More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3973 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3973  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 505 aa  967    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5589  extracellular solute-binding protein  43.75 
 
 		 513 aa  354  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16230  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  35.86 
 
 		 516 aa  239  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.884302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2653  extracellular solute-binding protein  36.66 
 
 		 517 aa  225  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0051152  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0576  extracellular solute-binding protein family 5  33.81 
 
 		 533 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2073  extracellular solute-binding protein  36.85 
 
 		 517 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.610417  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6426  extracellular solute-binding protein family 5  31.1 
 
 		 529 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312111 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3332  extracellular solute-binding protein  33.4 
 
 		 517 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4497  extracellular solute-binding protein family 5  30.91 
 
 		 529 aa  196  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3559  extracellular solute-binding protein  35.47 
 
 		 526 aa  193  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2178  extracellular solute-binding protein  30.66 
 
 		 529 aa  191  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246301  normal  0.618007 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3338  extracellular solute-binding protein  33.13 
 
 		 524 aa  189  9e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0157  twin-arginine translocation pathway signal  28.96 
 
 		 545 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.695568  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0249  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.75 
 
 		 545 aa  179  8e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1543  extracellular solute-binding protein family 5  31.84 
 
 		 513 aa  178  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.397228  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2183  extracellular solute-binding protein  31.33 
 
 		 529 aa  177  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3699  extracellular solute-binding protein  30.75 
 
 		 527 aa  176  8e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1039  extracellular solute-binding protein family 5  34.69 
 
 		 503 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.78614  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2781  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 		 525 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4502  extracellular solute-binding protein family 5  29.45 
 
 		 526 aa  170  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0409  extracellular solute-binding protein  28.85 
 
 		 520 aa  169  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6276  extracellular solute-binding protein family 5  30.08 
 
 		 496 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0695772 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5666  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  29.39 
 
 		 537 aa  167  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3746  extracellular solute-binding protein family 5  28.84 
 
 		 513 aa  164  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3756  putative peptide ABC transporter, substrate- binding protein  32.71 
 
 		 514 aa  163  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279615  normal  0.332846 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6274  extracellular solute-binding protein family 5  26.48 
 
 		 511 aa  161  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0245039 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2105  extracellular solute-binding protein family 5  36.25 
 
 		 538 aa  160  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0251373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5006  extracellular solute-binding protein family 5  28.12 
 
 		 536 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.264167 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3074  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 		 536 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0483936 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2187  extracellular solute-binding protein  28.49 
 
 		 519 aa  155  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.843737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5594  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 535 aa  155  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459863  normal  0.392289 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6591  extracellular solute-binding protein  29.75 
 
 		 540 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.476219 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3635  extracellular solute-binding protein  29.09 
 
 		 515 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.014259  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6090  extracellular solute-binding protein family 5  28.74 
 
 		 538 aa  154  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5304  extracellular solute-binding protein family 5  27.65 
 
 		 536 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.85757 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6105  extracellular solute-binding protein family 5  26.84 
 
 		 518 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000312198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6279  extracellular solute-binding protein family 5  27.35 
 
 		 512 aa  153  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.334528 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0786  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.88 
 
 		 526 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6354  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 		 527 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6057  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 		 527 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0058  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 539 aa  150  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1495  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.8 
 
 		 538 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.045715  hitchhiker  0.00127227 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6444  twin-arginine translocation pathway signal  27.49 
 
 		 527 aa  150  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6277  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 		 527 aa  150  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0281814  normal  0.114415 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6679  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component  27.49 
 
 		 527 aa  150  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3169  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 		 535 aa  149  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.116403 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3525  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  28.54 
 
 		 535 aa  149  9e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1922  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  27.09 
 
 		 535 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.92103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2945  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 509 aa  149  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3816  twin-arginine translocation pathway signal  27.87 
 
 		 522 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.961587  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2844  extracellular solute-binding protein  32.13 
 
 		 534 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.922612  normal  0.415189 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5072  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 519 aa  147  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5634  extracellular solute-binding protein family 5  27.31 
 
 		 540 aa  147  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3524  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  31.87 
 
 		 534 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.413747  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  29.55 
 
 		 510 aa  144  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2843  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 		 535 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0953  extracellular solute-binding protein family 5  28.98 
 
 		 532 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3168  extracellular solute-binding protein  31.29 
 
 		 534 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1820  twin-arginine translocation pathway signal  27.8 
 
 		 527 aa  139  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.575663  normal  0.77509 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 		 522 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1749  extracellular solute-binding protein family 5  29.2 
 
 		 538 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3713  putative ABC transporter (substrate binding component)  30.18 
 
 		 516 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1086  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 523 aa  133  7.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  26.87 
 
 		 532 aa  130  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2505  extracellular solute-binding protein family 5  26.67 
 
 		 531 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4961  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 		 537 aa  128  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376726  normal  0.0265573 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  28.19 
 
 		 502 aa  127  7e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3842  extracellular solute-binding protein  29.52 
 
 		 568 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0450891  normal  0.108057 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25 
 
 		 516 aa  125  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3175  extracellular solute-binding protein family 5  28.41 
 
 		 554 aa  124  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000918408 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  29.18 
 
 		 523 aa  124  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  28.83 
 
 		 505 aa  124  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2914  extracellular solute-binding protein family 5  26.65 
 
 		 537 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0790  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.28 
 
 		 554 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2972  extracellular solute-binding protein  26.85 
 
 		 531 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2835  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 531 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.827526 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2078  extracellular solute-binding protein  27.16 
 
 		 550 aa  121  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0155484  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 		 512 aa  121  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  27.16 
 
 		 525 aa  121  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2309  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 534 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2923  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 534 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2938  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 531 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2510  extracellular solute-binding protein  32.43 
 
 		 519 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 		 511 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  26.33 
 
 		 514 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  23.73 
 
 		 535 aa  118  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0558  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 		 561 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760139  hitchhiker  0.00152331 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.42 
 
 		 531 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  26.46 
 
 		 495 aa  118  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  24.75 
 
 		 532 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3508  extracellular solute-binding protein family 5  27.21 
 
 		 508 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0424359 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 		 532 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  23.24 
 
 		 521 aa  117  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3152  extracellular solute-binding protein family 5  31.93 
 
 		 506 aa  117  6.9999999999999995e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2411  extracellular solute-binding protein family 5  25.25 
 
 		 531 aa  116  7.999999999999999e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334082  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  24.02 
 
 		 535 aa  116  8.999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  24.39 
 
 		 535 aa  116  8.999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 490 aa  116  8.999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  24.02 
 
 		 535 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6266  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  25.87 
 
 		 531 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.857663  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>