More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0034 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
189 aa  386  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  68.62 
 
 
189 aa  265  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  49.19 
 
 
187 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  54.14 
 
 
189 aa  175  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  50.85 
 
 
195 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  55.37 
 
 
174 aa  168  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  43.48 
 
 
186 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  43.48 
 
 
186 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  41.62 
 
 
197 aa  150  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  39.13 
 
 
197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  41.4 
 
 
186 aa  137  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6956  isochorismatase-family hydrolase  40.53 
 
 
198 aa  122  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0402515  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3979  isochorismatase hydrolase  36.17 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627608  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3865  isochorismatase hydrolase  36.17 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368607  normal  0.282134 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5005  putative isochorismatase hydrolase  36.11 
 
 
189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454976  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4618  isochorismatase hydrolase  38.32 
 
 
218 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0893  isochorismatase hydrolase  34.41 
 
 
226 aa  111  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6682  isochorismatase hydrolase  38.32 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0364  putative isochorismate hydrolase  37.43 
 
 
223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4889  isochorismatase hydrolase  35.71 
 
 
211 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000690458 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0745  isochorismatase hydrolase  35.52 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00955139 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3668  isochorismatase hydrolase  35.52 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.856402 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4198  isochorismatase hydrolase  35.36 
 
 
189 aa  108  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0806995 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3421  isochorismatase hydrolase  34.78 
 
 
217 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5339  isochorismatase hydrolase  34.78 
 
 
217 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.472338  normal  0.0895037 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4947  isochorismatase hydrolase  34.78 
 
 
217 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000317708 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4372  isochorismatase hydrolase  34.62 
 
 
211 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.010386 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  36.26 
 
 
193 aa  88.2  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  32.16 
 
 
248 aa  85.5  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  32.79 
 
 
192 aa  84.7  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4714  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
196 aa  84.3  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.249873 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  34.05 
 
 
190 aa  84.3  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  32.78 
 
 
187 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  32.78 
 
 
187 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  32.78 
 
 
187 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0467  isochorismatase family protein  33.83 
 
 
190 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  34.03 
 
 
199 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  34.08 
 
 
187 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 
187 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  32.02 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  32.02 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  32.02 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0180  isochorismatase family protein  33.83 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1005  isochorismatase family protein  33.83 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  32.02 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1353  isochorismatase family protein  33.83 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1548  isochorismatase family protein  33.83 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2732  isochorismatase family protein  33.83 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2589  isochorismatase family protein  33.83 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0208  isochorismatase family protein  33.83 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  32.02 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  32.02 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  31.53 
 
 
231 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  34.62 
 
 
224 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  32.14 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  30.96 
 
 
207 aa  78.2  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2950  isochorismatase hydrolase  30.43 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  32.99 
 
 
204 aa  77.8  0.00000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 
185 aa  77.4  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  32.6 
 
 
231 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  31.75 
 
 
188 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  31.75 
 
 
188 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  31.75 
 
 
188 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  30.98 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  31.75 
 
 
188 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  31.75 
 
 
188 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0276  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 
204 aa  75.5  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  27.75 
 
 
235 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  31.52 
 
 
187 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1876  isochorismatase hydrolase  32.8 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  31.25 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  31.25 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  31.25 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  31.25 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  29.67 
 
 
213 aa  74.7  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  31.25 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  31.25 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  27.5 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3011  isochorismatase hydrolase  31.19 
 
 
235 aa  72.8  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5340  isochorismatase hydrolase  29.15 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  31.09 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  31.75 
 
 
198 aa  72  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  29.83 
 
 
244 aa  71.2  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  24.86 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1294  isochorismatase hydrolase  28.87 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  26 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  29.44 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5384  isochorismatase hydrolase  32.86 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  30.22 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  27.13 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  25.16 
 
 
227 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  27.13 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  28.8 
 
 
230 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  32.54 
 
 
258 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1993  isochorismatase hydrolase  28.33 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  30.39 
 
 
228 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  30.73 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  29.19 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>