More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3774 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_3774  ABC transporter related  100 
 
 		 304 aa  607  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5711  ABC transporter related  100 
 
 		 304 aa  607  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0661262 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4594  ABC transporter related  100 
 
 		 304 aa  607  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254879  normal  0.570129 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4020  ABC transporter related  94.08 
 
 		 304 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4482  ABC transporter related  93.42 
 
 		 304 aa  567  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.959295 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1250  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  92.76 
 
 		 304 aa  555  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.544036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4053  ABC transporter related  91.8 
 
 		 301 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.149041  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7647  ABC transporter related  88.81 
 
 		 291 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1308  ABC transporter, ATP-binding protein  83.85 
 
 		 293 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0652042  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1445  ABC transporter, ATP-binding protein  83.92 
 
 		 293 aa  462  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  83.16 
 
 		 293 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1277  ABC transporter, ATP-binding protein  83.16 
 
 		 293 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.846067  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2558  ABC transporter, ATP-binding protein  83.85 
 
 		 293 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1389  ABC transporter, ATP-binding protein  83.51 
 
 		 293 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0826888  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0250  ABC transporter, ATP-binding protein  83.16 
 
 		 293 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0521  ABC transporter, ATP-binding protein  83.16 
 
 		 293 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.939776  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6304  ABC transporter related  81.59 
 
 		 292 aa  454  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4007  ABC transporter related  77.82 
 
 		 297 aa  449  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0194  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  78.34 
 
 		 296 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0233708 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2323  ABC transporter related  57.76 
 
 		 277 aa  300  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.936398 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5170  ABC transporter related  53.87 
 
 		 285 aa  298  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219608  normal  0.319827 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3885  ABC transporter  57.4 
 
 		 277 aa  298  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5439  ABC transporter related  54.68 
 
 		 285 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.476246  hitchhiker  0.0038839 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3849  ABC transporter related  57.45 
 
 		 277 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.997638 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3251  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  56.78 
 
 		 279 aa  296  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0275021  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3864  ABC transporter related  53.9 
 
 		 295 aa  296  4e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4177  ABC transporter related  56.73 
 
 		 277 aa  295  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1903  ABC transporter related  55.43 
 
 		 277 aa  295  7e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264494  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3368  ABC transporter related  54.39 
 
 		 297 aa  294  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3990  ABC transporter related  55.76 
 
 		 276 aa  294  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1882  ABC transporter related  55.11 
 
 		 279 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.573524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4041  ABC transporter related protein  53.76 
 
 		 295 aa  292  4e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0138  ABC transporter related  55.04 
 
 		 276 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3091  ABC transporter related  54.15 
 
 		 287 aa  285  5e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1251  ABC transporter related  53.93 
 
 		 284 aa  285  5.999999999999999e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3832  ABC transporter related  54.87 
 
 		 280 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1920  ABC transporter component  56.47 
 
 		 276 aa  281  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2703  ABC transporter related  54.32 
 
 		 287 aa  280  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0035  ABC transporter related  51.6 
 
 		 285 aa  280  2e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00363386  normal  0.320006 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3534  ABC transporter related  54.93 
 
 		 295 aa  280  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.463988 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2717  ABC transporter related  54.35 
 
 		 279 aa  277  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3738  ABC transporter related  52.52 
 
 		 276 aa  270  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0710924  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2043  ABC transporter related  55.6 
 
 		 276 aa  267  2e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.336265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0375  ABC transporter related  55.64 
 
 		 274 aa  265  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.157561  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2462  ABC transporter related  55.27 
 
 		 274 aa  265  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.612548  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0804  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppD  55.27 
 
 		 274 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.69273  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1027  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  52.52 
 
 		 291 aa  264  1e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.26315  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3201  ABC transporter related  51.06 
 
 		 291 aa  252  7e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.776015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0091  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.92 
 
 		 325 aa  236  5.0000000000000005e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.58 
 
 		 650 aa  234  9e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0892214 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2755  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.36 
 
 		 327 aa  230  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1079  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  48.91 
 
 		 345 aa  231  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.233153  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1881  ABC transporter related  49.11 
 
 		 281 aa  229  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176759  normal  0.192809 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5657  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.62 
 
 		 333 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.991753 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4369  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.28 
 
 		 336 aa  223  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal  0.634457 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4007  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.56 
 
 		 327 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3947  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.56 
 
 		 327 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3839  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.56 
 
 		 327 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3903  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.56 
 
 		 327 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3825  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.56 
 
 		 327 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0671  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.43 
 
 		 321 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0487  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.84 
 
 		 340 aa  222  6e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4502  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.12 
 
 		 329 aa  222  7e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.301743 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  45.45 
 
 		 543 aa  222  8e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1094  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.33 
 
 		 332 aa  221  9e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5631  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  47.06 
 
 		 341 aa  221  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.215851  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2814  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.29 
 
 		 340 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.241348  normal  0.0563642 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  47.06 
 
 		 531 aa  221  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2059  ABC transporter related  41.76 
 
 		 283 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.113348  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  45.45 
 
 		 543 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3115  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  45.95 
 
 		 671 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.426861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1695  ABC transporter related  48.04 
 
 		 286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.930247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  49.24 
 
 		 566 aa  219  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  46.52 
 
 		 539 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0141  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.36 
 
 		 326 aa  219  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  46.52 
 
 		 539 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4407  oligopeptide transporter ATP-binding component  45.26 
 
 		 329 aa  218  7.999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  46.47 
 
 		 545 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1765  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.82 
 
 		 325 aa  217  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.743742  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2439  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.61 
 
 		 320 aa  217  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0579  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.51 
 
 		 351 aa  217  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.551988  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4797  ABC transporter related  45.11 
 
 		 565 aa  217  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115874  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1778  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.24 
 
 		 320 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000196447 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3751  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.9 
 
 		 334 aa  216  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.603755 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.53 
 
 		 357 aa  216  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7171  peptide ABC transporter ATP-binding protein  47.19 
 
 		 291 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0236  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.06 
 
 		 332 aa  215  5.9999999999999996e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4282  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.86 
 
 		 330 aa  215  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205875  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0111  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.8 
 
 		 322 aa  215  7e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1529  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.36 
 
 		 369 aa  215  8e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2052  peptide ABC transporter ATP-binding protein  46.72 
 
 		 343 aa  215  8e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.618151 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  46.52 
 
 		 539 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3860  dipeptide transporter ATP-binding subunit  44.81 
 
 		 327 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2643  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.32 
 
 		 327 aa  214  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.791522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2969  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  48.85 
 
 		 341 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0804764  normal  0.623944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5119  putative ABC transporter ATP-binding  45.8 
 
 		 327 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal  0.157884 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0171  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.81 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4033  dipeptide transporter ATP-binding subunit  44.81 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0185  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, ATPase subunit  46.9 
 
 		 334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4072  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.8 
 
 		 326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>