More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_26230 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  100 
 
 
225 aa  447  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  65.6 
 
 
220 aa  293  1e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  64.89 
 
 
225 aa  291  5e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  61.61 
 
 
226 aa  287  1e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  60.71 
 
 
226 aa  286  2e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  62.22 
 
 
225 aa  285  5.999999999999999e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  62.67 
 
 
225 aa  284  8e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  64.41 
 
 
242 aa  283  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  62.22 
 
 
225 aa  282  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  61.26 
 
 
228 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  59.56 
 
 
225 aa  270  1e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  61.33 
 
 
225 aa  267  8e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  60.27 
 
 
228 aa  266  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  58.22 
 
 
225 aa  264  1e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  58.3 
 
 
226 aa  262  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  61.43 
 
 
224 aa  262  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  59.28 
 
 
228 aa  260  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  58.3 
 
 
226 aa  260  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  59.19 
 
 
224 aa  259  3e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  56.19 
 
 
225 aa  244  9e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  54.67 
 
 
224 aa  239  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  56.44 
 
 
224 aa  235  4e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  56 
 
 
224 aa  235  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  56 
 
 
224 aa  234  9e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  56 
 
 
224 aa  234  9e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  56 
 
 
224 aa  234  9e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  56.44 
 
 
224 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  56 
 
 
224 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  54.67 
 
 
224 aa  232  3e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  56 
 
 
224 aa  232  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0328  Crp/FNR family transcriptional regulator  59.21 
 
 
246 aa  231  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0277272  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4286  Crp/FNR family transcriptional regulator  59.21 
 
 
241 aa  230  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  52.89 
 
 
224 aa  230  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  55.11 
 
 
224 aa  228  7e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4322  cyclic nucleotide-binding  57.52 
 
 
225 aa  223  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4762  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.08 
 
 
225 aa  223  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  hitchhiker  0.0000929699 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4388  CRP/FNR family transcriptional regulator  48.44 
 
 
225 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  43.36 
 
 
236 aa  188  5e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  42.29 
 
 
239 aa  181  1e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.84 
 
 
225 aa  161  9e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3269  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.98 
 
 
230 aa  143  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883713  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1101  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.75 
 
 
246 aa  142  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3499  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
230 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.01 
 
 
251 aa  137  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3629  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.45 
 
 
263 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
225 aa  134  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  32.11 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.49 
 
 
226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.22 
 
 
226 aa  131  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.11 
 
 
231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5052  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.11 
 
 
228 aa  128  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267336 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  34.63 
 
 
220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.31 
 
 
219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.98 
 
 
223 aa  125  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.42 
 
 
226 aa  124  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  35.65 
 
 
225 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  37.16 
 
 
214 aa  121  8e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.19 
 
 
236 aa  121  8e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.45 
 
 
225 aa  120  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.51 
 
 
228 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.37 
 
 
224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.02 
 
 
229 aa  118  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.31 
 
 
225 aa  118  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1659  cyclic nucleotide-binding  34.58 
 
 
223 aa  118  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.834954  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.44 
 
 
222 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 
223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.85 
 
 
239 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  30.24 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.39 
 
 
236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.78 
 
 
235 aa  112  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.457493  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1853  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.98 
 
 
240 aa  112  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.39 
 
 
236 aa  111  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2796  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
250 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.44 
 
 
240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.7 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.71 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2750  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.33 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000354449  normal  0.602467 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0602  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 
225 aa  109  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.628877 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.49 
 
 
226 aa  109  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.49 
 
 
254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.91 
 
 
243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2076  Crp/FNR family transcriptional regulator  35 
 
 
234 aa  108  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398696  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1262  CRP/FNR family transcriptional regulator  30 
 
 
222 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.247212  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3035  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 
224 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738115  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.28 
 
 
227 aa  107  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2928  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.4 
 
 
232 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.83 
 
 
247 aa  107  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
241 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.86 
 
 
225 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.51 
 
 
225 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.86 
 
 
226 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1592  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 
228 aa  105  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.43 
 
 
230 aa  105  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.73 
 
 
232 aa  105  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>