100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2160 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3894  coagulation factor 5/8 type domain protein  48.43 
 
 		 688 aa  673    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1415  coagulation factor 5/8 type domain protein  52.24 
 
 		 698 aa  753    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2160  Alpha-L-fucosidase  100 
 
 		 690 aa  1436    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2028  Alpha-L-fucosidase  51.08 
 
 		 704 aa  748    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6558  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.95 
 
 		 687 aa  614  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00192951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0846  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.17 
 
 		 704 aa  554  1e-156  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0392  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.71 
 
 		 709 aa  515  1e-144  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2423  twin-arginine translocation pathway signal  39.11 
 
 		 638 aa  460  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01697  F5/8 type C domain protein  37.81 
 
 		 581 aa  450  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  44.02 
 
 		 932 aa  443  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0308  Alpha-L-fucosidase  46.12 
 
 		 463 aa  436  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  42.86 
 
 		 750 aa  438  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2596  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.89 
 
 		 487 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1750  alpha-1,3/4-fucosidase, putative  43.13 
 
 		 606 aa  386  1e-106  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3028  Alpha-L-fucosidase  42.05 
 
 		 470 aa  380  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0086  alpha-L-fucosidase  35.27 
 
 		 460 aa  298  2e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0072  Alpha-L-fucosidase  34.85 
 
 		 460 aa  291  2e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12980  alpha-L-fucosidase  34.54 
 
 		 434 aa  267  5e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194467  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1447  Alpha-L-fucosidase  37.07 
 
 		 410 aa  241  5e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0652  F5/8 type C domain-containing protein  28.63 
 
 		 436 aa  183  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0313432  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0640  F5/8 type C domain-containing protein  28.22 
 
 		 436 aa  182  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6474  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.74 
 
 		 467 aa  170  7e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.904376  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2190  Alpha-L-fucosidase  31.44 
 
 		 435 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3023  Alpha-L-fucosidase  29.29 
 
 		 435 aa  114  9e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.202324  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5348  Alpha-L-fucosidase  31.29 
 
 		 440 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.559613 
 
 
-
 
NC_002950  PG1884  alpha-L-fucosidase precursor, putative  30.09 
 
 		 674 aa  106  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1903  Alpha-L-fucosidase  30.98 
 
 		 431 aa  106  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2796  Alpha-L-fucosidase  36.92 
 
 		 581 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0019  Alpha-L-fucosidase  30.61 
 
 		 441 aa  105  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3943  Alpha-L-fucosidase  28.2 
 
 		 429 aa  105  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6806  Alpha-L-fucosidase  30.21 
 
 		 452 aa  97.4  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  hitchhiker  0.00000369598 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13010  alpha-L-fucosidase  25.71 
 
 		 445 aa  96.7  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0825018  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3615  Alpha-L-fucosidase  28.85 
 
 		 429 aa  96.3  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.669923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0130  Alpha-L-fucosidase  33.33 
 
 		 450 aa  95.9  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159466  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3540  Alpha-L-fucosidase  24.01 
 
 		 340 aa  95.5  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2841  Alpha-L-fucosidase  27.25 
 
 		 473 aa  94.4  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  hitchhiker  0.00495105 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0480  alpha-L-fucosidase family protein  31.11 
 
 		 478 aa  93.6  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00391877  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1127  Alpha-L-fucosidase  27.27 
 
 		 479 aa  93.6  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.95278 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2595  Alpha-L-fucosidase  27.33 
 
 		 473 aa  92.8  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0146  Alpha-L-fucosidase  30.94 
 
 		 711 aa  92.4  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2596  Alpha-L-fucosidase  36.3 
 
 		 447 aa  92  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000031745  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.52 
 
 		 1289 aa  91.3  6e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2703  Alpha-L-fucosidase  25.89 
 
 		 596 aa  88.2  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0010  Alpha-L-fucosidase  24.04 
 
 		 538 aa  87.4  9e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.886548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05120  alpha-L-fucosidase  32.81 
 
 		 474 aa  85.5  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2693  Alpha-L-fucosidase  29.1 
 
 		 479 aa  85.5  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101343  hitchhiker  0.00474294 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3264  Alpha-L-fucosidase  25 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.868809 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7054  Alpha-L-fucosidase  36.62 
 
