More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2700 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_2700  ABC oligo/dipeptide transporter, fused ATPase subunits  100 
 
 
659 aa  1278    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1357  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  95.9 
 
 
659 aa  1164    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28594  normal  0.0160708 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2467  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  49.7 
 
 
695 aa  661    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.380053  normal  0.0115313 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1420  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  48.68 
 
 
695 aa  642    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0353718  normal  0.112708 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1487  oligopeptide/dipeptide ABC transporter  49.34 
 
 
693 aa  654    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.867925  normal  0.273968 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2159  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  75.72 
 
 
684 aa  924    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.13006  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2059  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.22 
 
 
694 aa  628  1e-179  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190669  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5689  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.58 
 
 
696 aa  560  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.34468  normal  0.261455 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3632  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.69 
 
 
691 aa  524  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.208084  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1083  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.53 
 
 
669 aa  481  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3178  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.73 
 
 
727 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00139803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1953  glutathione import ATP-binding protein GsiA  42.38 
 
 
686 aa  469  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1630  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  42.42 
 
 
712 aa  458  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.06 
 
 
701 aa  458  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0332392 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0787  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, fused ATPase subunits  41.59 
 
 
725 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217404  normal  0.804372 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2075  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.56 
 
 
676 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4781  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.32 
 
 
703 aa  452  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8315  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.16 
 
 
711 aa  452  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.718859 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4339  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.93 
 
 
708 aa  450  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108178  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0890  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.05 
 
 
690 aa  451  1e-125  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7097  glutathione import ATP-binding protein GsiA  40.26 
 
 
718 aa  445  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1751  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.8 
 
 
669 aa  439  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.219449  normal  0.477606 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1147  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.96 
 
 
676 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2293  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.73 
 
 
695 aa  432  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.559859  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4532  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.75 
 
 
736 aa  435  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.124709  normal  0.790856 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3115  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  39.26 
 
 
671 aa  431  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.426861  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.86 
 
 
674 aa  430  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.734122 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3806  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.91 
 
 
749 aa  428  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4015  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.91 
 
 
756 aa  426  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1668  oligopeptidee ABC transporter, ATP-binding protein  42.09 
 
 
659 aa  423  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0535  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.94 
 
 
725 aa  423  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3727  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.21 
 
 
665 aa  420  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.67 
 
 
623 aa  416  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  42.22 
 
 
615 aa  416  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2291  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  42.4 
 
 
706 aa  413  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00302442  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  41.06 
 
 
611 aa  414  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3738  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.09 
 
 
680 aa  415  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.31873  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.55 
 
 
626 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  40.89 
 
 
623 aa  409  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.84 
 
 
625 aa  410  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4590  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.54 
 
 
625 aa  410  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0191447  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  42.41 
 
 
627 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  41.56 
 
 
611 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.56 
 
 
617 aa  409  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2406  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.62 
 
 
744 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0618  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.83 
 
 
725 aa  402  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726649  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  40.43 
 
 
623 aa  403  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3805  ABC transporter related  39.84 
 
 
611 aa  404  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.503567  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  40.2 
 
 
612 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1319  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  40.03 
 
 
658 aa  400  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179908  normal  0.0765459 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  37.61 
 
 
619 aa  402  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2259  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.15 
 
 
611 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115174  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3244  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.68 
 
 
637 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.181718  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0021  ABC transporter related protein  40.09 
 
 
601 aa  402  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  43.26 
 
 
619 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8310  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.78 
 
 
620 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357305  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  42.95 
 
 
613 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  40.36 
 
 
611 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  40.16 
 
 
610 aa  396  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1407  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein-like protein  41.37 
 
 
630 aa  396  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243275  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4453  opine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.39 
 
 
610 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1490  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.13 
 
 
633 aa  392  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.72 
 
 
629 aa  395  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0894712  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2975  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.19 
 
 
633 aa  395  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  39.64 
 
 
632 aa  394  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.403478 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.24 
 
 
632 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  39.84 
 
 
623 aa  395  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.24 
 
 
611 aa  392  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1927  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  41.76 
 
 
629 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.831202  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  39.77 
 
 
624 aa  392  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  37.25 
 
 
564 aa  390  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  41.42 
 
 
640 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  40.07 
 
 
593 aa  389  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  39.02 
 
 
606 aa  389  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  39.7 
 
 
583 aa  392  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5592  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.8 
 
 
725 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854543  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0918  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.58 
 
 
677 aa  389  1e-106  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.233334 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  41.25 
 
 
640 aa  389  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.49 
 
 
629 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144402  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4130  ABC transporter related  38.94 
 
 
561 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2286  ABC transporter related  39.48 
 
 
617 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.411723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4432  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.48 
 
 
611 aa  387  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.62214  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0218  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.1 
 
 
905 aa  385  1e-105  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0707728  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  39.62 
 
 
597 aa  383  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  37.48 
 
 
572 aa  384  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  41.36 
 
 
571 aa  385  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2588  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.27 
 
 
736 aa  384  1e-105  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.104782  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.98 
 
 
633 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  41.49 
 
 
609 aa  384  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  39.42 
 
 
623 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  39.87 
 
 
623 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0747  hypothetical protein  38.02 
 
 
602 aa  382  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0728  hypothetical protein  37.52 
 
 
603 aa  381  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  39.58 
 
 
623 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  40.72 
 
 
633 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  39.58 
 
 
623 aa  380  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  39.58 
 
 
623 aa  382  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0980  glutathione transporter ATP-binding protein  39.42 
 
 
629 aa  379  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  39.1 
 
 
623 aa  380  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2226  ABC transporter related protein  37.68 
 
 
620 aa  379  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.993746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>