More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3895 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3895  hypothetical protein  100 
 
 
342 aa  677    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2846  hypothetical protein  79.4 
 
 
336 aa  481  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.716229  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3523  hypothetical protein  79.07 
 
 
336 aa  478  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4478  hypothetical protein  68.59 
 
 
329 aa  417  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.23415  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1691  hypothetical protein  66.33 
 
 
330 aa  401  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1693  hypothetical protein  59.14 
 
 
341 aa  361  9e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2815  hypothetical protein  51.04 
 
 
346 aa  326  3e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222499  hitchhiker  0.00000272153 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2127  hypothetical protein  54.3 
 
 
336 aa  325  8.000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371691  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0357  hypothetical protein  52.29 
 
 
325 aa  323  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4438  hypothetical protein  51.83 
 
 
338 aa  294  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4521  hypothetical protein  50.33 
 
 
338 aa  287  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.843645  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  42.22 
 
 
328 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  41.39 
 
 
327 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  40.31 
 
 
330 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  37.7 
 
 
330 aa  195  9e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  37.7 
 
 
330 aa  195  9e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2198  hypothetical protein  37.46 
 
 
331 aa  193  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000306315  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  38.94 
 
 
333 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  36.39 
 
 
335 aa  189  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3697  hypothetical protein  36.64 
 
 
334 aa  189  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583429  normal  0.151066 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3059  hypothetical protein  38.21 
 
 
329 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.0348816 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  39.74 
 
 
323 aa  187  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  36.16 
 
 
330 aa  186  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  36.77 
 
 
352 aa  186  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  35.86 
 
 
337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  36.84 
 
 
327 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  34.71 
 
 
334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  34.98 
 
 
325 aa  183  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  34.98 
 
 
325 aa  183  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4611  hypothetical protein  35.64 
 
 
349 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  37.03 
 
 
333 aa  182  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2562  hypothetical protein  38.6 
 
 
330 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  36.63 
 
 
304 aa  182  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  35.24 
 
 
327 aa  182  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  34.74 
 
 
326 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  33.02 
 
 
322 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3604  hypothetical protein  36.21 
 
 
356 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  35.33 
 
 
328 aa  181  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  34.24 
 
 
331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  34.94 
 
 
330 aa  180  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  34.63 
 
 
335 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  34.24 
 
 
331 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  35.09 
 
 
327 aa  178  9e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3510  hypothetical protein  37.62 
 
 
332 aa  179  9e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2871  hypothetical protein  37.83 
 
 
305 aa  179  9e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  37.18 
 
 
324 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3010  twin-arginine translocation pathway signal  37.2 
 
 
334 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.369682 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4615  hypothetical protein  33.84 
 
 
320 aa  178  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3448  hypothetical protein  34.98 
 
 
360 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  35.21 
 
 
321 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  36.79 
 
 
349 aa  177  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  36.39 
 
 
332 aa  177  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  35.97 
 
 
326 aa  177  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  33.83 
 
 
336 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  34.34 
 
 
339 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  33.65 
 
 
330 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  37.17 
 
 
337 aa  176  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  35.37 
 
 
328 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4304  hypothetical protein  38.51 
 
 
331 aa  176  7e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.618665  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2039  hypothetical protein  36.84 
 
 
322 aa  175  9e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.40361  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6277  hypothetical protein  35.18 
 
 
325 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2931  hypothetical protein  34.91 
 
 
317 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.174254  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  35.06 
 
 
326 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  36.94 
 
 
339 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1233  hypothetical protein  36.51 
 
 
379 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  33.13 
 
 
331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3799  hypothetical protein  37.68 
 
 
329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  36.09 
 
 
325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  36.09 
 
 
327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  33.99 
 
 
321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  34.42 
 
 
349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  35.55 
 
 
339 aa  173  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2443  hypothetical protein  36.57 
 
 
339 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.241679 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  34.93 
 
 
321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  34.93 
 
 
321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  34.45 
 
 
326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5551  extra-cytoplasmatic solute receptor  36.21 
 
 
322 aa  172  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  31.61 
 
 
328 aa  172  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3894  hypothetical protein  33.74 
 
 
327 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367386  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3580  hypothetical protein  35.76 
 
 
336 aa  172  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082795  normal  0.0103715 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0350  hypothetical protein  36.25 
 
 
336 aa  172  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1120  hypothetical protein  34.55 
 
 
317 aa  172  6.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.432341 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  36.21 
 
 
334 aa  172  7.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  34.11 
 
 
325 aa  172  7.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  33.43 
 
 
331 aa  172  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  35.35 
 
 
337 aa  172  9e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  33.66 
 
 
335 aa  172  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  35.71 
 
 
324 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3347  hypothetical protein  33.44 
 
 
330 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261888  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  34.23 
 
 
328 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  35.29 
 
 
328 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4444  extra-cytoplasmic solute receptor  37.38 
 
 
323 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.402017 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  33.23 
 
 
327 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  34.1 
 
 
360 aa  170  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  35.63 
 
 
340 aa  170  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2668  hypothetical protein  36.31 
 
 
336 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  33.13 
 
 
331 aa  170  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  35.25 
 
 
331 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2488  hypothetical protein  35.42 
 
 
333 aa  169  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.572284  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1680  hypothetical protein  35.2 
 
 
330 aa  169  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>