88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6388 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  100 
 
 		 170 aa  343  5e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  59.88 
 
 		 203 aa  216  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  51.74 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  50.88 
 
 		 172 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  50.29 
 
 		 172 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  50.29 
 
 		 172 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  48.54 
 
 		 181 aa  156  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1707  membrane-flanked domain-containing protein  48.54 
 
 		 172 aa  155  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  43.86 
 
 		 172 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 		 479 aa  124  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  41.67 
 
 		 181 aa  121  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1045  membrane-flanked domain protein  41.94 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0795  membrane-flanked domain-containing protein  40.36 
 
 		 175 aa  117  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  40.99 
 
 		 180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  38.29 
 
 		 189 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  32.73 
 
 		 166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  37.5 
 
 		 189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0703  hypothetical protein  38.69 
 
 		 167 aa  108  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0702  membrane-flanked domain-containing protein  37.11 
 
 		 169 aa  97.4  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  32.89 
 
 		 174 aa  95.1  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4362  membrane-flanked domain protein  38.04 
 
 		 209 aa  93.6  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00620  hypothetical protein  44.9 
 
 		 179 aa  85.9  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.970266  normal  0.067715 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0154  membrane-flanked domain protein  34.62 
 
 		 178 aa  85.9  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3493  membrane-flanked domain-containing protein  33.96 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  29.94 
 
 		 283 aa  64.7  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8563  hypothetical protein  29.25 
 
 		 252 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.010554 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1284  membrane-flanked domain-containing protein  26.19 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.935757  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  28.03 
 
 		 291 aa  61.6  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  28.03 
 
 		 170 aa  60.8  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0020  hypothetical protein  31.72 
 
 		 170 aa  60.8  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.715756  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  34.48 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4260  membrane-flanked domain protein  29.41 
 
 		 243 aa  58.2  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  33.85 
 
 		 232 aa  58.2  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0819  membrane-flanked domain protein  29.03 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00223653  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4835  membrane-flanked domain protein  33.56 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  31.54 
 
 		 255 aa  54.7  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1361  membrane-flanked domain  27.07 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.30148  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0078  hypothetical protein  29.71 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  24.29 
 
 		 227 aa  54.3  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  27.1 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3728  membrane-flanked domain protein  29.63 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.557347  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  28.32 
 
 		 219 aa  52.4  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  29.09 
 
 		 245 aa  52.8  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0847  hypothetical protein  30 
 
 		 371 aa  52  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0763  membrane-flanked domain protein  28.19 
 
 		 229 aa  51.2  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0149  membrane-flanked domain-containing protein  31.9 
 
 		 483 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.808392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2360  membrane-flanked domain protein  26.8 
 
 		 282 aa  50.8  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1685  membrane-flanked domain protein  36.71 
 
 		 186 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885926  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1403  hypothetical protein  26.28 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1602  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2068  hypothetical protein  26.22 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0824  hypothetical protein  32.89 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.332875 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  29.22 
 
 		 179 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0096  hypothetical membrane associated protein  26.22 
 
 		 180 aa  49.3  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.129963  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3541  hypothetical protein  32.61 
 
 		 176 aa  49.3  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.543439 
 
 
-
 
NC_002950  PG1471  hypothetical protein  24.16 
 
 		 155 aa  48.9  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0611  membrane-flanked domain-containing protein  29.2 
 
 		 486 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0589  membrane-flanked domain-containing protein  29.2 
 
 		 486 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0598  membrane-flanked domain-containing protein  29.2 
 
 		 474 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1656  membrane-flanked domain-containing protein  29.05 
 
 		 229 aa  48.5  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125781  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  32.14 
 
 		 247 aa  47.8  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0755  membrane-flanked domain-containing protein  34.31 
 
 		 480 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3581  membrane-flanked domain protein  30.08 
 
 		 166 aa  47.8  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111681  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0579  membrane-flanked domain-containing protein  26.92 
 
 		 153 aa  47.8  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3601  membrane-flanked domain protein  26.77 
 
 		 173 aa  47.4  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  25.3 
 
 		 513 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1511  hypothetical protein  24.49 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000724877 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0832  hypothetical protein  26.4 
 
 		 542 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0237094  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1149  membrane-flanked domain protein  38.6 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  30.99 
 
 		 541 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2893  membrane-flanked domain protein  31.62 
 
 		 643 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736686  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  24.79 
 
 		 504 aa  45.8  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3389  membrane-flanked domain protein  24.21 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0554186  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  31.03 
 
 		 575 aa  45.1  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  27.71 
 
 		 514 aa  44.7  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2524  hypothetical protein  26.4 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1949  hypothetical protein  32.91 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2654  hypothetical protein  26.4 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  32.05 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  27.68 
 
 		 486 aa  43.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  29.41 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2094  hypothetical protein  26.35 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.859623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  31.58 
 
 		 550 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2894  membrane-flanked domain protein  28.75 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.622086 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3582  membrane-flanked domain protein  30.63 
 
 		 507 aa  42  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208237  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0732  membrane-flanked domain-containing protein  22.83 
 
 		 506 aa  42  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.924823  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  30.12 
 
 		 522 aa  41.6  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1783  membrane-flanked domain protein  27.91 
 
 		 192 aa  40.8  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>