More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0264 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  100 
 
 
153 aa  303  5.0000000000000004e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  52.94 
 
 
155 aa  174  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  46.41 
 
 
154 aa  139  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  46.94 
 
 
149 aa  137  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  43.84 
 
 
147 aa  136  8.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  44.44 
 
 
153 aa  134  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  46.26 
 
 
149 aa  134  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  40.94 
 
 
152 aa  130  9e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  45.64 
 
 
154 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  40.27 
 
 
153 aa  127  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  40.27 
 
 
152 aa  125  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  42.66 
 
 
149 aa  123  8.000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  39.73 
 
 
149 aa  122  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  40.85 
 
 
152 aa  121  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  41.33 
 
 
153 aa  120  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  41.33 
 
 
153 aa  120  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  39.86 
 
 
154 aa  120  7e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  40.94 
 
 
150 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17501  IMP dehydrogenase-like protein  38.46 
 
 
156 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  38.46 
 
 
149 aa  117  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  36.73 
 
 
152 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  37.76 
 
 
151 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1879  CBS  37.41 
 
 
157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  35.86 
 
 
149 aa  114  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  38.78 
 
 
150 aa  114  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  40.41 
 
 
150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  39.31 
 
 
160 aa  111  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  37.41 
 
 
150 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  42.36 
 
 
153 aa  110  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  36.49 
 
 
223 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0774  CBS  34.69 
 
 
157 aa  108  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  39.72 
 
 
149 aa  108  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0960  CBS domain-containing protein  39.19 
 
 
153 aa  106  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0461508  hitchhiker  0.00174257 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  39.73 
 
 
151 aa  105  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  40.27 
 
 
246 aa  103  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  39.6 
 
 
246 aa  100  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  38.93 
 
 
230 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  38.93 
 
 
247 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  39.07 
 
 
230 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  39.33 
 
 
230 aa  97.4  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  40.13 
 
 
164 aa  95.9  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1925  CBS domain protein  39.16 
 
 
151 aa  95.9  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1597  CBS domain containing membrane protein  39.16 
 
 
151 aa  95.9  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.105679 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  34.01 
 
 
226 aa  94.7  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  39.04 
 
 
150 aa  94.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  36.6 
 
 
241 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  40.54 
 
 
229 aa  94.4  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  38.93 
 
 
231 aa  94  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  35.76 
 
 
228 aa  93.6  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  32.39 
 
 
148 aa  93.2  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  39.61 
 
 
158 aa  92  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  37.41 
 
 
231 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  35.17 
 
 
217 aa  91.3  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  32.89 
 
 
161 aa  89.7  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  39.33 
 
 
249 aa  90.1  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  36.65 
 
 
154 aa  88.6  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  32.45 
 
 
243 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  33.79 
 
 
232 aa  87  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  34.9 
 
 
242 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.77 
 
 
243 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  33.33 
 
 
233 aa  85.1  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  31.79 
 
 
242 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  32.19 
 
 
427 aa  84.3  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  36.18 
 
 
229 aa  84  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0640  CBS domain-containing protein  35.26 
 
 
150 aa  83.6  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  32.68 
 
 
242 aa  83.6  9e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  35.14 
 
 
845 aa  83.2  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  31.51 
 
 
132 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  33.99 
 
 
339 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  35.33 
 
 
339 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.6 
 
 
338 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  30 
 
 
243 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  32.19 
 
 
428 aa  80.5  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  32.28 
 
 
242 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  35.14 
 
 
243 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  32.89 
 
 
416 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  32.67 
 
 
410 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  35.1 
 
 
348 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2522  CBS domain containing membrane protein  39.04 
 
 
235 aa  79  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0807239 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  34.84 
 
 
226 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  32.43 
 
 
234 aa  78.2  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  33.55 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  31.51 
 
 
382 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  34.93 
 
 
236 aa  77.4  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  34 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  32.65 
 
 
224 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0164  CBS domain-containing protein  34.01 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00289218  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  32.41 
 
 
232 aa  76.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  30.82 
 
 
368 aa  75.5  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  32.21 
 
 
423 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  30.41 
 
 
378 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  30.82 
 
 
382 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  31.94 
 
 
261 aa  75.1  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  35.42 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0970  CBS domain-containing protein  27.45 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  34.23 
 
 
256 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  27.52 
 
 
379 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1797  CBS domain-containing protein  33.78 
 
 
279 aa  74.3  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.966854  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  37.5 
 
 
208 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  30.46 
 
 
373 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>