More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3461 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3461  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 226 aa  442  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18860  transcriptional regulator, GntR family  56.1 
 
 		 221 aa  235  4e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0812431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3706  GntR family transcriptional regulator  54.5 
 
 		 223 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2875  transcriptional regulator, GntR family  60.75 
 
 		 246 aa  225  4e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131718  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3597  transcriptional regulator, GntR family  56.25 
 
 		 222 aa  223  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7641  transcriptional regulator, GntR family  37.68 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.587839 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 226 aa  110  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5572  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 244 aa  105  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 		 231 aa  105  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 227 aa  102  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 225 aa  99.4  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0046  regulatory protein GntR, HTH  31.02 
 
 		 247 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3249  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 215 aa  95.1  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  31.1 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  32.02 
 
 		 237 aa  93.6  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 229 aa  93.6  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  31.39 
 
 		 240 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 233 aa  93.2  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 231 aa  92.8  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 238 aa  92.4  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  29.38 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  28.77 
 
 		 228 aa  89.7  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2587  transcriptional regulator, GntR family  31.94 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 216 aa  87.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 230 aa  86.7  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  31.38 
 
 		 223 aa  86.3  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4416  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 217 aa  85.9  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3327  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 250 aa  85.1  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 216 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2295  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000972767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  32.51 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0235  GntR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  31.78 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  31 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0786  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000452632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  30.93 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3321  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.216307  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3782  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416767  normal  0.193335 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8046  transcriptional regulator, GntR family  29.19 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529008  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5794  GntR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 216 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.499675 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3003  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.88449  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2458  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3658  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0813  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0050  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1334  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.164472 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02430  transcriptional regulator, GntR family  28.22 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0732513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  29.27 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3038  transcriptional regulator, GntR family  28.29 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  0.0334024 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2127  transcriptional regulator, GntR family  32.47 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1834  GntR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1030  GntR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48599  normal  0.150605 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0103  transcriptional regulator, GntR family  29.77 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 396 aa  75.1  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4135  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0544  GntR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314121  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0982  GntR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0526617 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1023  GntR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0783  transcriptional regulator, GntR family  24.88 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1891  transcriptional regulator, GntR family  25.94 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0316867  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2897  GntR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0496  transcriptional regulator, GntR family  30.46 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.50739  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  29.15 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3764  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.227003  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2899  GntR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.527875  normal  0.0122308 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>