More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3918 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3832  putative sensor histidine kinase/response regulator EsrA  98.94 
 
 		 939 aa  1905    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1527  secretion system regulator:Sensor component  44.5 
 
 		 920 aa  729    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0140135 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1949  secretion system regulator:Sensor component  44.78 
 
 		 920 aa  729    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.14133  normal  0.0293966 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1490  secretion system regulator:Sensor component  44.67 
 
 		 920 aa  730    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.490223 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1505  secretion system regulator:Sensor component  44.5 
 
 		 920 aa  731    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000630125 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1779  secretion system regulator:Sensor component  44.5 
 
 		 920 aa  729    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.255044  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3944  two-component sensor/regulator  98.77 
 
 		 891 aa  1808    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0305517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3918  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 939 aa  1924    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1944  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.69 
 
 		 924 aa  622  1e-176  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2247  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.47 
 
 		 924 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.6065  hitchhiker  0.0077102 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  35.46 
 
 		 641 aa  251  6e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.85 
 
 		 1433 aa  250  9e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 631 aa  245  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0915  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.27 
 
 		 822 aa  245  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.18 
 
 		 929 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  34.68 
 
 		 835 aa  237  8e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.25 
 
 		 667 aa  237  8e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.35 
 
 		 1127 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  34.69 
 
 		 882 aa  237  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1450  histidine kinase  32.83 
 
 		 785 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106734  normal  0.251272 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1031  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.62 
 
 		 941 aa  235  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.581247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.92 
 
 		 827 aa  234  7.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 		 1350 aa  234  7.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0738  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.9 
 
 		 925 aa  232  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1875  histidine kinase  34.54 
 
 		 785 aa  232  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0661847  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3840  histidine kinase  34.54 
 
 		 785 aa  231  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0989388  normal  0.369399 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  37.86 
 
 		 1060 aa  230  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.88 
 
 		 724 aa  228  4e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  34.5 
 
 		 651 aa  227  8e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.19 
 
 		 1229 aa  226  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.09 
 
 		 765 aa  226  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 		 817 aa  225  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.91 
 
 		 1120 aa  225  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 		 764 aa  225  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3979  histidine kinase  30.08 
 
 		 778 aa  224  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.405731  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  29.36 
 
 		 925 aa  224  8e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.14 
 
 		 633 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  32.17 
 
 		 982 aa  223  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.05 
 
 		 767 aa  223  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.21 
 
 		 781 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  35.38 
 
 		 655 aa  222  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.03 
 
 		 1195 aa  222  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.78 
 
 		 827 aa  222  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1040  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  32.8 
 
 		 934 aa  219  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.301921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1308  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  32.51 
 
 		 949 aa  219  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00392012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2765  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  32.51 
 
 		 949 aa  219  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.266073  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1484  histidine kinase  31.3 
 
 		 785 aa  219  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2844  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  32.51 
 
 		 957 aa  219  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.436473  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.02 
 
 		 785 aa  219  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.12 
 
 		 898 aa  218  5e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.78 
 
 		 738 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0206  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.98 
 
 		 771 aa  217  7e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1436 aa  217  8e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.701044  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1826  sensor protein TorS  32.88 
 
 		 1000 aa  216  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.811683  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.41 
 
 		 907 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2946  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  31.06 
 
 		 777 aa  216  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0577  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.67 
 
 		 1005 aa  216  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0920445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.9 
 
 		 939 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15460  membrane sensor hybrid histidine protein kinase  31.79 
 
 		 772 aa  215  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.361903  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.13 
 
 		 1059 aa  215  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.95 
 
 		 936 aa  214  7.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0749319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.63 
 
 		 846 aa  213  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.6 
 
 		 643 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2194  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.51 
 
 		 858 aa  213  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.857252  normal  0.467192 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2617  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.47 
 
 		 554 aa  213  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.08 
 
 		 1049 aa  212  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.93 
 
 		 1452 aa  212  3e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3895  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.34 
 
 		 920 aa  212  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.750763  normal  0.625428 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 		 827 aa  212  3e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2511  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  32.79 
 
 		 948 aa  211  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0476144 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.16 
 
 		 1075 aa  211  6e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.81 
 
 		 969 aa  211  7e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2835  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.48 
 
 		 964 aa  211  7e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.106901  decreased coverage  0.00127572 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0718  sensory box histidine kinase/response regulator  33.33 
 
 		 589 aa  211  8e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.97168  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.39 
 
 		 1287 aa  210  8e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3416  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.2 
 
 		 878 aa  210  9e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 896 aa  210  9e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2456  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  32.79 
 
 		 948 aa  210  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.290959  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2407  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  32.79 
 
 		 948 aa  210  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000239257  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2615  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  32.79 
 
 		 915 aa  210  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.544475 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3268  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  34.23 
 
 		 957 aa  210  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00176531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  35.21 
 
 		 666 aa  210  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.12 
 
 		 1820 aa  209  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  32.82 
 
 		 544 aa  209  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  33.64 
 
 		 661 aa  208  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  31.06 
 
 		 588 aa  208  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.41 
 
 		 1007 aa  208  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1062  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 		 695 aa  208  5e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1047  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.08 
 
 		 952 aa  207  6e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.017027  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.6 
 
 		 1078 aa  207  8e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2101  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.36 
 
 		 678 aa  207  9e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.007905  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0634  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 		 1000 aa  206  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.932649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0288  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.74 
 
 		 1141 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  31.7 
 
 		 620 aa  206  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.3 
 
 		 995 aa  205  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1704  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.97 
 
 		 1168 aa  205  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  34.46 
 
 		 1028 aa  205  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2667  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.95 
 
 		 737 aa  205  3e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.149434  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3040  histidine kinase  31.94 
 
 		 1053 aa  205  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0526469  normal  0.364658 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3508  sensor histidine kinase  33.26 
 
 		 729 aa  205  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>