More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0661 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 205 aa  420  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  76.65 
 
 		 200 aa  315  4e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  70.94 
 
 		 215 aa  298  4e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  72.68 
 
 		 221 aa  298  5e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  69.54 
 
 		 227 aa  293  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  69.04 
 
 		 226 aa  291  4e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  68.18 
 
 		 211 aa  282  3.0000000000000004e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  69.74 
 
 		 216 aa  279  3e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  69.54 
 
 		 218 aa  276  1e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  66.83 
 
 		 231 aa  274  6e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  66.67 
 
 		 225 aa  274  6e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  66 
 
 		 218 aa  269  2e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  67.16 
 
 		 271 aa  269  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  61.69 
 
 		 212 aa  267  8e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  61.69 
 
 		 212 aa  267  8e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  61.69 
 
 		 212 aa  267  8e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  65.99 
 
 		 330 aa  266  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  64.65 
 
 		 245 aa  262  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  64.97 
 
 		 207 aa  262  3e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  65.64 
 
 		 205 aa  259  2e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  61.81 
 
 		 217 aa  258  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  62.69 
 
 		 220 aa  256  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  66.49 
 
 		 317 aa  255  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  60.71 
 
 		 197 aa  254  7e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  61.86 
 
 		 197 aa  252  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  60.68 
 
 		 215 aa  246  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  57.65 
 
 		 220 aa  231  7.000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  54.23 
 
 		 204 aa  227  7e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  55.28 
 
 		 199 aa  227  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  54.59 
 
 		 273 aa  216  2e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  32.82 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  34.17 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 222 aa  96.3  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 215 aa  95.5  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 224 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 224 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 224 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 224 aa  94  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 221 aa  94.4  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 215 aa  93.2  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 223 aa  91.3  8e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 206 aa  91.3  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 238 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 195 aa  90.5  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 212 aa  89.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 225 aa  89.4  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 212 aa  89  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  30.96 
 
 		 206 aa  88.2  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 228 aa  85.9  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 206 aa  85.5  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 214 aa  85.1  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 216 aa  84.7  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  29.63 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3827  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.31638 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  26.13 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3702  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 248 aa  68.2  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4944  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5032  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5325  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.586018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  45.88 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  45.33 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4161  putative transcriptional regulator  45 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15250  transcriptional regulator, tetR family  30 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  50.85 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19560  transcriptional regulator, tetR family  45.9 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3067  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  40.43 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  27.93 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1365  transcriptional regulator  37.65 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.575727 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>