273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_0083 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0083  putative nitrate transporter  100 
 
 
441 aa  864    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1087  putative nitrate transporter  100 
 
 
441 aa  864    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1666  putative nitrite transporter  99.77 
 
 
441 aa  863    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1250  putative nitrate transporter  100 
 
 
441 aa  864    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145167  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1755  putative nitrite transporter  99.77 
 
 
441 aa  863    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.350912  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0337  putative nitrate transporter  100 
 
 
441 aa  864    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.510799  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0244  nitrate transporter  99.77 
 
 
441 aa  863    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1343  major facilitator transporter  81.69 
 
 
441 aa  647    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.664444  normal  0.258737 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1169  nitrate transporter, putative  96.15 
 
 
441 aa  665    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0115778  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5796  major facilitator transporter  81.48 
 
 
441 aa  636    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3861  major facilitator transporter  81.25 
 
 
441 aa  635    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.490753  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4507  major facilitator transporter  81.25 
 
 
441 aa  635    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00396099  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4146  major facilitator transporter  83.1 
 
 
441 aa  631  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0582017 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4401  major facilitator transporter  80.79 
 
 
441 aa  633  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  0.0892068 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3937  major facilitator transporter  80.79 
 
 
441 aa  633  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.526617  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03167  high affinity nitrate transporter transmembrane protein  71.1 
 
 
441 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455784  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4163  major facilitator superfamily MFS_1  71.92 
 
 
440 aa  558  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5658  major facilitator transporter  71.33 
 
 
433 aa  560  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4275  major facilitator superfamily MFS_1  71.92 
 
 
440 aa  558  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0894681  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4817  nitrate transporter  70.18 
 
 
437 aa  526  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438649  normal  0.974789 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4859  major facilitator transporter  71.69 
 
 
439 aa  520  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1319  nitrate/nitrite transporter  48.6 
 
 
438 aa  414  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2773  major facilitator superfamily MFS_1  52.97 
 
 
434 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1131  major facilitator transporter  52.17 
 
 
451 aa  395  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.727558  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3052  major facilitator superfamily MFS_1  51.25 
 
 
458 aa  386  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5402  major facilitator superfamily MFS_1  47.1 
 
 
431 aa  365  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2061  major facilitator superfamily MFS_1  48.7 
 
 
436 aa  346  5e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2381  major facilitator superfamily MFS_1  46.32 
 
 
434 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26062  MFS family transporter: nitrate  37.65 
 
 
494 aa  241  2e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.177883  normal  0.675412 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2032  predicted protein  33.98 
 
 
442 aa  226  8e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688536  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26029  predicted protein  36.02 
 
 
478 aa  216  5e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000382516  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54101  predicted protein  36.85 
 
 
471 aa  214  3.9999999999999995e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.644826  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2419  major facilitator transporter  30.22 
 
 
488 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_2171  predicted protein  35.73 
 
 
439 aa  177  4e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54560  predicted protein  31.89 
 
 
526 aa  174  2.9999999999999996e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548849  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03877  Nitrate transporter  31.11 
 
 
488 aa  172  9e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1551  major facilitator transporter  30.41 
 
 
500 aa  171  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504372 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4950  nitrate permease  30.23 
 
 
493 aa  168  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3714  nitrate transporter  32.03 
 
 
491 aa  166  8e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1069  nitrite transporter  27.96 
 
 
502 aa  166  8e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0247  nitrate transporter  30.11 
 
 
489 aa  163  7e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0662  major facilitator transporter  31.86 
 
 
504 aa  160  5e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3642  nitrite transporter  28.31 
 
 
534 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.289797  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2467  nitrite transporter  28.31 
 
 
533 aa  156  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2642  nitrate transporter  30.18 
 
 
513 aa  155  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.436461 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2271  nitrate transporter  29.28 
 
 
513 aa  152  1e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1320  major facilitator transporter  37.28 
 
 
503 aa  142  8e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1022  nitrite transporter  38.39 
 
 
489 aa  138  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1813  nitrite transporter  39.05 
 
 
488 aa  137  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.920075  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1877  nitrite transporter  37.38 
 
 
488 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.108143  hitchhiker  0.00227018 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1511  nitrite transporter  36.16 
 
 
488 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2763  nitrite transporter  38.54 
 
 
489 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.178731 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1007  major facilitator transporter  37.31 
 
 
502 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0945762  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0601  MFS nitrate/nitrite transporter  38.61 
 
 
493 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3139  major facilitator superfamily transporter  38.27 
 
 
501 aa  127  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2277  nitrate transporter  36.49 
 
 
490 aa  126  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.204683 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1964  nitrate/nitrite transporter  26.68 
 
 
491 aa  125  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00399  High affinity nitrate transporter NrtBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X193]  37.26 
 
 
497 aa  117  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.155004  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2626  major facilitator transporter  32.62 
 
 
491 aa  117  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2278  cellulose-binding family II protein  33.99 
 
 
496 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0826751 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01008  Nitrate transporter (Nitrate permease) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P22152]  38.28 
 
 
507 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.685038  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3528  nitrite transporter  30.23 
 
 
525 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438078 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  26.4 
 
 
441 aa  102  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40691  predicted protein  37.27 
 
 
216 aa  99  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.464967  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 
443 aa  96.3  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  26.06 
 
 
895 aa  95.9  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  27.32 
 
 
402 aa  95.9  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  30.11 
 
 
431 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2131  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 
460 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876012  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  27.94 
 
 
905 aa  94.4  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  29.75 
 
 
431 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  25.36 
 
 
912 aa  92.4  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3626  major facilitator superfamily MFS_1  29.75 
 
 
442 aa  92.8  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  29.39 
 
 
420 aa  91.7  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2594  major facilitator transporter  30.31 
 
 
460 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.640218  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0207  major facilitator superfamily MFS_1  29.94 
 
 
506 aa  90.5  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1450  major facilitator transporter  28.18 
 
 
426 aa  88.2  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.457135  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  30.2 
 
 
421 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  30.2 
 
 
421 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  33.45 
 
 
893 aa  87.8  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  30.48 
 
 
422 aa  86.7  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5000  major facilitator transporter  29.39 
 
 
429 aa  86.7  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81482  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5686  major facilitator transporter  29.27 
 
 
459 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365364  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2515  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 
428 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1254  nitrate/nitrite transporter  31.51 
 
 
424 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 
417 aa  84  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 
438 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 
438 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1204  major facilitator transporter  31.23 
 
 
394 aa  83.6  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  27.32 
 
 
426 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  27.05 
 
 
422 aa  82.4  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  27.32 
 
 
426 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2072  major facilitator transporter  27.96 
 
 
427 aa  81.3  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314565  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1540  major facilitator family transporter  30.48 
 
 
424 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3141  major facilitator superfamily transporter  28.25 
 
 
452 aa  80.9  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1404  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 
449 aa  80.5  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.802678  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0117  nitrate/nitrite transporter  29.11 
 
 
424 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1625  major facilitator family transporter  30.48 
 
 
424 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339331  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0972  nitrite/nitrate ABC transporter transmembrane protein  29.43 
 
 
437 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.43709 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  26.92 
 
 
453 aa  79.7  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>