More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3230 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  100 
 
 		 312 aa  612  9.999999999999999e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  80.91 
 
 		 255 aa  364  1e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  76.5 
 
 		 264 aa  361  7.0000000000000005e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  74.68 
 
 		 288 aa  345  5e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  67.87 
 
 		 259 aa  343  2.9999999999999997e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  67.93 
 
 		 266 aa  323  2e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  65.45 
 
 		 253 aa  323  3e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  73.93 
 
 		 302 aa  322  5e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  66.26 
 
 		 455 aa  317  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  63.27 
 
 		 277 aa  314  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  61.74 
 
 		 262 aa  313  1.9999999999999998e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  64.02 
 
 		 264 aa  311  7.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  66.09 
 
 		 247 aa  311  1e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  66.09 
 
 		 250 aa  308  8e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  61.38 
 
 		 256 aa  307  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  67.4 
 
 		 445 aa  306  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  61.9 
 
 		 255 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  63.29 
 
 		 255 aa  305  5.0000000000000004e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  65.67 
 
 		 256 aa  305  7e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  61.51 
 
 		 258 aa  302  4.0000000000000003e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  63.56 
 
 		 291 aa  300  2e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  63.87 
 
 		 280 aa  298  5e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  63.6 
 
 		 277 aa  298  7e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  63.6 
 
 		 255 aa  297  1e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  63.6 
 
 		 255 aa  296  4e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  65.78 
 
 		 253 aa  294  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  64.35 
 
 		 244 aa  293  4e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  61.57 
 
 		 247 aa  291  9e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  56.59 
 
 		 263 aa  291  9e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  66.53 
 
 		 257 aa  291  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  62.93 
 
 		 252 aa  290  3e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  60 
 
 		 258 aa  285  5e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  63.6 
 
 		 261 aa  285  5.999999999999999e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  60.09 
 
 		 271 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  58 
 
 		 274 aa  282  6.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  55.51 
 
 		 279 aa  279  4e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  61.9 
 
 		 268 aa  279  4e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  61.29 
 
 		 258 aa  278  6e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  61.74 
 
 		 258 aa  278  8e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  66.39 
 
 		 258 aa  275  7e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  62.28 
 
 		 256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  60.89 
 
 		 243 aa  273  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  65.57 
 
 		 250 aa  272  6e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  57.74 
 
 		 252 aa  270  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  57.08 
 
 		 269 aa  269  4e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  60.18 
 
 		 245 aa  268  8e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  58.01 
 
 		 266 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  59.23 
 
 		 293 aa  264  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  60.94 
 
 		 257 aa  261  8.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  54.51 
 
 		 279 aa  258  7e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  55.6 
 
 		 245 aa  256  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  61.21 
 
 		 277 aa  256  4e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  60.62 
 
 		 255 aa  256  5e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  57.5 
 
 		 271 aa  251  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  55.65 
 
 		 253 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  58.44 
 
 		 241 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  59.28 
 
 		 272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  56.84 
 
 		 249 aa  239  4e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  51.98 
 
 		 244 aa  235  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  57.34 
 
 		 243 aa  233  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  47.17 
 
 		 228 aa  232  6e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  59.32 
 
 		 249 aa  232  6e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  51.72 
 
 		 279 aa  230  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  49.76 
 
 		 225 aa  228  7e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  50.64 
 
 		 239 aa  228  8e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  45.26 
 
 		 240 aa  228  1e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  57.33 
 
 		 269 aa  225  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  48.71 
 
 		 241 aa  224  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  45.5 
 
 		 227 aa  223  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  44.09 
 
 		 230 aa  221  1.9999999999999999e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  47.71 
 
 		 225 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  50.72 
 
 		 222 aa  220  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  51.13 
 
 		 240 aa  220  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  50.45 
 
 		 252 aa  219  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  58.65 
 
 		 224 aa  220  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2703  ABC transporter related  46.02 
 
 		 255 aa  219  6e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3270  ABC transporter-like protein  50.66 
 
 		 248 aa  219  6e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.180128 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  48.61 
 
 		 235 aa  218  7.999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  51.93 
 
 		 255 aa  218  7.999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3149  ABC transporter related  52.25 
 
 		 563 aa  218  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  47.69 
 
 		 225 aa  217  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  42.41 
 
 		 226 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  44.29 
 
 		 229 aa  216  4e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  49.55 
 
 		 266 aa  216  5e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  49.36 
 
 		 240 aa  216  5e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  53.07 
 
 		 248 aa  216  5.9999999999999996e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  48.64 
 
 		 252 aa  215  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2457  ABC transporter related protein  55.11 
 
 		 247 aa  214  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0887865  hitchhiker  0.00000290657 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  49.55 
 
 		 235 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  53.28 
 
 		 247 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  45.21 
 
 		 229 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  46.15 
 
 		 238 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  47.91 
 
 		 226 aa  213  2.9999999999999995e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  45.7 
 
 		 230 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  48.66 
 
 		 242 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  46.75 
 
 		 239 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  45.98 
 
 		 230 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  51.08 
 
 		 233 aa  212  4.9999999999999996e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  50.22 
 
 		 240 aa  212  4.9999999999999996e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  45.87 
 
 		 230 aa  212  7e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>