More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4699 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4699  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  687    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3405  hypothetical protein  78.72 
 
 
330 aa  474  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4060  hypothetical protein  78.72 
 
 
334 aa  475  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.354383  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1076  hypothetical protein  70.53 
 
 
345 aa  426  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0822  hypothetical protein  65.02 
 
 
375 aa  406  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3448  hypothetical protein  51.68 
 
 
360 aa  309  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3604  hypothetical protein  49.33 
 
 
356 aa  296  4e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5132  hypothetical protein  46.67 
 
 
334 aa  255  8e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0124  twin-arginine translocation pathway signal  45.73 
 
 
335 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.538689 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  40.92 
 
 
336 aa  239  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1680  hypothetical protein  41.72 
 
 
330 aa  238  9e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  41.82 
 
 
328 aa  236  5.0000000000000005e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2466  hypothetical protein  40.82 
 
 
321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  43.4 
 
 
326 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  40.98 
 
 
335 aa  229  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1478  hypothetical protein  43.61 
 
 
340 aa  225  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0350  hypothetical protein  38.98 
 
 
336 aa  223  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  39.37 
 
 
328 aa  223  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2519  hypothetical protein  40.67 
 
 
324 aa  222  9e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  40.43 
 
 
322 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1829  hypothetical protein  39.1 
 
 
327 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  36.36 
 
 
344 aa  219  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  38.41 
 
 
360 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  40.81 
 
 
358 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  41.67 
 
 
323 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  37.23 
 
 
330 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  40.24 
 
 
333 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  39.63 
 
 
328 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  39.31 
 
 
332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  37.7 
 
 
345 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  39.2 
 
 
327 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6079  hypothetical protein  42.65 
 
 
327 aa  213  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  37.7 
 
 
345 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  40.68 
 
 
334 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  39.2 
 
 
325 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  41.44 
 
 
327 aa  212  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  39.37 
 
 
341 aa  213  5.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  39.93 
 
 
330 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  39.02 
 
 
326 aa  211  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  40.2 
 
 
333 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  41.12 
 
 
331 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  36.84 
 
 
339 aa  210  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  39.73 
 
 
356 aa  209  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  38.37 
 
 
331 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  39.8 
 
 
325 aa  209  7e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  37.5 
 
 
334 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  40 
 
 
336 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  39.46 
 
 
325 aa  208  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2198  hypothetical protein  37.81 
 
 
331 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000306315  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  39.46 
 
 
330 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1233  hypothetical protein  36.91 
 
 
379 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  39.02 
 
 
304 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  40.2 
 
 
324 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  38.67 
 
 
337 aa  206  6e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  39.39 
 
 
322 aa  206  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  37.38 
 
 
327 aa  205  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  39.31 
 
 
322 aa  204  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  35.69 
 
 
331 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  40.63 
 
 
321 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  38.78 
 
 
328 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  41.89 
 
 
349 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  37.54 
 
 
331 aa  204  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  38.93 
 
 
324 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  37.96 
 
 
318 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  37.54 
 
 
331 aa  204  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  37.84 
 
 
317 aa  204  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  38.44 
 
 
339 aa  204  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  37.25 
 
 
324 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3214  hypothetical protein  38.67 
 
 
323 aa  203  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2416  hypothetical protein  40.33 
 
 
323 aa  202  5e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  37.84 
 
 
317 aa  202  5e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  37.69 
 
 
698 aa  202  5e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  36.86 
 
 
340 aa  202  5e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  37.04 
 
 
336 aa  202  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5492  hypothetical protein  39.13 
 
 
329 aa  202  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  38.94 
 
 
328 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  37.13 
 
 
338 aa  202  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2753  hypothetical protein  37.66 
 
 
327 aa  202  6e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  38.64 
 
 
330 aa  202  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  41.26 
 
 
330 aa  202  8e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  41.26 
 
 
330 aa  202  8e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  38.54 
 
 
335 aa  202  8e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  35.2 
 
 
330 aa  201  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2989  hypothetical protein  40 
 
 
323 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.593529  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4449  extra-cytoplasmic solute receptor  39.62 
 
 
327 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0356205  normal  0.159319 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  39.88 
 
 
332 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2191  hypothetical protein  39.59 
 
 
312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623802  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  37.11 
 
 
333 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  38.44 
 
 
328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  36.62 
 
 
327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  38.46 
 
 
359 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  38.46 
 
 
349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  37.85 
 
 
330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  39.62 
 
 
325 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  35.81 
 
 
335 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  36.07 
 
 
346 aa  200  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3086  hypothetical protein  38.64 
 
 
332 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1145  hypothetical protein  39.56 
 
 
325 aa  199  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  35.47 
 
 
331 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1270  hypothetical protein  38.77 
 
 
323 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>