More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2920 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 371 aa  752    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  55.11 
 
 		 372 aa  443  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5641  ABC-2 type transporter  60.05 
 
 		 372 aa  442  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.350445 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  45.41 
 
 		 379 aa  328  8e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1078  putative ABC transport system, membrane protein  46.74 
 
 		 373 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  34.59 
 
 		 377 aa  219  5e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  34.32 
 
 		 376 aa  211  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  34.21 
 
 		 376 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 376 aa  208  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  35.1 
 
 		 376 aa  206  7e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  33.83 
 
 		 373 aa  205  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  33.61 
 
 		 372 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  31.61 
 
 		 370 aa  202  6e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  34.6 
 
 		 376 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  32.8 
 
 		 376 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  32.97 
 
 		 369 aa  194  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  30.12 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  30.03 
 
 		 370 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  32.44 
 
 		 375 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  31.15 
 
 		 370 aa  188  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  33.52 
 
 		 369 aa  186  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  31.71 
 
 		 371 aa  186  5e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  28.82 
 
 		 368 aa  186  6e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  28.82 
 
 		 368 aa  186  6e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  28.82 
 
 		 368 aa  186  6e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  28.82 
 
 		 368 aa  186  6e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  28.82 
 
 		 368 aa  186  6e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  28.82 
 
 		 368 aa  186  6e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  28.82 
 
 		 368 aa  186  6e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  28.69 
 
 		 368 aa  186  6e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  28.82 
 
 		 368 aa  186  6e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  30.16 
 
 		 388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  30.19 
 
 		 387 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  28.76 
 
 		 368 aa  182  9.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  28.76 
 
 		 368 aa  182  9.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  28.81 
 
 		 381 aa  182  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  29.75 
 
 		 368 aa  181  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  30.75 
 
 		 378 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  29.54 
 
 		 383 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8101  ABC-2 type transporter  29.46 
 
 		 368 aa  180  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  29.2 
 
 		 370 aa  180  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  29.92 
 
 		 383 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  29.54 
 
 		 383 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  29.36 
 
 		 384 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  29.2 
 
 		 369 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  27.54 
 
 		 368 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  27.54 
 
 		 368 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  27.54 
 
 		 368 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  27.54 
 
 		 368 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  27.54 
 
 		 368 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  27.54 
 
 		 368 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  29.09 
 
 		 384 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 		 378 aa  177  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.81 
 
 		 384 aa  176  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  31.04 
 
 		 374 aa  176  8e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2837  ABC-2 type transporter  28.37 
 
 		 370 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.273381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  28.19 
 
 		 366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  30.25 
 
 		 376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  28.85 
 
 		 377 aa  173  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  28.53 
 
 		 378 aa  173  5e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  29.62 
 
 		 379 aa  173  5.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  29.09 
 
 		 379 aa  172  6.999999999999999e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  29.28 
 
 		 382 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  29.86 
 
 		 378 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0920  ABC-2 type transporter  36.8 
 
 		 376 aa  170  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518017 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  29.16 
 
 		 376 aa  170  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  28.73 
 
 		 376 aa  170  4e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  27.82 
 
 		 379 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  30.12 
 
 		 384 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  29.23 
 
 		 376 aa  169  6e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  27.32 
 
 		 382 aa  169  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  29.97 
 
 		 371 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  28.34 
 
 		 378 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  30.53 
 
 		 380 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  27.2 
 
 		 378 aa  166  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  31.21 
 
 		 372 aa  167  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3040  hypothetical protein  31.74 
 
 		 371 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  27.81 
 
 		 378 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1017  ABC-2 type transporter  31.21 
 
 		 372 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  29.57 
 
 		 374 aa  165  9e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1302  ABC-2 type transporter  30.92 
 
 		 372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  28.37 
 
 		 370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  28.49 
 
 		 377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2484  ABC-2 type transporter  30.21 
 
 		 371 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1082  ABC-2 type transport system permease protein  30.39 
 
 		 378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2863  ABC transporter, permease protein, putative  30.21 
 
 		 371 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.633584  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  28.81 
 
 		 367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4663  ABC-2 type transporter  29.54 
 
 		 390 aa  164  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000515456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  28.93 
 
 		 366 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1781  ABC transporter, inner membrane subunit  30 
 
 		 365 aa  162  6e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2864  ABC transporter, permease protein, putative  29.48 
 
 		 369 aa  162  9e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141451  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2485  ABC-2 type transporter  29.48 
 
 		 369 aa  162  9e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1782  ABC-2 type transporter  32.33 
 
 		 364 aa  162  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  27.65 
 
 		 371 aa  161  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  28.49 
 
 		 377 aa  162  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  27.2 
 
 		 380 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 368 aa  161  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  27.55 
 
 		 369 aa  161  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1294  ABC transporter, ATP-binding protein  27.06 
 
 		 378 aa  161  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>