More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1693 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1693  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  671    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2846  hypothetical protein  63.96 
 
 		 336 aa  390  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.716229  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3523  hypothetical protein  63.31 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1691  hypothetical protein  65.08 
 
 		 330 aa  386  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4478  hypothetical protein  62.15 
 
 		 329 aa  374  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.23415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3895  hypothetical protein  58.86 
 
 		 342 aa  355  5e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2127  hypothetical protein  52.36 
 
 		 336 aa  315  7e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371691  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0357  hypothetical protein  51.35 
 
 		 325 aa  314  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2815  hypothetical protein  52.36 
 
 		 346 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222499  hitchhiker  0.00000272153 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4438  hypothetical protein  53.36 
 
 		 338 aa  305  7e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4521  hypothetical protein  49.17 
 
 		 338 aa  282  8.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.843645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  40.43 
 
 		 328 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  40.49 
 
 		 327 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  39.09 
 
 		 335 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  37.77 
 
 		 331 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  37.46 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  36.96 
 
 		 335 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  37.46 
 
 		 335 aa  195  7e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3697  hypothetical protein  39.53 
 
 		 334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583429  normal  0.151066 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  36.25 
 
 		 333 aa  189  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4803  hypothetical protein  38.59 
 
 		 474 aa  189  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2562  hypothetical protein  37.99 
 
 		 330 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  37.05 
 
 		 333 aa  188  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  35.53 
 
 		 337 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  37.87 
 
 		 324 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  36.77 
 
 		 314 aa  186  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  34.42 
 
 		 338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3604  hypothetical protein  36.12 
 
 		 356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3059  hypothetical protein  37.22 
 
 		 329 aa  184  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.0348816 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  36.79 
 
 		 328 aa  184  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  33.75 
 
 		 325 aa  183  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  35.23 
 
 		 330 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  35.23 
 
 		 330 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  35.42 
 
 		 334 aa  183  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3599  hypothetical protein  40.94 
 
 		 343 aa  182  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.373831  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1686  hypothetical protein  36.67 
 
 		 331 aa  182  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.893749  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  35.58 
 
 		 328 aa  182  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  36.05 
 
 		 321 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0822  hypothetical protein  38.56 
 
 		 375 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  36.05 
 
 		 321 aa  181  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  36.42 
 
 		 337 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  35.02 
 
 		 339 aa  179  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  36.12 
 
 		 333 aa  179  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  36.67 
 
 		 327 aa  179  8e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3448  hypothetical protein  34.68 
 
 		 360 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  37.12 
 
 		 349 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  32.9 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  36.91 
 
 		 304 aa  178  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  36.12 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1233  hypothetical protein  38.21 
 
 		 379 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0350  hypothetical protein  36.7 
 
 		 336 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4969  extra-cytoplasmic solute receptor  37.67 
 
 		 364 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.332662  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  37.46 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  37.54 
 
 		 349 aa  177  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2198  hypothetical protein  37.71 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000306315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  32.69 
 
 		 331 aa  176  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  36.33 
 
 		 332 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  36.45 
 
 		 331 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1680  hypothetical protein  36 
 
 		 330 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  35.97 
 
 		 356 aa  176  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  35.76 
 
 		 326 aa  176  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  37.63 
 
 		 328 aa  176  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5386  hypothetical protein  35.57 
 
 		 324 aa  176  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  32.39 
 
 		 330 aa  176  6e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  37.82 
 
 		 325 aa  176  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  36.21 
 
 		 326 aa  175  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0485  hypothetical protein  35.37 
 
 		 333 aa  175  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  33.67 
 
 		 325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3537  hypothetical protein  33.12 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2466  hypothetical protein  36.36 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1056  hypothetical protein  36.39 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  33.96 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  36.83 
 
 		 352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3163  hypothetical protein  36.97 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  35.97 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  37.97 
 
 		 325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  34.09 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  35.22 
 
 		 348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  34.3 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  33.84 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  36.31 
 
 		 323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1400  hypothetical protein  36.14 
 
 		 337 aa  173  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1098  hypothetical protein  34.56 
 
 		 339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3593  hypothetical protein  36.33 
 
 		 328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5161  extra-cytoplasmic solute receptor  36.71 
 
 		 341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0547548 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  36.12 
 
 		 334 aa  173  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  33.54 
 
 		 331 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  34.07 
 
 		 320 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  37.73 
 
 		 330 aa  172  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5654  hypothetical protein  36.58 
 
 		 308 aa  172  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127285  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3420  hypothetical protein  36.54 
 
 		 333 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  33.63 
 
 		 335 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  35.69 
 
 		 337 aa  172  7.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  35.03 
 
 		 329 aa  172  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3894  hypothetical protein  35.09 
 
 		 327 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367386  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  36.7 
 
 		 324 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1722  hypothetical protein  37.74 
 
 		 338 aa  172  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  33.55 
 
 		 330 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2668  hypothetical protein  37.8 
 
 		 336 aa  172  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  35.24 
 
 		 326 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>