More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0617 on replicon NC_009795
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009795  CCC13826_0617  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 329 aa  668    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0000798153  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1094  phage integrase family site specific recombinase  40.09 
 
 		 223 aa  146  6e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.331299  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0872  hypothetical protein  31.87 
 
 		 286 aa  145  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000507301  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3749  phage integrase family protein  28.96 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00852374  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  27.89 
 
 		 295 aa  105  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1991  metallo-beta-lactamase family protein  29.69 
 
 		 353 aa  97.8  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0843  phage integrase family site specific recombinase  28.98 
 
 		 354 aa  97.4  3e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00824905  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0105  hydrogenase expression/formation protein  30.77 
 
 		 354 aa  96.3  6e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2090  transport protein  30.77 
 
 		 353 aa  96.3  6e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0326537  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1132  phage integrase family site specific recombinase  30.93 
 
 		 352 aa  95.1  1e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0950  phage integrase family site specific recombinase  30.89 
 
 		 354 aa  90.1  5e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0218535  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0879  phage integrase family site specific recombinase  30.89 
 
 		 354 aa  90.1  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.159654  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1012  phage integrase family site specific recombinase  30.89 
 
 		 354 aa  89.4  7e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000959514  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1268  integrase family protein  27.54 
 
 		 353 aa  89.4  7e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  24.09 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  27.87 
 
 		 295 aa  88.6  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  24.92 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1432  tyrosine recombinase XerD  24.59 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0895087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  28.16 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0752  phage integrase family site specific recombinase  25.84 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.232674  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  26.37 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1148  phage integrase family site specific recombinase  26.46 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0281308  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.44 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0735  integrase/recombinase  30.29 
 
 		 355 aa  79.7  0.00000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000138239  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  24.91 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  23.55 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3066  integrase family protein  31.33 
 
 		 390 aa  79.3  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0221886  normal  0.652565 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  22.76 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  24.27 
 
 		 292 aa  79  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2709  integrase family protein  31.1 
 
 		 210 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000251547  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  23.43 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  23.03 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  24.84 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  24.12 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.92 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0772  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.3 
 
 		 324 aa  76.3  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  26.64 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  23.3 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4540  transposase A  27.73 
 
 		 361 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1224  Tn554, transposase A  26.81 
 
 		 361 aa  75.9  0.0000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0995985  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1347  Tn554, transposase A  26.81 
 
 		 361 aa  75.9  0.0000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444384  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2506  transposase A  26.81 
 
 		 361 aa  75.9  0.0000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  22.61 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1751  phage integrase family protein  26.81 
 
 		 361 aa  75.9  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.252007  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0043  phage integrase family protein  26.81 
 
 		 361 aa  75.9  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0043  phage integrase family protein  26.81 
 
 		 361 aa  75.9  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1717  phage integrase family protein  26.81 
 
 		 361 aa  75.9  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  24.92 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1716  tyrosine recombinase XerD  21.9 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.500655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.14 
 
 		 351 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.07 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  22.29 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2809  phage integrase family protein  23.6 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0177  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.36 
 
 		 323 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2501  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.2 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  0.936606 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.41 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.92 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.6 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  23.78 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.19 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1067  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.53 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.92 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0370  phage integrase family protein  26.32 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0726  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.29 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218987  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.41 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1554  integrase family protein  25.25 
 
 		 339 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.86595  decreased coverage  0.00111318 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0684  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.3 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.631001  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1227  integrase family protein  27.99 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.842173  decreased coverage  0.000216705 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  20.5 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.77 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  26.11 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0118  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.18 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.6 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.41 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0914  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.18 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1246  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.6 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  28.05 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2504  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.18 
 
 		 329 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3102  integrase family protein  23.62 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000184896  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0911  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.18 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0669  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.18 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0369  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.18 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5643  tyrosine recombinase XerD  32.12 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.776137 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0903  tyrosine recombinase XerD  22.29 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0988  tyrosine recombinase XerD  22.29 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  23 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0986  Tn554-related, transposase A  24.21 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.061254  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.28 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0553  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.77 
 
 		 329 aa  73.2  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172687  normal  0.167276 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4150  integrase family protein  22.81 
 
 		 373 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.333103 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0750  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.53 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1037  phage integrase family site specific recombinase  42.35 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.374682  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  24.14 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.6 
 
 		 299 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0426  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.64 
 
 		 321 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0358  integrase family protein  26.4 
 
 		 287 aa  72  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  22.68 
 
 		 310 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  21.05 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.28 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0523  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.02 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221654  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>