More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1845 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1845  nitroreductase  100 
 
 
278 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000200158  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0979  nitroreductase family protein  56.99 
 
 
272 aa  339  2.9999999999999998e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0228506  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1135  nitroreductase family protein  58.09 
 
 
272 aa  325  6e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000059926  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0968  nitroreductase  54.04 
 
 
273 aa  317  2e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1141  nitroreductase  38.77 
 
 
263 aa  189  5e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.262211  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3391  nitroreductase  28.17 
 
 
284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2624  nitroreductase  28.62 
 
 
273 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.28949  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1484  nitroreductase  28.72 
 
 
295 aa  124  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.763778 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  28.62 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  27.21 
 
 
274 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  26.76 
 
 
274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  25.78 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  29.5 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  28.07 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  26.41 
 
 
274 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  27.05 
 
 
273 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  28.41 
 
 
273 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1195  nitroreductase family protein  30.29 
 
 
278 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.950969  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  25.09 
 
 
273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  29.56 
 
 
279 aa  109  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  27.86 
 
 
271 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  26.22 
 
 
287 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  27.46 
 
 
272 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  25.35 
 
 
275 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1740  nitroreductase  25.98 
 
 
277 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.326694  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0348  ferredoxin  27.01 
 
 
275 aa  104  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  27.05 
 
 
265 aa  103  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  24.64 
 
 
272 aa  103  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1838  nitroreductase  24.65 
 
 
274 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00713551  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0390  nitroreductase  25.43 
 
 
278 aa  102  7e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.36041  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2413  nitroreductase family protein  25.61 
 
 
275 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  28.16 
 
 
274 aa  101  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1266  nitroreductase  25.26 
 
 
282 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0453  nitroreductase  24.48 
 
 
274 aa  97.1  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  25.52 
 
 
274 aa  95.5  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18390  nitroreductase  25.26 
 
 
295 aa  94.4  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.281647  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0390  nitroreductase  25.59 
 
 
274 aa  92.4  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00534305  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0886  hypothetical protein  25.95 
 
 
303 aa  91.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2995  nitroreductase  25.99 
 
 
271 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0015  nitroreductase  22.65 
 
 
272 aa  87.4  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  24.46 
 
 
345 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  24.53 
 
 
334 aa  84  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  29.69 
 
 
190 aa  77  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  27.94 
 
 
186 aa  72  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  28.71 
 
 
202 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  30.73 
 
 
186 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  30 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  28.57 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  28.42 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  26.89 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  27.54 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2642  iron-sulfur cluster-binding protein  45.45 
 
 
253 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.317648  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  28.27 
 
 
176 aa  65.5  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  27.5 
 
 
214 aa  65.1  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0703  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  52.46 
 
 
271 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.144882 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0137  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  48.48 
 
 
284 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  27.87 
 
 
191 aa  64.7  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  26.04 
 
 
170 aa  64.3  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21860  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.59 
 
 
242 aa  63.2  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0153  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46.97 
 
 
272 aa  62.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000371436  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0902  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.43 
 
 
314 aa  61.6  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.533273  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  28.8 
 
 
176 aa  61.6  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0713  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.12 
 
 
283 aa  60.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1547  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.24 
 
 
263 aa  60.8  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.05575  normal  0.0499617 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  28.42 
 
 
188 aa  59.3  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2292  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  47.06 
 
 
258 aa  59.7  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0552  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit A  36.78 
 
 
786 aa  59.7  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0563725  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0294  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.45 
 
 
241 aa  59.3  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000282709  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  24.68 
 
 
245 aa  58.9  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1089  iron-sulfur cluster-binding protein  37.04 
 
 
368 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0040129  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  24.23 
 
 
196 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1749  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.33 
 
 
242 aa  58.2  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3185  Iron-sulfur cluster-binding protein  46.97 
 
 
237 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000998162 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0675  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.73 
 
 
249 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00451529  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1172  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.73 
 
 
242 aa  57.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000311269  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2435  nitroreductase  22.18 
 
 
303 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00882814  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1823  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46.55 
 
 
269 aa  57  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2040  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.67 
 
 
194 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2192  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40 
 
 
277 aa  57.4  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0232825  normal  0.226178 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0092  putative PAS/PAC sensor protein  35.21 
 
 
577 aa  57  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0989  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.05 
 
 
293 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.580044 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  23.47 
 
 
183 aa  56.6  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1479  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.71 
 
 
122 aa  56.6  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.150596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  26.21 
 
 
215 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46.03 
 
 
124 aa  56.2  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4082  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  41.27 
 
 
269 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.210971  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  25.12 
 
 
190 aa  56.2  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1359  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.65 
 
 
238 aa  56.2  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.98127  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  42.37 
 
 
179 aa  55.8  0.0000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2193  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.11 
 
 
60 aa  55.8  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1280  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.43 
 
 
249 aa  55.8  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0429552  normal  0.627114 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  27.23 
 
 
228 aa  55.5  0.0000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1702  ferredoxin  42.62 
 
 
240 aa  55.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  29.13 
 
 
215 aa  55.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2104  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.86 
 
 
250 aa  55.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303229  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  25.24 
 
 
215 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0504  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40 
 
 
285 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.720822 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0761  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  34.57 
 
 
368 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0093  Fe-S cluster domain protein  31.58 
 
 
460 aa  54.7  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000835421 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4164  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit A  36.23 
 
 
632 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>