More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4438 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4438  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  662    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1691  hypothetical protein  51.65 
 
 		 330 aa  329  4e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1693  hypothetical protein  53.09 
 
 		 341 aa  307  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4478  hypothetical protein  53.33 
 
 		 329 aa  307  2.0000000000000002e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.23415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2127  hypothetical protein  53.36 
 
 		 336 aa  304  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371691  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0357  hypothetical protein  52.03 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2846  hypothetical protein  53.82 
 
 		 336 aa  298  7e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.716229  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2815  hypothetical protein  50.84 
 
 		 346 aa  296  3e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222499  hitchhiker  0.00000272153 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3523  hypothetical protein  52.82 
 
 		 336 aa  293  3e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3895  hypothetical protein  48.39 
 
 		 342 aa  289  4e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4521  hypothetical protein  47.35 
 
 		 338 aa  259  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.843645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  36.72 
 
 		 328 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  35.06 
 
 		 331 aa  196  6e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  36.94 
 
 		 327 aa  196  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  35.06 
 
 		 331 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  35.45 
 
 		 331 aa  192  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  37.69 
 
 		 337 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  36.91 
 
 		 327 aa  189  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  37.25 
 
 		 330 aa  189  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3010  twin-arginine translocation pathway signal  39.03 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.369682 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  36.43 
 
 		 335 aa  186  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  37.12 
 
 		 324 aa  185  9e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3448  hypothetical protein  36.33 
 
 		 360 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  36.22 
 
 		 328 aa  183  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  33.64 
 
 		 324 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  33.89 
 
 		 335 aa  182  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  35.76 
 
 		 330 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  36.51 
 
 		 328 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  36.33 
 
 		 327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1680  hypothetical protein  38.31 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0124  twin-arginine translocation pathway signal  37.85 
 
 		 335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.538689 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  36.33 
 
 		 325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5175  hypothetical protein  36.7 
 
 		 332 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573585  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2443  hypothetical protein  37.09 
 
 		 339 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.241679 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  36.45 
 
 		 335 aa  179  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5491  extra-cytoplasmic solute receptor  36.91 
 
 		 321 aa  179  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  33.43 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  37.3 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  36.91 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  32.01 
 
 		 322 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1120  hypothetical protein  36.05 
 
 		 317 aa  177  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.432341 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  33.56 
 
 		 325 aa  176  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  34.67 
 
 		 337 aa  176  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  34.56 
 
 		 325 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  34.55 
 
 		 330 aa  176  5e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  34.23 
 
 		 337 aa  176  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  34.55 
 
 		 330 aa  176  5e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  34.59 
 
 		 331 aa  175  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3604  hypothetical protein  35.22 
 
 		 356 aa  175  9e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  36.36 
 
 		 327 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2198  hypothetical protein  34.45 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000306315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1908  hypothetical protein  39.4 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.865584  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3897  hypothetical protein  35.62 
 
 		 332 aa  174  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0101322  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2042  hypothetical protein  36.75 
 
 		 323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  37.54 
 
 		 326 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2039  hypothetical protein  35.35 
 
 		 322 aa  173  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.40361  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  37.46 
 
 		 366 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  32.02 
 
 		 336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  34.83 
 
 		 335 aa  173  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  34.83 
 
 		 335 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3510  hypothetical protein  36.88 
 
 		 332 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1399  hypothetical protein  34.37 
 
 		 339 aa  172  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  34.55 
 
 		 324 aa  172  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1400  hypothetical protein  35.6 
 
 		 337 aa  172  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  35.25 
 
 		 324 aa  172  7.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4803  hypothetical protein  35.37 
 
 		 474 aa  172  9e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1820  hypothetical protein  39.2 
 
 		 328 aa  172  9e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.939306 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  37.12 
 
 		 328 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  35.74 
 
 		 334 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  32.34 
 
 		 324 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  32.11 
 
 		 328 aa  171  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  33.03 
 
 		 324 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  35.86 
 
 		 349 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  34.34 
 
 		 331 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  34.6 
 
 		 335 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  33.11 
 
 		 334 aa  169  6e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4625  hypothetical protein  35.66 
 
 		 327 aa  169  7e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3049  hypothetical protein  34.23 
 
 		 330 aa  169  8e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.131227 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  34.92 
 
 		 348 aa  169  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  35.15 
 
 		 304 aa  168  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3512  hypothetical protein  32.87 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543672  normal  0.304228 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  35.03 
 
 		 349 aa  168  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1233  hypothetical protein  36.33 
 
 		 379 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  35.25 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  35.6 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  34.83 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  35.71 
 
 		 344 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  35.79 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  32.67 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0039  hypothetical protein  34.94 
 
 		 324 aa  168  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  32.72 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4101  extra-cytoplasmic solute receptor  32.73 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0889008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4980  hypothetical protein  33.45 
 
 		 321 aa  168  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.790818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0164  hypothetical protein  34.56 
 
 		 332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1162  hypothetical protein  33.22 
 
 		 330 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3697  hypothetical protein  33.12 
 
 		 334 aa  166  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583429  normal  0.151066 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4308  hypothetical protein  34.22 
 
 		 343 aa  166  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41466 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4537  hypothetical protein  33.45 
 
 		 319 aa  166  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000308592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2926  hypothetical protein  33.44 
 
 		 323 aa  166  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.949785 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  33.22 
 
 		 326 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>