  ABC transporter related  46.84 
 
 
278 aa  233  4.0000000000000004e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1080  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.07 
 
 
347 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1250  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  50.18 
 
 
329 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3627  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.17 
 
 
324 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1194  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  46.07 
 
 
347 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118138  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2216  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  51.91 
 
 
329 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0899  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.24 
 
 
347 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.61652  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3600  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  50 
 
 
331 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5668  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.18 
 
 
342 aa  232  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.467741  normal  0.0318296 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3016  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein OppD  50.18 
 
 
329 aa  232  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  47.69 
 
 
539 aa  232  6e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1092  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.07 
 
 
347 aa  232  6e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00314713  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2900  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein OppD  50.18 
 
 
329 aa  232  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.208244  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0111  dipeptide transporter ATP-binding subunit  48.15 
 
 
322 aa  232  6e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4105  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.07 
 
 
347 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5352  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  48.44 
 
 
350 aa  231  8.000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2359  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  49.25 
 
 
342 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>