More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1718 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1718  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  455  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.114077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4330  TetR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 244 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 244 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 245 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0051  transcriptional regulator, TetR family  42.34 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0054  transcriptional regulator, TetR family  43.6 
 
 		 250 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0162  transcription regulator protein  42.93 
 
 		 233 aa  141  9e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1778  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 250 aa  136  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677686  unclonable  0.000000000627047 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4891  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 261 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164408  normal  0.287477 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3356  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224117 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 231 aa  116  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 219 aa  101  8e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  26.07 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3860  TetR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.526451  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0622  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1426  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4295  TetR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1574  TetR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00597987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3620  TetR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2692  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
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NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  25.24 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
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NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
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NC_007492  Pfl01_0683  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000557469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5968  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.609129 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1600  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0652187  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5724  TetR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  45.45 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  24.35 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1598  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535122  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6233  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275362  normal  0.0744328 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1833  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1799  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.539023  normal  0.822653 
 
 
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NC_011988  Avi_5451  transcriptional regulator TetR family  22.6 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3641  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5348  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.130352 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2181  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 189 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000940073  n/a   
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6709  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.408759  normal  0.497229 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2064  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 213 aa  55.1  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
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NC_007493  RSP_0185  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.141931  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1818  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671958  normal  0.199135 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 243 aa  53.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3420  putative transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.908094  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6653  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.713495  normal  0.0271875 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  26.02 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2226  transcriptional regulator, TetR family  22.4 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.407434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  26.02 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3675  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1492  TetR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 239 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  24.82 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2113  TetR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 239 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.473372  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 231 aa  53.1  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0161  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 206 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1460  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  34.62 
 
 		 235 aa  53.1  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 238 aa  52.8  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3662  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3735  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal  0.477586 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0796  TetR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 239 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3699  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 220 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 125 aa  52.4  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3698  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 202 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0675  regulatory protein, TetR  27.87 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2888  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 231 aa  52.8  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465905  normal  0.0499957 
 
 
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NC_002947  PP_0594  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 247 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0201579  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_0771  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 218 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.353788  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 210 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007650  BTH_II2128  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 251 aa  52.4  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_0596  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 203 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  31.87 
 
 		 191 aa  52.4  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 189 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
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NC_009512  Pput_0634  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000435144  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_2518  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 209 aa  52  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
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NC_010338  Caul_4603  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 240 aa  52  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.488249 
 
 
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NC_008726  Mvan_4140  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 202 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.355658  normal  0.167189 
 
 
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