More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0357 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0357  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  654    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2127  hypothetical protein  67.57 
 
 		 336 aa  457  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371691  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2815  hypothetical protein  65.31 
 
 		 346 aa  441  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222499  hitchhiker  0.00000272153 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2846  hypothetical protein  57.62 
 
 		 336 aa  348  9e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.716229  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1691  hypothetical protein  54.38 
 
 		 330 aa  347  1e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4478  hypothetical protein  56.33 
 
 		 329 aa  345  8e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.23415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3523  hypothetical protein  56.95 
 
 		 336 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1693  hypothetical protein  51.31 
 
 		 341 aa  317  3e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3895  hypothetical protein  52 
 
 		 342 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4438  hypothetical protein  51.86 
 
 		 338 aa  298  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4521  hypothetical protein  46.6 
 
 		 338 aa  281  8.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.843645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  42.81 
 
 		 327 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  42.68 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  38.61 
 
 		 335 aa  222  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  36.31 
 
 		 331 aa  209  5e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  36.31 
 
 		 331 aa  208  8e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  36.75 
 
 		 335 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  38.96 
 
 		 327 aa  202  6e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0836  hypothetical protein  39.27 
 
 		 340 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00999725  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2198  hypothetical protein  38.58 
 
 		 331 aa  199  5e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000306315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  38.53 
 
 		 326 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  39.58 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  35 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4752  twin-arginine translocation pathway signal  38.02 
 
 		 333 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417694  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  39.58 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  38.67 
 
 		 327 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  39.38 
 
 		 331 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  38.11 
 
 		 324 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  38.39 
 
 		 333 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  36.2 
 
 		 325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  34.25 
 
 		 335 aa  189  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  36.36 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  38.11 
 
 		 325 aa  186  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  37.08 
 
 		 328 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  35.2 
 
 		 330 aa  186  5e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  36.25 
 
 		 337 aa  186  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  36.56 
 
 		 336 aa  185  8e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  36.51 
 
 		 336 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  36.21 
 
 		 330 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5824  extra-cytoplasmic solute receptor  35.53 
 
 		 330 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1449  twin-arginine translocation pathway signal  36.22 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0404058  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  36.5 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  35.15 
 
 		 346 aa  183  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  36.81 
 
 		 335 aa  183  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  34.95 
 
 		 327 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  34.15 
 
 		 327 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  36.05 
 
 		 328 aa  182  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  38.67 
 
 		 323 aa  182  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  36.45 
 
 		 331 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3347  hypothetical protein  33.65 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  34.35 
 
 		 331 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  37.94 
 
 		 356 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  33.53 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1399  hypothetical protein  35.94 
 
 		 339 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3697  hypothetical protein  35.69 
 
 		 334 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583429  normal  0.151066 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  33.44 
 
 		 324 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  33.94 
 
 		 331 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0363  hypothetical protein  36.76 
 
 		 322 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  33.77 
 
 		 331 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  36.61 
 
 		 349 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  36.16 
 
 		 333 aa  179  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  34.76 
 
 		 326 aa  180  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  34.66 
 
 		 328 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  34.85 
 
 		 339 aa  179  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  37.58 
 
 		 337 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2871  hypothetical protein  37.83 
 
 		 305 aa  179  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0230  hypothetical protein  33.76 
 
 		 325 aa  179  7e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.297897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  35.71 
 
 		 325 aa  179  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  35.2 
 
 		 325 aa  179  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  34.31 
 
 		 332 aa  179  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3010  twin-arginine translocation pathway signal  36.53 
 
 		 334 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.369682 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  35.31 
 
 		 351 aa  179  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  37.71 
 
 		 321 aa  179  8e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2039  hypothetical protein  37.46 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.40361  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3049  hypothetical protein  35.55 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.131227 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  36.86 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  33.23 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  35.71 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0971  twin-arginine translocation pathway signal  34.73 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.694014  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2562  hypothetical protein  37.35 
 
 		 330 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2443  hypothetical protein  35.41 
 
 		 339 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.241679 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0983  hypothetical protein  34.98 
 
 		 339 aa  177  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  37.2 
 
 		 337 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  36.7 
 
 		 326 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4309  hypothetical protein  35.37 
 
 		 336 aa  176  5e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4611  hypothetical protein  33.99 
 
 		 349 aa  176  6e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  37.33 
 
 		 327 aa  176  7e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2897  hypothetical protein  35.76 
 
 		 328 aa  176  7e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0127604 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0350  hypothetical protein  36.14 
 
 		 336 aa  176  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4803  hypothetical protein  34.55 
 
 		 474 aa  175  8e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1006  twin-arginine translocation pathway signal  34.5 
 
 		 333 aa  175  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  35.69 
 
 		 330 aa  175  9e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  35.74 
 
 		 324 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  34.47 
 
 		 327 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  34.47 
 
 		 325 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  35.4 
 
 		 328 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  33.85 
 
 		 324 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5654  hypothetical protein  36.13 
 
 		 308 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127285  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1120  hypothetical protein  33.22 
 
 		 317 aa  174  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.432341 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1021  hypothetical protein  35.55 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.345353  normal  0.559311 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>