89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3092 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3092  Phage integrase  100 
 
 
386 aa  806  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  7.12508e-06  normal  0.602347 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3161  integrase family protein  38.31 
 
 
403 aa  243  4e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0145  integrase family protein  34.78 
 
 
363 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0766756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2577  integrase  46.19 
 
 
216 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.922481 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3235  Phage integrase  34.27 
 
 
395 aa  182  6e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1704  integrase family protein  30.71 
 
 
391 aa  175  2e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01743  normal  0.0235893 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4324  integrase family protein  31.88 
 
 
396 aa  174  3e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5056  Phage integrase  29.79 
 
 
473 aa  143  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.343108 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0697  integrase family protein  27.08 
 
 
387 aa  141  2e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2497  integrase family protein  30.69 
 
 
384 aa  129  1e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.355652 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2093  integrase family protein  28.87 
 
 
385 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.379176  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2575  Phage integrase  44.3 
 
 
147 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4084  integrase family protein  34.03 
 
 
356 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  26.69 
 
 
375 aa  83.6  6e-15  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2621  integrase family protein  28.85 
 
 
382 aa  82.4  1e-14  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  4.32273e-06  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2605  integrase family protein  28.74 
 
 
376 aa  80.1  7e-14  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0311051  normal  0.282598 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  26.83 
 
 
292 aa  65.9  1e-09  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  4.02051e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  24.55 
 
 
402 aa  61.6  2e-08  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  24.55 
 
 
401 aa  62  2e-08  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  25.08 
 
 
403 aa  61.6  2e-08  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  30.48 
 
 
357 aa  61.2  3e-08  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  28.42 
 
 
356 aa  61.2  3e-08  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  23.83 
 
 
396 aa  60.8  4e-08  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  27.4 
 
 
414 aa  59.3  1e-07  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  2.30336e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0800  Phage integrase  25.42 
 
 
369 aa  59.3  1e-07  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  31.18 
 
 
433 aa  57  6e-07  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  25.09 
 
 
293 aa  55.8  1e-06  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  20.47 
 
 
411 aa  55.8  1e-06  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  26.42 
 
 
359 aa  54.7  3e-06  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06825  integrase  23.61 
 
 
386 aa  53.9  5e-06  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  25.89 
 
 
432 aa  52.4  1e-05  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2325  phage integrase family protein  29.69 
 
 
403 aa  52.8  1e-05  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633234  hitchhiker  2.14757e-05 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  25 
 
 
367 aa  51.6  2e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2082  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25.21 
 
 
260 aa  51.6  2e-05  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  25.21 
 
 
302 aa  51.6  2e-05  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3943  integrase family protein  26.62 
 
 
433 aa  50.8  4e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  25.85 
 
 
393 aa  50.8  4e-05  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  25.2 
 
 
374 aa  50.4  6e-05  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  24.38 
 
 
297 aa  49.7  9e-05  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  24.38 
 
 
297 aa  49.7  9e-05  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  24.82 
 
 
419 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  23.83 
 
 
392 aa  49.3  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  30.11 
 
 
386 aa  49.3  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0110  integrase family protein  25.93 
 
 
324 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126491  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  30.63 
 
 
412 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3063  integrase family protein  23.81 
 
 
257 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  4.94154e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  22.3 
 
 
398 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  24.49 
 
 
434 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0036  integrase family protein  25.77 
 
 
324 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.95657  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0404  integrase family protein  20.86 
 
 
320 aa  47.4  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  8.63146e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  26.62 
 
 
391 aa  47.8  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  28.4 
 
 
407 aa  47  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  3.56379e-08 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0524  integrase family protein  22.16 
 
 
407 aa  47  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236803  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  25.52 
 
 
313 aa  46.6  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  9.66981e-10 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  21.82 
 
 
413 aa  46.6  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0021  phage integrase family protein  25.15 
 
 
324 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.135699  hitchhiker  0.00129232 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  23.48 
 
 
451 aa  46.2  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1996  bacteriophage integrase family protein  28.06 
 
 
190 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0601499  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  30.85 
 
 
411 aa  46.2  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.25151e-05  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_002950  PG0386  phage integrase family site specific recombinase  21.61 
 
 
400 aa  45.8  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5560  integrase family protein  27.04 
 
 
273 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4380  integrase family protein  23.97 
 
 
470 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2427  phage integrase family protein  25.5 
 
 
414 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  24.79 
 
 
392 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.01 
 
 
299 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  21.35 
 
 
423 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  22.67 
 
 
316 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3066  integrase family protein  24.4 
 
 
390 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0221886  normal  0.652565 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  25 
 
 
402 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02473  hypothetical protein  22.35 
 
 
409 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.36664  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  22.7 
 
 
415 aa  44.3  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02509  Fels-2 prophage protein  22.35 
 
 
409 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  21.83 
 
 
451 aa  44.3  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2905  phage integrase family protein  22.35 
 
 
436 aa  43.9  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  27.1 
 
 
397 aa  43.9  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  25.52 
 
 
402 aa  43.9  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  21.53 
 
 
343 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  26.83 
 
 
430 aa  43.5  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  23.08 
 
 
402 aa  43.5  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  4.73566e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  25.56 
 
 
417 aa  43.5  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00310  site-specific recombinase, phage integrase family protein  24.7 
 
 
429 aa  43.5  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  22.45 
 
 
390 aa  43.5  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  26.04 
 
 
377 aa  43.1  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2463  phage integrase family protein  21.21 
 
 
414 aa  43.1  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384114  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  23.08 
 
 
420 aa  43.5  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  21.53 
 
 
343 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  26.03 
 
 
346 aa  42.7  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  21.62 
 
 
393 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  23.5 
 
 
407 aa  42.7  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>