More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4478 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4478  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  652    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.23415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2846  hypothetical protein  74.19 
 
 		 336 aa  449  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.716229  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3523  hypothetical protein  73.87 
 
 		 336 aa  447  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1691  hypothetical protein  66.97 
 
 		 330 aa  435  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3895  hypothetical protein  69.36 
 
 		 342 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1693  hypothetical protein  63.67 
 
 		 341 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2815  hypothetical protein  56.62 
 
 		 346 aa  343  2e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222499  hitchhiker  0.00000272153 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0357  hypothetical protein  57.67 
 
 		 325 aa  343  2.9999999999999997e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2127  hypothetical protein  57 
 
 		 336 aa  339  2.9999999999999998e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371691  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4438  hypothetical protein  54.18 
 
 		 338 aa  304  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4521  hypothetical protein  49.17 
 
 		 338 aa  268  8.999999999999999e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.843645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  39.94 
 
 		 327 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  41.23 
 
 		 328 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  37.25 
 
 		 322 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  37.68 
 
 		 335 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  41.64 
 
 		 324 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  38.41 
 
 		 328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  39.94 
 
 		 333 aa  196  7e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2562  hypothetical protein  41.14 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  38.98 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2198  hypothetical protein  36.81 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000306315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  36.04 
 
 		 335 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  37.27 
 
 		 323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  35.79 
 
 		 330 aa  189  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  35.48 
 
 		 330 aa  189  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  35.79 
 
 		 330 aa  189  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  37.46 
 
 		 327 aa  189  7e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  37.09 
 
 		 304 aa  187  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6030  hypothetical protein  39.22 
 
 		 351 aa  186  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.053883  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  36.33 
 
 		 335 aa  186  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  37.21 
 
 		 331 aa  185  7e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  35.87 
 
 		 331 aa  186  7e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  36.09 
 
 		 330 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  36.25 
 
 		 326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  36.49 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  35.56 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  36.16 
 
 		 330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  36.27 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  36.52 
 
 		 339 aa  183  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3697  hypothetical protein  35.56 
 
 		 334 aa  183  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583429  normal  0.151066 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  37.71 
 
 		 333 aa  183  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  36.3 
 
 		 330 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  34.49 
 
 		 351 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  37.19 
 
 		 325 aa  182  6e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  37.19 
 
 		 327 aa  182  6e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2042  hypothetical protein  35.76 
 
 		 323 aa  182  9.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  35.91 
 
 		 330 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4611  hypothetical protein  36.69 
 
 		 349 aa  180  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  35.71 
 
 		 349 aa  181  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  36.12 
 
 		 334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  35.19 
 
 		 339 aa  180  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  36.46 
 
 		 321 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3580  hypothetical protein  36.91 
 
 		 336 aa  179  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082795  normal  0.0103715 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0974  hypothetical protein  36.96 
 
 		 324 aa  179  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.013055 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3059  hypothetical protein  38.41 
 
 		 329 aa  179  8e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.0348816 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3799  hypothetical protein  34.05 
 
 		 329 aa  179  8e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  35.12 
 
 		 334 aa  178  9e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  36.79 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5654  hypothetical protein  39.37 
 
 		 308 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127285  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  38.35 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  36.77 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  35.16 
 
 		 331 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  37.67 
 
 		 349 aa  177  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  37.5 
 
 		 318 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  34.8 
 
 		 327 aa  176  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  36.07 
 
 		 337 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  35.74 
 
 		 331 aa  176  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  33.85 
 
 		 328 aa  176  5e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3894  hypothetical protein  37.06 
 
 		 327 aa  176  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367386  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  37.72 
 
 		 339 aa  176  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  34.7 
 
 		 332 aa  176  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  34.41 
 
 		 346 aa  175  8e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  36.62 
 
 		 323 aa  175  8e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  32.69 
 
 		 325 aa  175  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  33.79 
 
 		 325 aa  175  9e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  33.79 
 
 		 325 aa  175  9e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  37.33 
 
 		 334 aa  175  9e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  36.3 
 
 		 325 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  36.07 
 
 		 352 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  35.49 
 
 		 325 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  31.89 
 
 		 325 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3537  hypothetical protein  33.02 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  37.46 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  35.99 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2871  hypothetical protein  36.84 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1399  hypothetical protein  32.24 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4752  twin-arginine translocation pathway signal  36.01 
 
 		 333 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417694  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  37.4 
 
 		 325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  37.16 
 
 		 325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  33.12 
 
 		 327 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6157  hypothetical protein  36.63 
 
 		 322 aa  173  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  35.35 
 
 		 327 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1233  hypothetical protein  37 
 
 		 379 aa  173  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  33.67 
 
 		 325 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  36 
 
 		 331 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  35.06 
 
 		 334 aa  172  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3347  hypothetical protein  36.08 
 
 		 330 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4444  extra-cytoplasmic solute receptor  36.63 
 
 		 323 aa  172  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.402017 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  35.17 
 
 		 336 aa  172  6.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4969  extra-cytoplasmic solute receptor  36.18 
 
 		 364 aa  172  6.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.332662  normal  0.322206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>