266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1255 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1255  regulatory protein GntR, HTH  100 
 
 		 122 aa  244  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  64.66 
 
 		 223 aa  133  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  62.73 
 
 		 231 aa  108  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 218 aa  101  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  38.02 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  40.83 
 
 		 221 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2908  GntR family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3004  transcriptional regulator  37.17 
 
 		 218 aa  67.4  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.729807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 218 aa  67  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  35.54 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 221 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  37.6 
 
 		 223 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  37.6 
 
 		 223 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1381  transcriptional regulator, GntR family  39.67 
 
 		 223 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2445  transcriptional regulator, GntR family  34.71 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  33.06 
 
 		 230 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  33.06 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  32.84 
 
 		 230 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  35.54 
 
 		 231 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  34.55 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4801  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 254 aa  57.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0205444  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  33.61 
 
 		 248 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 248 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5373  transcriptional regulator GntR family  35.04 
 
 		 216 aa  57.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 214 aa  57.4  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  33.61 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5660  transcriptional regulator GntR family  33.63 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495941  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  32.09 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  32.74 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  36.19 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  34.31 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 234 aa  53.9  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 244 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3327  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 250 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4792  GntR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 240 aa  52.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.815698  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6033  transcriptional regulator, GntR family  31.93 
 
 		 239 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2268  GntR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 239 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 225 aa  53.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4691  GntR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 233 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517604  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  33.02 
 
 		 241 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 241 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3622  GntR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 239 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1244  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 229 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4473  transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 		 224 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.729614 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 226 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 230 aa  52.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 243 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6458  transcriptional regulator, GntR family  30.97 
 
 		 216 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.467399  normal  0.135131 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 219 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  34.51 
 
 		 225 aa  52  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7256  transcriptional regulator, GntR family  39.66 
 
 		 218 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0660662  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 235 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  32.77 
 
 		 218 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0845  GntR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 231 aa  51.2  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 229 aa  51.2  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 244 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  38.18 
 
 		 237 aa  50.8  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 242 aa  50.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0584  transcriptional regulator, GntR family  34.45 
 
 		 231 aa  50.4  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.525368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 241 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  35.85 
 
 		 221 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 219 aa  50.1  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 228 aa  50.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3038  transcriptional regulator, GntR family  32.08 
 
 		 226 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  0.0334024 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 231 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3619  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 239 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00335274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  32.76 
 
 		 233 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1712  transcriptional regulator, GntR family  32.46 
 
 		 204 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  29.91 
 
 		 263 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  31.78 
 
 		 225 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4345  GntR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 242 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 229 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3723  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 216 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.504621 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1839  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 230 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  28.97 
 
 		 263 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 227 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1030  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 237 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48599  normal  0.150605 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 233 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  31.78 
 
 		 230 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4670  GntR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 239 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  31.07 
 
 		 256 aa  47.8  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 242 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1420  GntR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 236 aa  47.8  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>