More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3382 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3382  ABC transporter related  100 
 
 		 274 aa  542  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2913  ABC transporter-related protein  55.85 
 
 		 278 aa  296  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2323  ABC transporter related  52.4 
 
 		 277 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.936398 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2059  ABC transporter related  50.94 
 
 		 283 aa  271  7e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.113348  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1903  ABC transporter related  52.03 
 
 		 277 aa  271  9e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264494  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3849  ABC transporter related  51.11 
 
 		 277 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.997638 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4177  ABC transporter related  50.74 
 
 		 277 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3885  ABC transporter  51.7 
 
 		 277 aa  265  8e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2717  ABC transporter related  53.01 
 
 		 279 aa  263  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3832  ABC transporter related  53.91 
 
 		 280 aa  261  8.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3554  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, ATP binding protein  48.41 
 
 		 292 aa  259  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4037  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATP binding protein  48.41 
 
 		 292 aa  259  4e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3689  ABC transporter related  48.41 
 
 		 292 aa  259  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1102  ABC transporter related  51.3 
 
 		 278 aa  259  5.0000000000000005e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0375  ABC transporter related  52.42 
 
 		 274 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.157561  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1882  ABC transporter related  48.18 
 
 		 279 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.573524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2043  ABC transporter related  52.21 
 
 		 276 aa  255  6e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.336265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2462  ABC transporter related  52.08 
 
 		 274 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.612548  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3091  ABC transporter related  52.33 
 
 		 287 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0804  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppD  51.7 
 
 		 274 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.69273  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1027  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  50.78 
 
 		 291 aa  248  5e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.26315  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3534  ABC transporter related  49.45 
 
 		 295 aa  247  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.463988 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1251  ABC transporter related  48.63 
 
 		 284 aa  244  8e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3368  ABC transporter related  47.62 
 
 		 297 aa  243  3e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4041  ABC transporter related protein  45.79 
 
 		 295 aa  242  5e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3990  ABC transporter related  48.89 
 
 		 276 aa  242  5e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3738  ABC transporter related  49.44 
 
 		 276 aa  242  6e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0710924  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3864  ABC transporter related  45.79 
 
 		 295 aa  241  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0035  ABC transporter related  45.93 
 
 		 285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00363386  normal  0.320006 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5170  ABC transporter related  47.64 
 
 		 285 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219608  normal  0.319827 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1920  ABC transporter component  50.2 
 
 		 276 aa  236  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3251  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.26 
 
 		 279 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0275021  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5439  ABC transporter related  47.27 
 
 		 285 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.476246  hitchhiker  0.0038839 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0138  ABC transporter related  48.52 
 
 		 276 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2703  ABC transporter related  47.74 
 
 		 287 aa  233  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1797  ABC transporter related  46.3 
 
 		 282 aa  232  6e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.169202  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3235  ABC peptide transporter, ATPase subunit  47.41 
 
 		 282 aa  229  4e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3972  ABC transporter related  47.41 
 
 		 282 aa  229  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0425  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.82 
 
 		 338 aa  227  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.167314  normal  0.0389078 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0393  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.82 
 
 		 338 aa  226  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.207731 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0614  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.66 
 
 		 345 aa  226  4e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6304  ABC transporter related  46.69 
 
 		 292 aa  224  9e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0194  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  46.21 
 
 		 296 aa  224  9e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0233708 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  50 
 
 		 534 aa  224  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0487  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.86 
 
 		 340 aa  222  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0332  ABC transporter related  45.93 
 
 		 284 aa  223  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352772  normal  0.0451922 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4046  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.08 
 
 		 353 aa  222  4.9999999999999996e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7226  ABC transporter related  49.45 
 
 		 624 aa  221  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0885974  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0434  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.77 
 
 		 334 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.542128  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0064  ABC transporter related  44.81 
 
 		 284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.080587  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1668  ABC transporter related  46.47 
 
 		 279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3821  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.07 
 
 		 332 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.282595  normal  0.751344 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0419  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.77 
 
 		 334 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0195088  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  49.43 
 
 		 545 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2965  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.29 
 
 		 338 aa  219  5e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2814  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.04 
 
 		 340 aa  219  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.241348  normal  0.0563642 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7647  ABC transporter related  46.74 
 
 		 291 aa  218  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4007  ABC transporter related  45.05 
 
 		 297 aa  218  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5509  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  42.91 
 
 		 347 aa  218  8.999999999999998e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.435754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 		 544 aa  218  8.999999999999998e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1221  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.21 
 
 		 375 aa  218  1e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0728047 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1269  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.11 
 
 		 340 aa  216  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0263793  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1250  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  47.29 
 
 		 304 aa  216  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.544036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  49.43 
 
 		 619 aa  216  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0313  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.99 
 
 		 332 aa  216  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1761  ABC transporter related  47.55 
 
 		 274 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5352  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  43.12 
 
 		 350 aa  216  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0868  dipeptide transport ATP-binding protein DppD  42.86 
 
 		 336 aa  215  5e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4781  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.42 
 
 		 703 aa  215  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  46.85 
 
 		 522 aa  215  5.9999999999999996e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4053  ABC transporter related  46.57 
 
 		 301 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.149041  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2744  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.14 
 
 		 336 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4731  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.22 
 
 		 329 aa  215  7e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0944  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.35 
 
 		 338 aa  215  8e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4482  ABC transporter related  46.72 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.959295 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1272  ABC transporter-related protein  50.19 
 
 		 548 aa  214  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000618356 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1339  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.22 
 
 		 328 aa  214  9.999999999999999e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.97058  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1852  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.65 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  42.01 
 
 		 564 aa  214  9.999999999999999e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1585  ABC transporter related  45.19 
 
 		 282 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.420493  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1765  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.01 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.743742  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3606  ABC transporter related  46.79 
 
 		 566 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1528  putative dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.19 
 
 		 282 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  48.28 
 
 		 545 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1881  ABC transporter related  50 
 
 		 281 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176759  normal  0.192809 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1016  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.62 
 
 		 662 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1583  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.19 
 
 		 282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.282414  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0212  hypothetical protein  45.63 
 
 		 334 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0983  ABC transporter related  42.35 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0278331  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3854  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.83 
 
 		 346 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.403514  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0203  hypothetical protein  45.63 
 
 		 334 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4579  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein  43.93 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170967  hitchhiker  0.00444636 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  43.02 
 
 		 555 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  43.41 
 
 		 555 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3966  ABC transporter related  45.56 
 
 		 282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2052  peptide ABC transporter ATP-binding protein  46.01 
 
 		 343 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.618151 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3860  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.56 
 
 		 327 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0171  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.56 
 
 		 327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4909  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.56 
 
 		 327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4020  ABC transporter related  46.35 
 
 		 304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732506  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>