More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4882 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4882  hypothetical protein  100 
 
 		 443 aa  884    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  81.52 
 
 		 439 aa  722    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  64.86 
 
 		 449 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2433  peptidase M20  65.76 
 
 		 448 aa  575  1.0000000000000001e-163  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00897679  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3037  hypothetical protein  65.56 
 
 		 451 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2128  peptidase M20  63.64 
 
 		 446 aa  565  1e-160  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3176  hypothetical protein  65.75 
 
 		 444 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3164  hypothetical protein  65.75 
 
 		 444 aa  564  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258961  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3226  hypothetical protein  65.75 
 
 		 444 aa  564  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.236057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  62 
 
 		 450 aa  558  1e-158  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  63.43 
 
 		 442 aa  557  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3489  hypothetical protein  66.13 
 
 		 430 aa  556  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  61.99 
 
 		 442 aa  543  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2654  peptidase M20  63.66 
 
 		 443 aa  536  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  62.21 
 
 		 442 aa  532  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  62.21 
 
 		 462 aa  532  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  62.21 
 
 		 433 aa  529  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  62.44 
 
 		 452 aa  529  1e-149  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  61.45 
 
 		 440 aa  521  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  62.81 
 
 		 440 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  60.93 
 
 		 435 aa  497  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  59.3 
 
 		 432 aa  488  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2015  peptidase M20  61.26 
 
 		 442 aa  488  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  58.06 
 
 		 434 aa  485  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  56.71 
 
 		 434 aa  482  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1922  hypothetical protein  58.76 
 
 		 446 aa  484  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2253  hypothetical protein  59.58 
 
 		 441 aa  480  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  55.99 
 
 		 434 aa  478  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1474  peptidase M20  58.29 
 
 		 438 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.739931  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21030  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  58.76 
 
 		 445 aa  459  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  56.78 
 
 		 444 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03550  hypothetical protein  54.81 
 
 		 451 aa  444  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1192  hypothetical protein  53 
 
 		 439 aa  439  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0330579  normal  0.0773998 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1165  hypothetical protein  53.6 
 
 		 429 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0235842  normal  0.624672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7887  hypothetical protein  55.23 
 
 		 444 aa  432  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  0.0510662 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11770  hypothetical protein  53.58 
 
 		 441 aa  431  1e-119  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.235527  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  52.48 
 
 		 437 aa  423  1e-117  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  49.19 
 
 		 421 aa  391  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3468  hypothetical protein  51.05 
 
 		 428 aa  379  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  47.59 
 
 		 434 aa  378  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6756  hypothetical protein  47.82 
 
 		 468 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3211  peptidase M20  47.89 
 
 		 468 aa  352  7e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3665  hypothetical protein  30.59 
 
 		 478 aa  176  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  33.1 
 
 		 434 aa  176  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0248  hypothetical protein  29.47 
 
 		 469 aa  168  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34350  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  35.83 
 
 		 477 aa  167  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.174691  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4600  peptidase M20  31.3 
 
 		 473 aa  167  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1781  hypothetical protein  29.42 
 
 		 485 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1820  hypothetical protein  29.98 
 
 		 494 aa  162  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0989  hypothetical protein  27.96 
 
 		 476 aa  147  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0416  hypothetical protein  32.23 
 
 		 493 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1670  hypothetical protein  31.07 
 
 		 467 aa  146  7.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0904676  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0695  hypothetical protein  30 
 
 		 493 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1231  peptidase M20  29.82 
 
 		 485 aa  141  3e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0107  hypothetical protein  30.99 
 
 		 493 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6284  peptidase M20  30.97 
 
 		 489 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0141  hypothetical protein  29.31 
 
 		 468 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0813471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0982  hypothetical protein  30.65 
 
 		 508 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3309  hypothetical protein  28 
 
 		 472 aa  132  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0974288  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0110  hypothetical protein  29.72 
 
 		 549 aa  130  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12324  normal  0.549417 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1037  peptidase M20  32.8 
 
 		 497 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0216  hypothetical protein  29.43 
 
 		 457 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4262  hypothetical protein  29.37 
 
 		 487 aa  126  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00365  hypothetical protein  30.67 
 
 		 510 aa  126  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.44 
 
 		 413 aa  126  9e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2924  hypothetical protein  30.43 
 
 		 491 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0041  hypothetical protein  28.97 
 
 		 493 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4704  hypothetical protein  30.81 
 
 		 507 aa  117  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0146867 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3627  hypothetical protein  30.81 
 
 		 507 aa  117  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15083  predicted protein  26.74 
 
 		 374 aa  113  9e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.54 
 
 		 388 aa  107  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0450  hypothetical protein  24.68 
 
 		 477 aa  105  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000307009  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.49 
 
 		 433 aa  103  8e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1484  peptidase M20  26.19 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1265  hypothetical protein  26.04 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.729138 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4389  hypothetical protein  28.26 
 
 		 440 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1065  hypothetical protein  24.94 
 
 		 490 aa  99  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  32.93 
 
 		 396 aa  99  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1810  diaminopimelate aminotransferase  28.47 
 
 		 410 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  28.93 
 
 		 421 aa  98.6  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.84 
 
 		 395 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0748  hypothetical protein  23.96 
 
 		 465 aa  94.7  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000168707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  27.44 
 
 		 419 aa  94  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1275  diaminopimelate aminotransferase  25.7 
 
 		 415 aa  92.4  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000199982  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  31.73 
 
 		 396 aa  92  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  30.79 
 
 		 373 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10500  hypothetical protein  24.5 
 
 		 483 aa  91.3  3e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3615  hypothetical protein  26.6 
 
 		 494 aa  91.3  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0836  diaminopimelate aminotransferase  25.15 
 
 		 423 aa  90.1  6e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000246987  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0709  diaminopimelate aminotransferase  25.91 
 
 		 415 aa  90.1  7e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.123026  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0643  diaminopimelate aminotransferase  24.79 
 
 		 415 aa  89.7  8e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.166626  hitchhiker  0.00154424 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2769  peptidase M20  26.06 
 
 		 399 aa  90.1  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  25.15 
 
 		 415 aa  89.7  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  27.64 
 
 		 390 aa  89.7  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.64 
 
 		 387 aa  88.6  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02790  vacuole protein, putative  25.17 
 
 		 591 aa  88.6  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  26.26 
 
 		 397 aa  87.4  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  25.8 
 
 		 390 aa  87  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  26.22 
 
 		 407 aa  86.7  7e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  25.91 
 
 		 397 aa  86.7  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>