More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0773 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  100 
 
 
256 aa  505  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1987  NLP/P60 protein  53.33 
 
 
271 aa  258  5.0000000000000005e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  53.28 
 
 
259 aa  225  4e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30760  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  54.37 
 
 
261 aa  222  4e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787895  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0883  NLP/P60 protein  47.49 
 
 
257 aa  198  7.999999999999999e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2843  NLP/P60 protein  46.24 
 
 
251 aa  189  5e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4554  NLP/P60 protein  43.32 
 
 
286 aa  155  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2429  NLP/P60 protein  59.63 
 
 
278 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.328079 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3552  NLP/P60 protein  58.77 
 
 
297 aa  142  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.01109  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0796  NLP/P60 protein  38.68 
 
 
246 aa  122  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09120  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  50 
 
 
313 aa  122  7e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0122  NLP/P60 protein  49.53 
 
 
264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  53.12 
 
 
556 aa  112  5e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2986  NLP/P60 protein  50.86 
 
 
216 aa  108  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120192 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  45.28 
 
 
391 aa  107  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  39.87 
 
 
367 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  41.45 
 
 
333 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  50 
 
 
265 aa  106  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  45.69 
 
 
368 aa  106  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  41.04 
 
 
257 aa  105  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  41.86 
 
 
392 aa  105  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  41.45 
 
 
327 aa  105  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  51.02 
 
 
432 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  46.94 
 
 
524 aa  104  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  51.02 
 
 
432 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  47.73 
 
 
291 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  53.49 
 
 
317 aa  102  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  37.91 
 
 
368 aa  101  9e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  48.04 
 
 
332 aa  102  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  36.08 
 
 
197 aa  101  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  55.95 
 
 
335 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  46.6 
 
 
270 aa  100  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  46.67 
 
 
318 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  41.1 
 
 
232 aa  99.8  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  45.19 
 
 
535 aa  99.4  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.17 
 
 
176 aa  97.8  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  40.35 
 
 
331 aa  95.1  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  40.15 
 
 
274 aa  94.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  41.35 
 
 
337 aa  95.1  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  40.17 
 
 
476 aa  94.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  39.2 
 
 
217 aa  94.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  44.67 
 
 
325 aa  94  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  39.85 
 
 
325 aa  93.2  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0913  NLP/P60 protein  37.63 
 
 
200 aa  93.2  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1786  cell wall-associated hydrolase  48.89 
 
 
246 aa  92.8  5e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  32.61 
 
 
210 aa  92.8  5e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.72 
 
 
280 aa  92.8  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  36.03 
 
 
1048 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2976  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  45.71 
 
 
523 aa  92  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  47.73 
 
 
216 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  39.37 
 
 
298 aa  91.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  38.39 
 
 
333 aa  90.9  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  44.44 
 
 
370 aa  90.9  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  43.96 
 
 
150 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  44.57 
 
 
337 aa  90.9  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  50 
 
 
208 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  44.55 
 
 
235 aa  90.1  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  42.22 
 
 
340 aa  90.1  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  38.93 
 
 
204 aa  89.7  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  34.07 
 
 
307 aa  89.7  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  42.98 
 
 
487 aa  89.7  4e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  38.05 
 
 
178 aa  89.7  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  43.93 
 
 
349 aa  89.7  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4593  NLP/P60 protein  50 
 
 
269 aa  89.4  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00530725  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  43.75 
 
 
400 aa  89.4  6e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  42.71 
 
 
306 aa  89  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  40.57 
 
 
417 aa  89  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  42.86 
 
 
350 aa  88.6  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0399  NlpC/P60 family protein  49.49 
 
 
240 aa  87.8  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  40.2 
 
 
335 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5736  NLP/P60 protein  41.96 
 
 
326 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  41.18 
 
 
347 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  38.53 
 
 
333 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  38.53 
 
 
333 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  36.28 
 
 
150 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  40.57 
 
 
459 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  40.4 
 
 
333 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2022  NLP/P60 protein  42.73 
 
 
242 aa  87.4  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.321386 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  39.81 
 
 
452 aa  87  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  37.5 
 
 
333 aa  86.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  37.5 
 
 
333 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  40.54 
 
 
319 aa  86.7  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  40 
 
 
338 aa  86.3  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  37.5 
 
 
333 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  31.39 
 
 
342 aa  85.9  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  40.87 
 
 
226 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  41.07 
 
 
273 aa  85.9  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  40.34 
 
 
366 aa  85.9  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  37.5 
 
 
333 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  37.96 
 
 
225 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  44.83 
 
 
366 aa  85.5  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  37.5 
 
 
333 aa  85.5  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  40.38 
 
 
424 aa  85.5  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  37.86 
 
 
333 aa  85.1  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  38.61 
 
 
269 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  35.37 
 
 
242 aa  84.7  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0577  NLP/P60 protein  38.35 
 
 
242 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  38.98 
 
 
341 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.26 
 
 
372 aa  84.7  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  33.55 
 
 
192 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>