More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3944 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C1527  secretion system regulator:Sensor component  44.58 
 
 		 920 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0140135 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1505  secretion system regulator:Sensor component  44.58 
 
 		 920 aa  702    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000630125 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3832  putative sensor histidine kinase/response regulator EsrA  98.54 
 
 		 939 aa  1805    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1949  secretion system regulator:Sensor component  44.58 
 
 		 920 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.14133  normal  0.0293966 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1490  secretion system regulator:Sensor component  44.58 
 
 		 920 aa  703    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.490223 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1779  secretion system regulator:Sensor component  44.58 
 
 		 920 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.255044  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3944  two-component sensor/regulator  100 
 
 		 891 aa  1828    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0305517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3918  multi-sensor hybrid histidine kinase  98.77 
 
 		 939 aa  1808    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1944  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.76 
 
 		 924 aa  612  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2247  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.53 
 
 		 924 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.6065  hitchhiker  0.0077102 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  35.03 
 
 		 641 aa  250  9e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.85 
 
 		 1433 aa  247  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 		 631 aa  246  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0186  histidine kinase  34.98 
 
 		 810 aa  243  1e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0915  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 		 822 aa  242  2.9999999999999997e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.51 
 
 		 929 aa  240  6.999999999999999e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1031  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.11 
 
 		 941 aa  239  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.581247  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  34.68 
 
 		 835 aa  238  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.25 
 
 		 667 aa  237  8e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.01 
 
 		 1127 aa  234  5e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  38.31 
 
 		 1060 aa  234  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1450  histidine kinase  32.37 
 
 		 785 aa  233  9e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106734  normal  0.251272 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  34.92 
 
 		 882 aa  233  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0738  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.83 
 
 		 925 aa  232  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.94 
 
 		 933 aa  232  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 		 1350 aa  231  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.05 
 
 		 724 aa  230  9e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1875  histidine kinase  33.59 
 
 		 785 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0661847  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.55 
 
 		 765 aa  229  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3840  histidine kinase  33.59 
 
 		 785 aa  229  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0989388  normal  0.369399 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  34.3 
 
 		 651 aa  226  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  32.75 
 
 		 620 aa  226  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.91 
 
 		 1120 aa  224  7e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.01 
 
 		 1229 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1040  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  33.2 
 
 		 934 aa  223  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.301921  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.07 
 
 		 764 aa  222  3e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.07 
 
 		 781 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.85 
 
 		 1195 aa  221  5e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3979  histidine kinase  29.94 
 
 		 778 aa  220  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.405731  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  33.69 
 
 		 772 aa  220  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.91 
 
 		 817 aa  219  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.95 
 
 		 633 aa  219  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2765  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  32.99 
 
 		 949 aa  219  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.266073  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1062  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.71 
 
 		 695 aa  219  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1308  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  32.99 
 
 		 949 aa  219  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00392012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2844  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  32.99 
 
 		 957 aa  219  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.436473  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1826  sensor protein TorS  33.11 
 
 		 1000 aa  218  4e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.811683  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1484  histidine kinase  30.39 
 
 		 785 aa  218  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.78 
 
 		 738 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 		 785 aa  217  9e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.64 
 
 		 827 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15460  membrane sensor hybrid histidine protein kinase  31.8 
 
 		 772 aa  214  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.361903  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.43 
 
 		 898 aa  215  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.08 
 
 		 1049 aa  214  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.19 
 
 		 907 aa  214  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.65 
 
 		 1059 aa  214  5.999999999999999e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2497  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  33.47 
 
 		 948 aa  213  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147984  normal  0.803827 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 		 939 aa  213  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3268  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  34.44 
 
 		 957 aa  213  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00176531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2456  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  33.27 
 
 		 948 aa  212  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.290959  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 		 827 aa  212  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2511  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  33.27 
 
 		 948 aa  212  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0476144 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2407  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  33.27 
 
 		 948 aa  211  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000239257  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 1436 aa  212  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.701044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2615  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  33.27 
 
 		 915 aa  212  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.544475 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3416  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.4 
 
 		 878 aa  212  3e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0577  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.47 
 
 		 1005 aa  212  3e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0920445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2946  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  30.89 
 
 		 777 aa  211  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.63 
 
 		 846 aa  211  4e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 		 936 aa  211  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0749319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.6 
 
 		 643 aa  211  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.76 
 
 		 1075 aa  211  4e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  34 
 
 		 1287 aa  211  5e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1704  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.16 
 
 		 1168 aa  211  6e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2617  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 		 554 aa  211  6e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 896 aa  209  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.75 
 
 		 1452 aa  210  1e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 		 1078 aa  209  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  35.21 
 
 		 666 aa  209  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0718  sensory box histidine kinase/response regulator  33.77 
 
 		 589 aa  208  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.97168  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 		 969 aa  208  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.41 
 
 		 1007 aa  209  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2667  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.49 
 
 		 737 aa  208  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.149434  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 		 969 aa  207  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0658  histidine kinase  31.18 
 
 		 627 aa  207  5e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  32.75 
 
 		 661 aa  206  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0634  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.69 
 
 		 1000 aa  206  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.932649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.48 
 
 		 1820 aa  206  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  32.82 
 
 		 544 aa  206  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2532  histidine kinase  32.49 
 
 		 399 aa  205  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0679268  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2101  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.12 
 
 		 678 aa  205  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.007905  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2282  histidine kinase  32.91 
 
 		 667 aa  205  3e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  32.58 
 
 		 588 aa  204  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 		 1101 aa  204  6e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000252838 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2113  PAS  33.04 
 
 		 1206 aa  204  7e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.819255  normal  0.387177 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  33.26 
 
 		 1922 aa  204  7e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  34.23 
 
 		 1028 aa  203  9e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0288  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.74 
 
 		 1141 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3040  histidine kinase  31.94 
 
 		 1053 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0526469  normal  0.364658 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.07 
 
 		 877 aa  203  9.999999999999999e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>