More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8691 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8691  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 155 aa  312  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  50.88 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1275  hypothetical protein  48.06 
 
 		 160 aa  104  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  47.15 
 
 		 142 aa  100  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  44.03 
 
 		 156 aa  97.4  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4490  hypothetical protein  43.33 
 
 		 154 aa  89.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 149 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2058  transcriptional regulator, MarR family  39.53 
 
 		 170 aa  84  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  48.11 
 
 		 134 aa  84.3  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 149 aa  83.6  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8160  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.469151 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3906  transcriptional regulator, MarR family  37.21 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0945  transcriptional regulator, MarR family  40.83 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  41.03 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  40.17 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7225  transcriptional regulator, MarR family  38.18 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  42.59 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0144  transcriptional regulator, MarR family  38.33 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  40.95 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  40.37 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  38.26 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  38.66 
 
 		 175 aa  67.4  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  40.95 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  37.38 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01640  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98097  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  42.05 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0148  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0520  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  35.24 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3552  transcriptional regulator, MarR family  34.26 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0984354 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  37.38 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2001  MarR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.803243  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  38.53 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 163 aa  57  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18710  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.332753 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 233 aa  57  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2376  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679791  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  37.07 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  35.25 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  37.78 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2070  transcriptional regulator, MarR family  33.63 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  40.32 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0136  MarR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0145  MarR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753357  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0126  MarR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  35.85 
 
 		 194 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  36.28 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0701  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255287  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  36.19 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3797  transcriptional regulator, MarR family  37.25 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.803773  hitchhiker  0.000221567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 184 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24880  transcriptional regulator  36.13 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2322  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 193 aa  51.2  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000287638  decreased coverage  0.000001019 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 165 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2423  transcriptional regulator, MarR family  35.23 
 
 		 152 aa  51.2  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1308  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 157 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 157 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2410  transcriptional regulator, MarR family  45.21 
 
 		 163 aa  50.8  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0478881  normal  0.0157959 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  26.74 
 
 		 147 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  37.97 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  33.33 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12510  transcriptional regulator  36.97 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  37.8 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 167 aa  49.7  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 172 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  33.63 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0683  transcriptional regulator, MarR family protein  31.19 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  35.51 
 
 		 197 aa  49.7  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  27.68 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2628  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.184393  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  27.37 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00960  transcriptional regulator  28.97 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  25.26 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  29.89 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  29.89 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 148 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>