240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0049 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0049  permease YjgP/YjgQ  100 
 
 		 367 aa  705    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0684  permease YjgP/YjgQ family protein  38.67 
 
 		 346 aa  204  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000671821  normal  0.0817909 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2345  permease YjgP/YjgQ family protein  41.01 
 
 		 346 aa  178  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  29.38 
 
 		 384 aa  100  3e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  27.64 
 
 		 356 aa  100  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  25.79 
 
 		 792 aa  90.9  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  25 
 
 		 359 aa  89.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  25.68 
 
 		 359 aa  89  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  25.2 
 
 		 1040 aa  88.2  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  27.24 
 
 		 358 aa  87.8  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  25.79 
 
 		 394 aa  87.4  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  26.83 
 
 		 391 aa  86.7  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  23.41 
 
 		 401 aa  85.9  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  21.63 
 
 		 401 aa  83.2  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  24.02 
 
 		 370 aa  83.2  0.000000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  28.04 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  22.92 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  28.1 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  26.72 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  21.24 
 
 		 386 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  22.87 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  23.58 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  21.39 
 
 		 1111 aa  77.4  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  21.62 
 
 		 1096 aa  77  0.0000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  23.32 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  27.03 
 
 		 495 aa  75.1  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  24.67 
 
 		 374 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  20.63 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  20.42 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  23.9 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0508  YjgP/YjgQ permease  23.93 
 
 		 396 aa  73.9  0.000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  26.49 
 
 		 418 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  21.85 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  23.32 
 
 		 1061 aa  73.6  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  26.67 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  22.85 
 
 		 1061 aa  72.4  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2176  permease YjgP/YjgQ  26.45 
 
 		 402 aa  72  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  24.81 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  20.26 
 
 		 391 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  24.35 
 
 		 360 aa  72  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  19.89 
 
 		 1153 aa  72  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  26.79 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1230  permease YjgP/YjgQ family protein  25.7 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.494831  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2209  permease YjgP/YjgQ family protein  27.83 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.145759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  24.42 
 
 		 382 aa  70.1  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  24.59 
 
 		 399 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1407  permease YjgP/YjgQ family protein  27.15 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  21.01 
 
 		 364 aa  67  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  19.51 
 
 		 357 aa  66.6  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  25.13 
 
 		 418 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  22.99 
 
 		 360 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  26.45 
 
 		 380 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1043  hypothetical protein  24.46 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0296445  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  23.27 
 
 		 395 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  22.71 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  26.18 
 
 		 423 aa  64.3  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  21.16 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  18.18 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  27.23 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  24.6 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  20.82 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1949  permease, putative  24.6 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000528059  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  27.19 
 
 		 366 aa  63.5  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 360 aa  62.8  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1247  permease  25.53 
 
 		 386 aa  62.8  0.000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  22.39 
 
 		 360 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  20.05 
 
 		 387 aa  62.8  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  26.53 
 
 		 357 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  27.51 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  24.61 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  22.76 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  22.69 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1544  permease YjgP/YjgQ family protein  24.6 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0685  permease YjgP/YjgQ family protein  27.94 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000242264  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  26.98 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  23.71 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2743  permease YjgP/YjgQ family protein  26.55 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.731454  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0044  permease YjgP/YjgQ family protein  21.61 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484166  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  22.37 
 
 		 364 aa  60.5  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  28.33 
 
 		 364 aa  60.5  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4924  permease YjgP/YjgQ family protein  25.84 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0496  permease YjgP/YjgQ  25.27 
 
 		 414 aa  59.7  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2900  permease  24.6 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675827  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  27.73 
 
 		 442 aa  59.7  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1059  permease YjgP/YjgQ family protein  21.51 
 
 		 498 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546166  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  22.16 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  22.16 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  23.36 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2177  permease YjgP/YjgQ  25.28 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  21.28 
 
 		 478 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  18.7 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1121  permease YjgP/YjgQ family protein  23.85 
 
 		 376 aa  57  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182226 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1212  permease YjgP/YjgQ family protein  22.25 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205645  decreased coverage  0.00000154162 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2728  permease YjgP/YjgQ family protein  25.15 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1068  permease YjgP/YjgQ family protein  23.03 
 
 		 393 aa  56.2  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.388378  hitchhiker  0.0000584929 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 379 aa  56.2  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0741  putative permease  23.61 
 
 		 388 aa  56.2  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3831  putative permease  28.38 
 
 		 389 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  22.19 
 
 		 359 aa  55.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44330  permease YjgP/YjgQ family  26.4 
 
 		 357 aa  55.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.504882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>