More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2890 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2890  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  100 
 
 		 399 aa  803    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.447222  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0601  secretion protein HlyD  54.4 
 
 		 406 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.986761  normal  0.63228 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1232  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  50.71 
 
 		 444 aa  356  5e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000100981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3640  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  49.6 
 
 		 434 aa  329  4e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.800892  normal  0.900704 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2093  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  44.19 
 
 		 428 aa  328  8e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000985853 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2249  secretion protein HlyD  46.84 
 
 		 399 aa  323  4e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0210413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0010  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  44.21 
 
 		 439 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.860595 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2587  secretion protein HlyD  43.26 
 
 		 400 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.897533  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4446  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  48.7 
 
 		 399 aa  307  2.0000000000000002e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4103  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  42.04 
 
 		 408 aa  293  3e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.816007  normal  0.780206 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3752  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  42.96 
 
 		 438 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3801  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  42.89 
 
 		 438 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3919  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  42.61 
 
 		 414 aa  280  5e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2731  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  40.28 
 
 		 607 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1431  secretion protein HlyD  40.45 
 
 		 361 aa  255  8e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0092  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  35.5 
 
 		 479 aa  241  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3586  secretion protein HlyD  35.82 
 
 		 474 aa  236  6e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.659041  normal  0.0297067 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0330  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  36.96 
 
 		 398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1224  ABC-transporter membrane fusion protein  34.9 
 
 		 366 aa  157  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.677987 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2782  multidrug resistance efflux pump-like  30.64 
 
 		 401 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000623045 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10151  ABC transporter  27.84 
 
 		 339 aa  123  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.279055  normal  0.0324657 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  30.89 
 
 		 345 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16591  ABC transporter  36.54 
 
 		 294 aa  111  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.501795 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0152  DevB-like secretion protein  26.38 
 
 		 305 aa  109  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1252  ABC transporter  38.46 
 
 		 304 aa  105  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07841  ABC transporter  25.51 
 
 		 305 aa  103  7e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.519134  normal  0.581316 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0756  ABC transporter component-like  40.15 
 
 		 304 aa  97.1  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.270032  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08091  ABC transporter  40.15 
 
 		 304 aa  96.3  8e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.600867  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08081  ABC transporter  39.39 
 
 		 304 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08361  ABC transporter  37.5 
 
 		 303 aa  90.5  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3892  secretion protein HlyD family protein  29.6 
 
 		 352 aa  83.2  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.38 
 
 		 432 aa  81.6  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  28.73 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1217  ABC transporter  34.27 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.394025  normal  0.703789 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  27.04 
 
 		 500 aa  76.6  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.74 
 
 		 467 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  26.67 
 
 		 517 aa  72.8  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  27.61 
 
 		 335 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  27.86 
 
 		 371 aa  72.8  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  24.73 
 
 		 607 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  24.61 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  24.61 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0452  secretion protein HlyD family protein  27.34 
 
 		 375 aa  71.2  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  25.58 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  26.91 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  29.6 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.33 
 
 		 504 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3085  secretion protein HlyD family protein  25.59 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22636  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7064  hypothetical protein  25.51 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333673  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  27.12 
 
 		 489 aa  69.7  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.49 
 
 		 496 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  30.43 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  28.02 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  31.23 
 
 		 395 aa  67.8  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1985  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.7 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1203  RND family efflux transporter MFP subunit  34.31 
 
 		 621 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3253  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.15 
 
 		 496 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.67 
 
 		 471 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  25.6 
 
 		 509 aa  65.1  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  30.57 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  25.08 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.41 
 
 		 500 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4577  secretion protein HlyD  28.92 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.231546  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0628  secretion protein HlyD family protein  26.95 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.44 
 
 		 435 aa  63.9  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2328  secretion protein HlyD  25 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.96 
 
 		 505 aa  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  26.73 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  24.65 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  26.32 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  26.32 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  26.32 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  25.98 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  30.6 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6436  secretion protein HlyD family protein  27.65 
 
 		 392 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  24.92 
 
 		 344 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  26.67 
 
 		 383 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  24.72 
 
 		 411 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2112  secretion protein HlyD family protein  26.92 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000135214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  25.09 
 
 		 349 aa  62  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.73 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  25.48 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3703  HlyD family secretion protein  26.8 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  28.35 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0825  hypothetical protein  27.94 
 
 		 364 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  26.05 
 
 		 363 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1211  secretion protein HlyD family protein  25.85 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0109615 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  24.74 
 
 		 467 aa  60.5  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0165  secretion protein HlyD family protein  32.06 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1008  secretion protein HlyD  23.51 
 
 		 463 aa  60.1  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  25.95 
 
 		 353 aa  59.7  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  24.47 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.31 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  24.47 
 
 		 349 aa  59.3  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  28.24 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  25.88 
 
 		 331 aa  59.3  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  26.86 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  24.91 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20080  hypothetical protein  26.45 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1021  multidrug resistance protein VceA  27.27 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>