125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0049 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0049  hypothetical protein  100 
 
 
1515 aa  2967    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1520  hypothetical protein  47.99 
 
 
1538 aa  1350    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1343  hypothetical protein  35.04 
 
 
1550 aa  932    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0048  hypothetical protein  99.27 
 
 
1510 aa  2880    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0054  hypothetical protein  84.66 
 
 
1578 aa  2462    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2678  hypothetical protein  28.69 
 
 
1501 aa  461  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3627  protein of unknown function DUF490  36.66 
 
 
2140 aa  399  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.1533 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3915  protein of unknown function DUF490  31.92 
 
 
2032 aa  392  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.411951 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2888  hypothetical protein  37.91 
 
 
1869 aa  352  4e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547557  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2845  hypothetical protein  36.04 
 
 
1276 aa  310  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.862539  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1183  hypothetical protein  35.87 
 
 
1276 aa  308  5.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6385  hypothetical protein  29.59 
 
 
1448 aa  308  7e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2622  hypothetical protein  33.53 
 
 
1276 aa  307  9.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2889  protein of unknown function DUF490  28.6 
 
 
1441 aa  307  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.913216 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1717  hypothetical protein  35.05 
 
 
1423 aa  301  6e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0158292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6778  protein of unknown function DUF490  28.6 
 
 
1530 aa  300  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4089  hypothetical protein  36.06 
 
 
1404 aa  298  8e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2993  protein of unknown function DUF490  27.93 
 
 
1463 aa  291  9e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.407315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2766  hypothetical protein  34.41 
 
 
1463 aa  289  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.70976  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4225  hypothetical protein  34.24 
 
 
1428 aa  286  3.0000000000000004e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.436488  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2388  hypothetical protein  33.75 
 
 
1451 aa  281  8e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130143  normal  0.0161246 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0244  hypothetical protein  33.11 
 
 
1206 aa  276  3e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3382  protein of unknown function DUF490  35.37 
 
 
1084 aa  257  1.0000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1002  hypothetical protein  27.26 
 
 
1487 aa  254  8.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19226  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0874  hypothetical protein  32 
 
 
1489 aa  254  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2396  hypothetical protein  30.68 
 
 
1335 aa  249  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2617  protein of unknown function DUF490  27.38 
 
 
1424 aa  245  6e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2098  hypothetical protein  37.14 
 
 
1500 aa  160  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0166  hypothetical protein  25.2 
 
 
1319 aa  157  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2200  hypothetical protein  29.88 
 
 
1396 aa  146  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.339994 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2482  hypothetical protein  27.29 
 
 
1462 aa  144  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.915526  normal  0.262243 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0383  hypothetical protein  28.37 
 
 
1395 aa  143  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4828  hypothetical protein  28.86 
 
 
1392 aa  142  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.470253  normal  0.310225 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1103  hypothetical protein  28.44 
 
 
1398 aa  135  6e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1130  hypothetical protein  30.5 
 
 
1783 aa  132  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0070  hypothetical protein  25.87 
 
 
1270 aa  132  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2904  protein of unknown function DUF490  30.94 
 
 
1937 aa  132  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125236 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2645  hypothetical protein  29.24 
 
 
1362 aa  132  6e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1561  hypothetical protein  27.51 
 
 
1406 aa  127  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.222268  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0413  protein of unknown function DUF490  24.66 
 
 
1405 aa  127  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0432  protein of unknown function DUF490  23.84 
 
 
1448 aa  122  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.883753 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0464  protein of unknown function DUF490  24.67 
 
 
1550 aa  106  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  28 
 
 
1377 aa  95.5  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  24.31 
 
 
1443 aa  74.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  35.29 
 
 
1434 aa  73.2  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  28.24 
 
 
1056 aa  71.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  29.72 
 
 
1292 aa  70.1  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  23.6 
 
 
1401 aa  69.7  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  22.57 
 
 
1226 aa  68.9  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  26.64 
 
 
1218 aa  68.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  31.11 
 
 
1453 aa  67.8  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1014  protein of unknown function DUF490  25.87 
 
 
1443 aa  65.9  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954334  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  25.17 
 
 
1184 aa  65.5  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  25.17 
 
 
1184 aa  65.5  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  23.84 
 
 
1229 aa  65.5  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2474  hypothetical protein  22.66 
 
 
1369 aa  64.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  22.11 
 
 
1221 aa  64.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3484  hypothetical protein  25.58 
 
 
1435 aa  63.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00155309  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0830  hypothetical protein  20.52 
 
 
1256 aa  63.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0579081  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0174  hypothetical protein  24.97 
 
 
1505 aa  62.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2011  hypothetical protein  25.33 
 
 
1255 aa  61.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592581  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  23.15 
 
 
1221 aa  61.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  26.88 
 
 
1243 aa  60.5  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  24.36 
 
 
1224 aa  60.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  21.92 
 
 
1308 aa  60.1  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  24.92 
 
 
1232 aa  60.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  26.67 
 
 
1448 aa  59.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  23.02 
 
 
1223 aa  59.3  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  24.17 
 
 
1226 aa  58.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  25.15 
 
 
1359 aa  57.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0852  hypothetical protein  23.17 
 
 
1375 aa  57.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1827  hypothetical protein  28.89 
 
 
1347 aa  57.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2485  hypothetical protein  25.36 
 
 
1358 aa  57.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2438  hypothetical protein  28.89 
 
 
1347 aa  57.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2443  hypothetical protein  28.89 
 
 
1347 aa  57.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.295453  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2353  hypothetical protein  25.36 
 
 
1360 aa  57.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.732619  normal  0.322584 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0706  hypothetical protein  24.11 
 
 
1372 aa  56.6  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1207  hypothetical protein  24.11 
 
 
1372 aa  56.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.420256  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2596  protein of unknown function DUF490  27.22 
 
 
1304 aa  56.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.346321 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2771  hypothetical protein  21.97 
 
 
1392 aa  56.2  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105544  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2307  hypothetical protein  24.11 
 
 
1372 aa  56.6  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2979  hypothetical protein  24.11 
 
 
1372 aa  56.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1048  hypothetical protein  24.11 
 
 
1372 aa  56.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.130543  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1054  hypothetical protein  24.11 
 
 
1372 aa  56.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.985451  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1620  hypothetical protein  24.11 
 
 
1372 aa  56.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5769  hypothetical protein  26.34 
 
 
1360 aa  55.8  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0973726  normal  0.232191 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  28.33 
 
 
1304 aa  55.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0856  hypothetical protein  24.63 
 
 
1346 aa  55.5  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.394645  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0704  protein of unknown function DUF490  24.61 
 
 
1705 aa  55.5  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2383  putative signal peptide protein  27.57 
 
 
1299 aa  54.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00682258 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  27.27 
 
 
1283 aa  55.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  22.04 
 
 
1325 aa  54.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0399  hypothetical protein  24.5 
 
 
1258 aa  54.3  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0856  hypothetical protein  23.72 
 
 
1346 aa  53.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336201  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1796  hypothetical protein  25.33 
 
 
1332 aa  53.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1688  hypothetical protein  24.18 
 
 
1664 aa  53.5  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1031  protein of unknown function DUF490  31.15 
 
 
1426 aa  53.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1509  hypothetical protein  25.39 
 
 
1664 aa  52.8  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3956  hypothetical protein  27.13 
 
 
1473 aa  52.8  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.743785 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2361  hypothetical protein  23.84 
 
 
1453 aa  52  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.284497  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>