More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1695 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1695  ABC transporter related  100 
 
 
286 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.930247  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1881  ABC transporter related  95.02 
 
 
281 aa  501  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176759  normal  0.192809 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5170  ABC transporter related  55.64 
 
 
285 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219608  normal  0.319827 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5439  ABC transporter related  55.27 
 
 
285 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.476246  hitchhiker  0.0038839 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1251  ABC transporter related  54.95 
 
 
284 aa  295  5e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3368  ABC transporter related  55.6 
 
 
297 aa  288  9e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0035  ABC transporter related  52.33 
 
 
285 aa  287  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00363386  normal  0.320006 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3091  ABC transporter related  55.51 
 
 
287 aa  287  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3849  ABC transporter related  54.61 
 
 
277 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.997638 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3832  ABC transporter related  57.04 
 
 
280 aa  285  5.999999999999999e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4177  ABC transporter related  53.87 
 
 
277 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1882  ABC transporter related  52.92 
 
 
279 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.573524  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2323  ABC transporter related  55.72 
 
 
277 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.936398 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3251  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  53.45 
 
 
279 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0275021  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1903  ABC transporter related  55.64 
 
 
277 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264494  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3885  ABC transporter  54.29 
 
 
277 aa  281  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4041  ABC transporter related protein  54.28 
 
 
295 aa  280  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3864  ABC transporter related  54.28 
 
 
295 aa  280  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2717  ABC transporter related  54.44 
 
 
279 aa  279  5e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3534  ABC transporter related  54.28 
 
 
295 aa  278  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.463988 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1027  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  54.1 
 
 
291 aa  277  1e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.26315  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3990  ABC transporter related  52.61 
 
 
276 aa  276  3e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2703  ABC transporter related  55.76 
 
 
287 aa  276  4e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0138  ABC transporter related  55.42 
 
 
276 aa  275  6e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1920  ABC transporter component  56.51 
 
 
276 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2043  ABC transporter related  54.74 
 
 
276 aa  271  1e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.336265  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3738  ABC transporter related  51.25 
 
 
276 aa  271  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0710924  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2462  ABC transporter related  54.1 
 
 
274 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.612548  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0375  ABC transporter related  53.33 
 
 
274 aa  269  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.157561  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0804  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppD  53.73 
 
 
274 aa  267  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.69273  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2913  ABC transporter-related protein  48.89 
 
 
278 aa  249  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2059  ABC transporter related  47.27 
 
 
283 aa  246  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.113348  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4007  ABC transporter related  49.81 
 
 
297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0194  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  48.9 
 
 
296 aa  239  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0233708 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6304  ABC transporter related  48.18 
 
 
292 aa  238  9e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4053  ABC transporter related  48.93 
 
 
301 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.149041  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1250  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  48.6 
 
 
304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.544036  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4482  ABC transporter related  48.42 
 
 
304 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.959295 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7647  ABC transporter related  48.91 
 
 
291 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4020  ABC transporter related  48.25 
 
 
304 aa  232  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732506  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5711  ABC transporter related  48.04 
 
 
304 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0661262 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3774  ABC transporter related  48.04 
 
 
304 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4594  ABC transporter related  48.04 
 
 
304 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254879  normal  0.570129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4863  ABC transporter ATP-binding protein, putative oligo/dipeptide transport protein  50.79 
 
 
335 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  0.902987 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2755  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.27 
 
 
327 aa  229  6e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0802  ABC transporter component  50.97 
 
 
276 aa  227  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.051347  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.06 
 
 
357 aa  227  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2795  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.65 
 
 
326 aa  226  4e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4963  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.61 
 
 
340 aa  226  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0355569  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3425  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.67 
 
 
336 aa  225  6e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.358042  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2700  ABC oligo/dipeptide transporter, fused ATPase subunits  48.05 
 
 
659 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0848  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.76 
 
 
320 aa  224  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1272  ABC transporter-related protein  48.11 
 
 
548 aa  223  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000618356 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  46.74 
 
 
623 aa  223  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3382  ABC transporter related  50.39 
 
 
274 aa  222  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003660  oligopeptide transport ATP-binding protein OppD  44.78 
 
 
327 aa  222  6e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4407  oligopeptide transporter ATP-binding component  44.53 
 
 
329 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2451  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.69 
 
 
326 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1445  ABC transporter, ATP-binding protein  49.26 
 
 
293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0234  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.29 
 
 
351 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.19 
 
 
650 aa  220  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0892214 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3115  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.13 
 
 
671 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.426861  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3860  dipeptide transporter ATP-binding subunit  47.01 
 
 
327 aa  219  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03392  dipeptide transporter  47.01 
 
 
327 aa  219  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0171  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.01 
 
 
327 aa  219  3e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4033  dipeptide transporter ATP-binding subunit  47.01 
 
 
327 aa  219  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19570  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  47.53 
 
 
332 aa  219  3e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.487374  normal  0.0690527 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3740  dipeptide transporter ATP-binding subunit  47.01 
 
 
327 aa  219  3e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2787  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.97 
 
 
327 aa  220  3e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2439  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.96 
 
 
320 aa  219  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0174  dipeptide transporter ATP-binding subunit  47.01 
 
 
327 aa  219  3e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4909  dipeptide transporter ATP-binding subunit  47.01 
 
 
327 aa  219  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03343  hypothetical protein  47.01 
 
 
327 aa  219  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.837106  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4579  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein  47.1 
 
 
325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170967  hitchhiker  0.00444636 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0024  oligopeptide transporter ATP-binding component  44.32 
 
 
348 aa  219  3.9999999999999997e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.586703  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1102  ABC transporter related  43.33 
 
 
278 aa  219  3.9999999999999997e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1163  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.45 
 
 
329 aa  219  5e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0503612  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0193  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.36 
 
 
343 aa  219  6e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02946  oligopeptide transporter ATP-binding component  45.31 
 
 
324 aa  219  6e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2837  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.64 
 
 
335 aa  218  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5509  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  44.83 
 
 
347 aa  218  7e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.435754 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1778  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45 
 
 
320 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000196447 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3201  ABC transporter related  47.04 
 
 
291 aa  218  8.999999999999998e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.776015  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  47.41 
 
 
612 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3990  dipeptide transporter ATP-binding subunit  47.01 
 
 
327 aa  218  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2067  oligopeptide transporter ATP-binding component  45.31 
 
 
333 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.702331  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0418  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.88 
 
 
339 aa  216  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.755562  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8310  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.25 
 
 
620 aa  216  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357305  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0612  oligopeptide transporter ATP-binding component  44.92 
 
 
324 aa  217  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1277  ABC transporter, ATP-binding protein  51.36 
 
 
293 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.846067  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1243  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  46.48 
 
 
320 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143149  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1308  ABC transporter, ATP-binding protein  49.64 
 
 
293 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0652042  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2160  oligopeptide transporter ATP-binding component  45.31 
 
 
333 aa  217  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00241569  normal  0.0324737 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1957  oligopeptide transporter ATP-binding component  45.31 
 
 
333 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.473899  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  51.36 
 
 
293 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0250  ABC transporter, ATP-binding protein  51.36 
 
 
293 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0521  ABC transporter, ATP-binding protein  51.36 
 
 
293 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.939776  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1712  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.98 
 
 
320 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000540803  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0187  dipeptide transporter ATP-binding subunit  46.64 
 
 
327 aa  216  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0235094  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0806  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.98 
 
 
330 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>