More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1074 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1074  ABC transporter related  100 
 
 
252 aa  489  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.281919  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1167  ABC transporter related protein  53.3 
 
 
229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.227464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6287  ABC transporter related protein  50.54 
 
 
264 aa  166  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0055  ABC transporter related  38.86 
 
 
266 aa  165  8e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00561374  normal  0.0686631 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  40.8 
 
 
263 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2859  ABC transporter related  45.75 
 
 
214 aa  160  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  40 
 
 
262 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  40.43 
 
 
271 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  37.93 
 
 
258 aa  152  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4438  ABC transporter related  40.83 
 
 
246 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.845686  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  32.5 
 
 
255 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13200  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  40.41 
 
 
262 aa  149  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  35.98 
 
 
255 aa  149  4e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2569  ABC transporter related  35.58 
 
 
311 aa  149  4e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.630319  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  36.11 
 
 
262 aa  148  9e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  37.29 
 
 
258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  38.98 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0964  ABC transporter related protein  35.78 
 
 
250 aa  146  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000527176  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5326  ABC transporter-related protein  47.45 
 
 
218 aa  146  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  38.7 
 
 
259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1042  ABC transporter related  39.17 
 
 
274 aa  145  6e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.198308 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  34.65 
 
 
246 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  32.76 
 
 
251 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  37.87 
 
 
263 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  31.91 
 
 
418 aa  142  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0664  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  37.02 
 
 
263 aa  141  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1033  hypothetical protein  34.04 
 
 
264 aa  141  9e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  38.12 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  36.36 
 
 
252 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07790  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  43.35 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  30.83 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  35.32 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1494  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems ATPase components  38.68 
 
 
299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0815348  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0214  ferrichrome ABC transporter  30.8 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  37.6 
 
 
490 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  37.84 
 
 
263 aa  139  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0215  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  30.8 
 
 
259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2065  ABC transporter related  39.91 
 
 
258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4726  ABC transporter related  47.57 
 
 
219 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.929773  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4812  ABC transporter related  47.57 
 
 
219 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.409826 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5111  ABC transporter related  47.57 
 
 
219 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.48212  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  30.08 
 
 
247 aa  137  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2803  ABC transporter related  31.58 
 
 
266 aa  138  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  30.43 
 
 
236 aa  138  1e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  30.87 
 
 
254 aa  137  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1120  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  34.71 
 
 
266 aa  137  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.721216  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00555  iron-enterobactin transporter subunit  33.87 
 
 
271 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3038  ABC transporter related protein  33.87 
 
 
271 aa  136  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3726  ABC transporter related  36.36 
 
 
255 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  33.87 
 
 
271 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  30.38 
 
 
249 aa  137  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0639  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  33.87 
 
 
271 aa  136  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00544  hypothetical protein  33.87 
 
 
271 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  33.87 
 
 
271 aa  136  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3056  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  33.87 
 
 
271 aa  136  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0306  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.75 
 
 
265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  32.49 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  36.52 
 
 
247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  33.74 
 
 
269 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0810  putative ferrichrome ABC transporter, ATP-binding protein  30.86 
 
 
260 aa  136  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.024008  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0852  ABC transporter related  39.22 
 
 
246 aa  136  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.478961  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  35.95 
 
 
259 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0736  ABC transporter related protein  44.02 
 
 
277 aa  136  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3479  ABC transporter related protein  37.13 
 
 
246 aa  136  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.319887  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  31.14 
 
 
254 aa  136  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1605  ATPase  37.32 
 
 
228 aa  135  5e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0234862 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2814  iron-hydroxamate transporter ATP-binding subunit  39.13 
 
 
265 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204949  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3732  ABC transporter related protein  33.05 
 
 
276 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1231  ABC transporter related  34.45 
 
 
275 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3037  ABC transporter related  33.74 
 
 
269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3622  ABC transporter related protein  35.62 
 
 
255 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0489  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  33.47 
 
 
271 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2074  ABC transporter, ATPase subunit  35.44 
 
 
276 aa  135  8e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  29.79 
 
 
405 aa  135  8e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  34.85 
 
 
257 aa  135  8e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  37.84 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0414  ABC transporter related protein  41.59 
 
 
283 aa  134  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7287  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron (III) dicitrate)  36.59 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0797  ferrichrome ABC transporter ATP-binding protein  30.86 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.274021  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  37.55 
 
 
268 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  34.19 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0533  ABC transporter related  36.91 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.622469  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  34.78 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3279  ABC transporter related  34.05 
 
 
267 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  38.58 
 
 
256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3902  ABC transporter-related protein  34.16 
 
 
270 aa  133  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  36.55 
 
 
256 aa  133  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  36.55 
 
 
256 aa  133  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  38.39 
 
 
251 aa  133  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1317  ATPase  36.67 
 
 
245 aa  133  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  43.05 
 
 
262 aa  133  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0672  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  33.47 
 
 
271 aa  133  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  36.12 
 
 
268 aa  132  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2475  ABC transporter related  35.16 
 
 
254 aa  132  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.322042  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  38.2 
 
 
414 aa  132  5e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1142  ABC transporter related  35.5 
 
 
260 aa  132  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0781  iron(III) dicitrate transport permease-like protein yusV  30.29 
 
 
258 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.215395  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2307  ABC transporter related protein  39.75 
 
 
275 aa  131  7.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1662  ABC-type Mn/Zn transport systems ATPase component  36.82 
 
 
243 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.184218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>