More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4701 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 230 aa  474  1e-133  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0329  putative ABC transport system, ATP-binding protein  82.74 
 
 		 226 aa  400  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0956  ABC transporter related  62.5 
 
 		 229 aa  307  6.999999999999999e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4589  ABC transporter related protein  60.81 
 
 		 225 aa  294  7e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00504379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4838  ABC transporter related  60.99 
 
 		 225 aa  292  3e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0685  ABC transporter, ATP-binding protein  59.17 
 
 		 219 aa  281  4.0000000000000003e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246956 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1330  ABC transporter related  56.95 
 
 		 235 aa  275  6e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.514657  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2600  ABC transporter related  57.08 
 
 		 227 aa  270  2e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  55.56 
 
 		 234 aa  265  2.9999999999999995e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3506  ABC transporter, ATP-binding protein  55.71 
 
 		 238 aa  264  8.999999999999999e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  54.55 
 
 		 220 aa  264  8.999999999999999e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0471  ABC transporter related  56.5 
 
 		 236 aa  264  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  55.09 
 
 		 220 aa  259  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  54.95 
 
 		 240 aa  255  5e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0095  ABC transporter related  52.94 
 
 		 235 aa  251  8.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2864  ABC transporter related  52.97 
 
 		 230 aa  250  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3364  ABC transporter related  51.6 
 
 		 243 aa  248  4e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0080  ABC transporter related  52.49 
 
 		 235 aa  248  5e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3692  ABC transporter, ATP-binding protein  52.05 
 
 		 246 aa  248  6e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3722  ABC transporter related  52.05 
 
 		 263 aa  248  6e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.323053 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0863  ABC transporter related  52.05 
 
 		 246 aa  248  8e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3159  ABC transporter related  52.05 
 
 		 246 aa  248  8e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3260  ABC transporter related  52.05 
 
 		 246 aa  248  8e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4072  ABC transporter related  52.05 
 
 		 253 aa  247  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 236 aa  246  2e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2991  ABC transporter related  51.6 
 
 		 246 aa  244  6e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0998  ABC transporter related  51.14 
 
 		 247 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1019  ABC transporter related  51.14 
 
 		 247 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3341  ABC transporter related  51.14 
 
 		 247 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1031  ABC transporter related  51.14 
 
 		 246 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0898  ABC transporter related  50.68 
 
 		 232 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0573  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 253 aa  240  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0308  ABC transporter ATP-binding protein  50.22 
 
 		 237 aa  241  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0332817 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  50.88 
 
 		 233 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0723  ABC transporter-related protein  50.23 
 
 		 240 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2850  ABC transporter related  49.32 
 
 		 240 aa  238  9e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  51.83 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  47.71 
 
 		 246 aa  236  3e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  46.19 
 
 		 230 aa  234  8e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  47.95 
 
 		 225 aa  232  4.0000000000000004e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  47.75 
 
 		 653 aa  231  7.000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  48.05 
 
 		 235 aa  231  7.000000000000001e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  47.03 
 
 		 230 aa  230  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2119  ABC transporter, ATP-binding protein  52.04 
 
 		 241 aa  229  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3374  ABC efflux transporter, ATPase subunit  54.77 
 
 		 211 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  49.32 
 
 		 225 aa  229  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  47.95 
 
 		 236 aa  229  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4416  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 244 aa  229  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2042  ABC transporter-related protein  50.68 
 
 		 236 aa  228  5e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3501  ABC transporter related  46.79 
 
 		 241 aa  228  6e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  47.06 
 
 		 266 aa  228  7e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  46.09 
 
 		 252 aa  227  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  48.17 
 
 		 228 aa  227  1e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  47.75 
 
 		 229 aa  227  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0282  ABC transporter, ATP-binding protein  48.18 
 
 		 223 aa  226  2e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  46.19 
 
 		 236 aa  226  2e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  46.36 
 
 		 237 aa  226  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  48.15 
 
 		 238 aa  226  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  47.11 
 
 		 235 aa  225  4e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  50.23 
 
 		 238 aa  225  4e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  48.61 
 
 		 244 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  48.17 
 
 		 242 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  46.4 
 
 		 230 aa  224  7e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  44.84 
 
 		 242 aa  224  9e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0961  ABC transporter related  48.4 
 
 		 220 aa  224  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000589963  normal  0.143962 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  47.75 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  46.19 
 
 		 232 aa  222  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  48.17 
 
 		 226 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  48.17 
 
 		 226 aa  222  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  48.17 
 
 		 226 aa  222  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  47.71 
 
 		 226 aa  222  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0775  ABC transporter, ATP-binding protein  48.47 
 
 		 243 aa  222  4e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  46.58 
 
 		 224 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  46.19 
 
 		 239 aa  222  4.9999999999999996e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 		 226 aa  221  6e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  47.71 
 
 		 226 aa  221  6e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 		 226 aa  221  6e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 		 226 aa  221  6e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  47.71 
 
 		 226 aa  221  6e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  46.79 
 
 		 237 aa  221  7e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 		 226 aa  221  7e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  46.26 
 
 		 241 aa  221  8e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  45.83 
 
 		 229 aa  221  8e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  43.95 
 
 		 228 aa  221  9e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  47.25 
 
 		 226 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  46.33 
 
 		 227 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.45 
 
 		 647 aa  220  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  47.25 
 
 		 253 aa  220  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  47.58 
 
 		 235 aa  220  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 		 226 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  46.36 
 
 		 224 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  47.25 
 
 		 253 aa  219  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  45.81 
 
 		 241 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2478  ABC transporter ATP-binding protein  47.71 
 
 		 222 aa  219  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.866087  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3549  ABC transporter related  48.4 
 
 		 255 aa  219  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0951  ABC transporter related  48.18 
 
 		 234 aa  219  3e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  46.58 
 
 		 224 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3004  ABC transporter ATP-binding protein  47.71 
 
 		 222 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000190264  hitchhiker  0.00000432285 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  46.58 
 
 		 224 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2576  ABC transporter related  47.71 
 
 		 222 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>