More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3604 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3604  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  718    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3448  hypothetical protein  79.5 
 
 		 360 aa  556  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0124  twin-arginine translocation pathway signal  54.3 
 
 		 335 aa  311  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.538689 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1680  hypothetical protein  50.62 
 
 		 330 aa  305  6e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0822  hypothetical protein  47.62 
 
 		 375 aa  295  8e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2519  hypothetical protein  49.32 
 
 		 324 aa  285  7e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1233  hypothetical protein  45.05 
 
 		 379 aa  278  7e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3405  hypothetical protein  49.33 
 
 		 330 aa  278  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4699  hypothetical protein  48.85 
 
 		 343 aa  278  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4060  hypothetical protein  49.33 
 
 		 334 aa  278  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.354383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1076  hypothetical protein  48.32 
 
 		 345 aa  268  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  46.8 
 
 		 327 aa  265  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  46.8 
 
 		 325 aa  265  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  45.54 
 
 		 326 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  46.23 
 
 		 327 aa  259  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1829  hypothetical protein  44.3 
 
 		 327 aa  259  7e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  45.14 
 
 		 327 aa  259  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5132  hypothetical protein  46.67 
 
 		 334 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  44.73 
 
 		 328 aa  255  9e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  42.18 
 
 		 358 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  45.03 
 
 		 304 aa  253  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3870  hypothetical protein  45.28 
 
 		 315 aa  252  7e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0646118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  47.1 
 
 		 325 aa  252  8.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  40.12 
 
 		 327 aa  251  9.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  44.52 
 
 		 339 aa  251  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  45.33 
 
 		 328 aa  250  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  44.41 
 
 		 324 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  42.99 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  45.19 
 
 		 335 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  42.76 
 
 		 330 aa  245  6.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  41.14 
 
 		 339 aa  245  9e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  40.92 
 
 		 331 aa  245  9e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  43.45 
 
 		 322 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  41.14 
 
 		 318 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  40.94 
 
 		 336 aa  245  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  43.23 
 
 		 320 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  42.77 
 
 		 327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0546  hypothetical protein  43.31 
 
 		 332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.371672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  40.74 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  42.66 
 
 		 330 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  40.97 
 
 		 310 aa  243  5e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  42.37 
 
 		 330 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  42.86 
 
 		 333 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  42.38 
 
 		 328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  43.49 
 
 		 324 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  39.75 
 
 		 331 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  41.61 
 
 		 323 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  39.08 
 
 		 325 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  45.14 
 
 		 334 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  42.71 
 
 		 335 aa  238  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  41.37 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1478  hypothetical protein  41.91 
 
 		 340 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  39.31 
 
 		 344 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  40.94 
 
 		 325 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1323  hypothetical protein  40.67 
 
 		 333 aa  237  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  43.52 
 
 		 336 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  42.17 
 
 		 322 aa  236  3e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  38.46 
 
 		 329 aa  237  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  43.05 
 
 		 335 aa  237  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  40.94 
 
 		 349 aa  235  9e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  40.06 
 
 		 326 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  43.58 
 
 		 322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  38.48 
 
 		 356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  40.67 
 
 		 345 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2834  hypothetical protein  42.9 
 
 		 327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.421115  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  41.28 
 
 		 324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  40.67 
 
 		 345 aa  233  3e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  39.87 
 
 		 331 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  40.07 
 
 		 325 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  43.43 
 
 		 331 aa  233  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  42.04 
 
 		 326 aa  233  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  39.25 
 
 		 334 aa  232  6e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  39.56 
 
 		 323 aa  232  6e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  43.43 
 
 		 328 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  39.87 
 
 		 328 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  39.62 
 
 		 332 aa  232  9e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  40.19 
 
 		 334 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6030  hypothetical protein  42.24 
 
 		 351 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.053883  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  43.54 
 
 		 323 aa  232  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  42.32 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  38.2 
 
 		 331 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  39.87 
 
 		 328 aa  231  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  43.34 
 
 		 324 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  40.19 
 
 		 336 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0350  hypothetical protein  40.48 
 
 		 336 aa  230  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  39.94 
 
 		 331 aa  230  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  40.44 
 
 		 335 aa  229  4e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  39.94 
 
 		 331 aa  230  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  40 
 
 		 328 aa  230  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2466  hypothetical protein  41.87 
 
 		 321 aa  229  6e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  41.94 
 
 		 323 aa  229  8e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  39.26 
 
 		 330 aa  229  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  40.38 
 
 		 322 aa  228  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  39.81 
 
 		 324 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6260  hypothetical protein  42.81 
 
 		 332 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  40.27 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  38.54 
 
 		 312 aa  228  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  39.62 
 
 		 326 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  40.26 
 
 		 330 aa  228  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  38.02 
 
 		 325 aa  228  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.299516 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>