 		 485 aa  84.3  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000348467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2040  Alpha-L-fucosidase  34.04 
 
 		 494 aa  84.3  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.983344  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2842  Alpha-L-fucosidase  32 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471674 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0611  Alpha-L-fucosidase  40.16 
 
 		 446 aa  79  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.620777  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3467  Alpha-L-fucosidase  32.61 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.565754 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0625  Alpha-L-fucosidase  38.52 
 
 		 446 aa  77  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2695  Alpha-L-fucosidase  33.33 
 
 		 627 aa  71.2  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000601937  normal  0.037659 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1483  Alpha-L-fucosidase  24.67 
 
 		 482 aa  67.4  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000503275  normal  0.454676 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2972  Alpha-L-fucosidase  34.51 
 
 		 490 aa  65.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1916  Alpha-L-fucosidase  25.23 
 
 		 446 aa  65.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0886  Alpha-L-fucosidase  28.89 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105586  normal  0.109873 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2605  Alpha-L-fucosidase  33.33 
 
 		 463 aa  63.9  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00783953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  29.22 
 
 		 644 aa  62.4  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2045  Alpha-L-fucosidase  28.28 
 
 		 464 aa  62  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  normal  0.344897 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0802  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L-fucosidase)  42.11 
 
 		 495 aa  61.6  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.06 
 
 		 1329 aa  61.6  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.65 
 
 		 1264 aa  60.5  0.00000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0823  Alpha-L-fucosidase  23.55 
 
 		 534 aa  60.5  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000144391  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0390  Alpha-L-fucosidase  37.33 
 
 		 484 aa  60.5  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0617324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  27.69 
 
 		 1967 aa  59.3  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0902  Alpha-L-fucosidase  40 
 
 		 505 aa  58.2  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4476  Alpha-L-fucosidase  36.03 
 
 		 731 aa  57.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766125  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2814  Alpha-L-fucosidase  36.49 
 
 		 471 aa  57.4  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.547268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2554  Alpha-L-fucosidase  37.84 
 
 		 478 aa  56.6  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0869924  normal  0.838653 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0831  Alpha-L-fucosidase  36 
 
 		 537 aa  55.1  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000199076  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01643  alpha-L-fucosidase  37.33 
 
 		 532 aa  54.3  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20303  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2169  Alpha-L-fucosidase  38.67 
 
 		 584 aa  53.5  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.600207  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  40.85 
 
 		 758 aa  53.9  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2262  Alpha-L-fucosidase  38.67 
 
 		 606 aa  53.5  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  35 
 
 		 850 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0435  alpha-L-fucosidase  32.65 
 
 		 212 aa  52  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7366  phospholipase C, phosphocholine-specific  32.65 
 
 		 805 aa  52  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0992  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.03 
 
 		 1056 aa  51.6  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2312  Alpha-L-fucosidase  28.95 
 
 		 466 aa  51.6  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.931291  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1301  glycosyl hydrolase family 31 protein  33.33 
 
 		 1965 aa  50.8  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.449133  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0315  Alpha-L-fucosidase  30.39 
 
 		 464 aa  50.1  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4875  Alpha-L-fucosidase  31.36 
 
 		 483 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185578  normal  0.768755 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00800  alpha-L-fucosidase  42.86 
 
 		 474 aa  49.3  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1160  hypothetical protein  46.3 
 
 		 1657 aa  48.9  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  30.17 
 
 		 663 aa  47.8  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0829  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.62 
 
 		 790 aa  47  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.889432  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29821  predicted protein  31.17 
 
 		 473 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.979957  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1885  S-layer domain protein  31.45 
 
 		 591 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.726885  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.59 
 
 		 812 aa  46.2  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  43.06 
 
 		 736 aa  46.2  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4324  coagulation factor 5/8 type, C-terminal  27.62 
 
 		 223 aa  45.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.010102  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.07 
 
 		 812 aa  45.8  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  34.18 
 
 		 1471 aa  45.8  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  42.22 
 
 		 14944 aa  45.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0850  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  33.96 
 
 		 2095 aa  44.7  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.871673  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1472  putative alpha-N-acetylgalactosaminidase  29.7 
 
 		 1588 aa  45.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39282  predicted protein  30.67 
 
 		 492 aa  44.3  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.218149  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3167  S-layer domain-containing protein  33.7 
 
 		 637 aa  44.7  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>