More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6888 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6888  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 254 aa  520  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4603  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 240 aa  102  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.488249 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2710  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 231 aa  90.1  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 238 aa  85.1  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3446  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 335 aa  79  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.843948  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0588  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4645  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3323  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  36.24 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3595  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0804  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 209 aa  72  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 220 aa  72  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1677  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.688428  normal  0.314033 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2773  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00136461  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4015  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
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NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  30.26 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0433  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 354 aa  69.3  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.425009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  27.96 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  27.96 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
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NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc0538  putative transcription regulator protein  32.45 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548249  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1699  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0964215  normal  1 
 
 
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NC_008544  Bcen2424_5974  TetR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0426648  hitchhiker  0.00085933 
 
 
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NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007509  Bcep18194_C7459  TetR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626167  normal  1 
 
 
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NC_010682  Rpic_0418  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.340149  hitchhiker  0.000146207 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
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NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
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NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 222 aa  62  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1938  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  26.92 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5299  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3508  transcriptional regulator PsrA  29.63 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4057  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  50 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 235 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2259  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3282  regulatory protein, TetR  27.7 
 
 		 238 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 216 aa  57  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3781  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2069  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.118237  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3769  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.396044  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3522  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239967  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3842  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2515  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00143422  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3483  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3211  regulatory protein, TetR  36.84 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02639  transcriptional regulator  30.65 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 189 aa  54.7  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  36.43 
 
 		 280 aa  55.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22730  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14520  Transcriptional regulator PsrA  27.71 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_003766  predicted transcriptional regulator for fatty acid degradation FadQ TetR family  30.77 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
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NC_009901  Spea_2339  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 215 aa  53.9  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.519522  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_2597  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 218 aa  53.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127933  n/a   
 
 
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NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 225 aa  53.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
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NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  38.75 
 
 		 246 aa  53.5  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_0106  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 242 aa  53.1  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
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NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  45.16 
 
 		 260 aa  52.8  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007954  Sden_2116  regulatory protein, TetR  42.62 
 
 		 214 aa  52.4  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000093152  n/a   
 
 
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NC_011138  MADE_01897  transcriptional regulator, TetR family protein  33.33 
 
 		 207 aa  52.4  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111118  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  36.14 
 
 		 227 aa  52  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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